蛋白質學組翻譯后修飾分析自中而下分析策略:自中而下的蛋白質組學技術可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后,用GluC進行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜(WCX-HILIC)與配備電子轉...
蛋白質學組翻譯后修飾分析:組蛋白是一類高度保守的蛋白質,是染色質的關鍵成分,是DNA包裝的結構單位。組蛋白的功能受其翻譯后修飾介導。組蛋白翻譯后修飾包括通過絲氨酸或蘇氨酸殘基的磷酸化,賴氨酸或精氨酸的甲基化,賴氨酸的乙酰化和脫乙酰基,賴氨酸的泛素化和磺酰化等對...
轉錄組學:轉錄組學是研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態下所轉錄出所有RNA的學科,轉錄組測序是指利用高通量測序方法,研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態下所轉錄出的所有mRNA,用于揭示不同功能狀態下的基因表達、結構的差異,闡明分子機制。應用領域...
定量蛋白質組學技術:TMT定量蛋白組學技術:TMT(TandemMassTags)定量蛋白質組學技術多肽體外標記定量技術。這種技術采用多個(2-10)穩定同位素標簽,特異性標記多肽的氨基基團進行串聯質譜分析,能夠同時比較多達10種不同樣本中蛋白質的相對含量,可...
蛋白質組學發展趨勢:技術發展方面:蛋白質組學的研究方法將出現多種技術并存,各有優勢和的特點,而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發展新方法外,更強調各種方法間的整合和互補,以適應不同蛋白質的不同特征。另外,蛋白質組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要...
定量蛋白質組學技術:定量蛋白質組學技術主要分為標記(label)和非標記(labelfree)定量策略,標記策略又分為體內標記和體外標記兩種。細胞內蛋白質組豐度的動態變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發生和發展進程中,常常伴隨著某些蛋白質的表達異常...
蛋白質學組翻譯后修飾分析:組蛋白是一類高度保守的蛋白質,是染色質的關鍵成分,是DNA包裝的結構單位。組蛋白的功能受其翻譯后修飾介導。組蛋白翻譯后修飾包括通過絲氨酸或蘇氨酸殘基的磷酸化,賴氨酸或精氨酸的甲基化,賴氨酸的乙酰化和脫乙酰基,賴氨酸的泛素化和磺酰化等對...
定量蛋白質組學分析(QuantitativeProteomics)是對一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜混合體系內所有蛋白質進行精確鑒定和定量。可用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白,結合生物信息學揭示細胞生理病理等功能,同時也可對某些關鍵蛋白...
轉錄組學測序流程:1、樣品RNA準備。2、測序文庫構建。3、DNA成簇(Cluster)擴增。4、高通量測序(Illumina)。5、數據分析。轉錄組的分析大致有以下幾種情況:1、同一物種在發育過程中的各時間節點的基因表達特點及存在的差異;2、不同品系之間存在...
蛋白質翻譯后修飾組學:蛋白質翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團,可以改變蛋白質的物理、化學性質,進而影響蛋白質的空間構象和活性狀...
蛋白質組學在醫療和健康方面有什么應用?具體而言,蛋白質組學在此類應用中,更多地用于提供高通量蛋白質定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質組學:事實上,在當前的生物醫學研究和臨床診斷中,蛋白質組學相關技術有非常多的應用。因為蛋白質組學技術的本質(從分析化學角度來看)...
蛋白質乙酰化修飾組學定量分析:1. SILAC細胞標記,組織/細胞破碎,提取、提純目的蛋白質(基于SILAC的乙酰化修飾組學定量)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 對多肽片段進行iTRAQ標記(基于iTRAQ的乙酰化修飾組學定量)。4. 使用...
蛋白質學組翻譯后修飾的類型:翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成、化學修飾和肽鍵的裂解,其中磷酸化是比較常見的。蛋白質的化學修飾反應是在維持蛋白質的完整性和功能性的基礎上,通過基于其氨基酸殘基的化學反應獲得新的生物結合物。翻譯后修飾在哪...
蛋白翻譯后修飾組學技術在準確醫學中的應用:盡管目前大數據的獲得會采用基因組學和轉錄組學,但是關鍵的發現還是依賴蛋白質組數據而得到的。近來越來越多的研究表明蛋白組學驅動的準確的醫學具有極大的實用性和普適性,蛋白組學的研究更加速了臨床轉化的進程。蛋白翻譯后修飾(p...
什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的?代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究...
代謝組學樣品收集方法及所需樣本量是什么?(1) 血清樣品: 避免反復凍融。血液收集在離心管中靜置30分鐘進行凝血。8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存;單個樣本要求體積為50μL。(2) 尿液樣品:臨床樣本請全部取清晨第1...
翻譯后修飾蛋白組:翻譯后修飾蛋白組分析是指在組學水平上對存在翻譯后修飾的蛋白質進行分析。翻譯后修飾蛋白組是指細胞或組織等整體水平上的翻譯后修飾蛋白。蛋白質的翻譯后修飾(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白質在翻譯...
質譜分析乙酰化蛋白質組:質譜分析技術可以對蛋白質組中的乙酰化蛋白進行鑒定、乙酰化位點定位以及定量。當質譜用于乙酰化定量蛋白組研究中時,因為乙酰化蛋白質在生物樣本中含量低、動態范圍廣,需要先對乙酰化肽段進行富集,然后再對富集得到的乙酰化肽段樣品進行定量分析。質譜...
蛋白質組學技術:飛行時間質譜:MALDI的基本原理是將分析物分散在基質分子(尼古丁酸及其同系物)中并形成晶體,當用激光(337nm的氮激光)照射晶體時,基質分子吸收激光能量,樣品解吸附,基質-樣品之間發生電荷轉移使樣品分子電離。它從固相標本中產生離子,并在飛行...
質譜分析乙酰化蛋白質組:質譜分析技術可以對蛋白質組中的乙酰化蛋白進行鑒定、乙酰化位點定位以及定量。當質譜用于乙酰化定量蛋白組研究中時,因為乙酰化蛋白質在生物樣本中含量低、動態范圍廣,需要先對乙酰化肽段進行富集,然后再對富集得到的乙酰化肽段樣品進行定量分析。質譜...
全轉錄組測序為什么需要構建兩個文庫?全轉錄組測序需要構建2個測序文庫,一個小RNA文庫和一個去除核糖體RNA的鏈特異性文庫,然后分別上機測序。小RNA長度較短,一般小于50nt,采用測序策略為50SE。其他三類RNA序列一般大于200,通常在1000以上,可達...
代謝組學發展前景:代謝組學是繼基因組學、蛋白質組學、轉錄組學后出現的新興“組學”,每年發表的代謝組學研究的文章數量都在不斷增加。代謝組學的發展很迅速,盡管還沒有經典論文出現,但是研究人員相信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學將在臨床上發揮更大的作用。許多公...
蛋白質組學發展趨勢:1、基礎研究方面:近兩年來蛋白質組研究技術已被應用到各種生命科學領域,如細胞生物學、神經生物學等。在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍,涉及到各種重要的生物學現象,如信號轉導、細胞分化、蛋白質折疊等等。在未來的發展中...
蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率:被修飾的蛋白質的百分比低,則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識別修飾位點。棕櫚酰化蛋白...
什么是蛋白質的翻譯后修飾?蛋白質的翻譯后修飾(post-translational-modification-analysis.html)是指蛋白質在翻譯后的化學修飾。對于大部分的蛋白質來說,這是蛋白質生物合成的較后步驟。PTM是細胞信號傳導中的重要組成部分。...
什么是蛋白質的翻譯后修飾?蛋白質的翻譯后修飾(post-translational-modification-analysis.html)是指蛋白質在翻譯后的化學修飾。對于大部分的蛋白質來說,這是蛋白質生物合成的較后步驟。PTM是細胞信號傳導中的重要組成部分。...
RNA-Seq轉錄組學技術優勢:RNA-seq技術可以檢測到低水平表達、未識別的轉錄子和新拼接亞型基因。另一方面,與基因芯片相比,RNA-Seq有一個更廣的檢測動態范圍,可以研究編碼和非編碼RNA,更易于基因網絡的構建、發現選擇性剪切轉錄物,檢測到等位基因的具...
全長轉錄組學測序:由于在轉錄組研究中通常所使用的第二代測序技術具有測序讀長的限制,因此在進行測序之前,需要先將樣本的mRNA打碎為小片段,之后再通過與參考基因組比對或拼接的方式識別轉錄本,這就會造成一定的錯誤比例,同時在也很難區分單堿基水平的差異。全長轉錄組測...
定量蛋白質組學方法學介紹:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白質組學應用比較普遍的技術,該技術的關鍵原理是多肽標記和定量,將多肽的含量轉化為114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8標記...
蛋白質組的研究不但能為生命活動規律提供物質基礎,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質分子”,它們可成為新藥物設計的分子靶點,或者也會為疾病的早期診斷提供分子標...