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Label Free 非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)優(yōu)點(diǎn)：無需標(biāo)記，比較大程度的保留樣本的真實性；可以區(qū)分“有”、“無”蛋白；不受標(biāo)簽數(shù)量的限制，多個樣本可以同時進(jìn)行蛋白定量分析；不同物種和不同的樣本類型可以同時開展蛋白定量分析；處理步驟簡單，成本低。 DIA 定量...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)技術(shù)原理：首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物，然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進(jìn)行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度，然后通過高質(zhì)量的修飾類抗體和生物材料對修飾肽段進(jìn)行富集，之后上樣至液相色譜 - 串聯(lián)質(zhì)譜中進(jìn)行分析，通過相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫檢索匹配，一次...

全長轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序：由于在轉(zhuǎn)錄組研究中通常所使用的第二代測序技術(shù)具有測序讀長的限制，因此在進(jìn)行測序之前，需要先將樣本的mRNA打碎為小片段，之后再通過與參考基因組比對或拼接的方式識別轉(zhuǎn)錄本，這就會造成一定的錯誤比例，同時在也很難區(qū)分單堿基水平的差異。全長轉(zhuǎn)錄組測...

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些？1、疾病機(jī)制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機(jī)制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究。7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少？不同檢測平臺的靈敏度不一樣，靈敏度比較高，可達(dá)...

蛋白質(zhì)組學(xué)研究應(yīng)用：近年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍，涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象，如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等。生物信息學(xué)的發(fā)展已給蛋白質(zhì)組研究提供了更方便、有效的計算機(jī)分析軟件，隨著基因組...

蛋白質(zhì)組學(xué)主要以全蛋白組（組織、細(xì)胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象，通過對蛋白組進(jìn)行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學(xué)功能、作用機(jī)制、疾病診斷的標(biāo)志物以及預(yù)測蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)可以克服核酸水...

蛋白質(zhì)組學(xué)的分析介紹：蛋白質(zhì)組學(xué)的分析主要指蛋白的生信分析，依賴于數(shù)據(jù)庫的建立?，F(xiàn)在常用的蛋白質(zhì)組學(xué)生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO（gene ontology）是基因本體聯(lián)合會（Gene Onotology Consortium）所建立的數(shù)據(jù)庫...

蛋白質(zhì)組學(xué)樣品寄樣要求：動物組織的樣本蛋白量相對較高，送樣量的要求也相對比較寬松，一般提供50~100mg的量即可。此外，組織上有血跡、脂肪、結(jié)締組織的還需要用PBS和組織剪將其清理干凈。送樣前將樣品用液氮速凍5min，放置在-80℃保存，送樣時需要置于干冰環(huán)...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾加入的官能團(tuán)反應(yīng)有：1、乙?；ǔＳ诘鞍踪|(zhì)的N末端加入乙酰。2、烷基化——加入如甲基或乙基等烷基。3、甲基化——烷基化中常見的一種，在賴氨酸、精氨酸等的側(cè)鏈氨基上加入甲基。4、生物素化——用生物素附加物令保存的賴氨酸?；?。5、谷氨酸化——在...

轉(zhuǎn)錄組測序推薦的測序數(shù)據(jù)量？轉(zhuǎn)錄組測序所需數(shù)據(jù)量與所研究物種的基因組大小有關(guān)，基因組越大，則所需數(shù)據(jù)量越大。按照我們的經(jīng)驗來說：常規(guī)物種一般建議6G數(shù)據(jù)即可；基因組較大的物種推薦8G以上數(shù)據(jù)，比如：小麥建議10G數(shù)據(jù)起，甘蔗、甘薯建議至少8G數(shù)據(jù)。轉(zhuǎn)錄組測序必...

宏轉(zhuǎn)錄組分析：從以G為單位的高通量測序數(shù)據(jù)中獲取研究所需的微生物種類、基因、通路等信息是進(jìn)行宏轉(zhuǎn)錄組研究必須經(jīng)歷的一步?，F(xiàn)在網(wǎng)絡(luò)上分析組學(xué)數(shù)據(jù)的工具五花八門。能否從眾多組學(xué)工具中選擇出適合分析宏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的軟件，能否搭建一套完整、快速、高效、靈敏、高精確的宏轉(zhuǎn)...

蛋白組究竟研究原因：首先，由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在，RNA的表達(dá)量與實際對應(yīng)蛋白質(zhì)的含量相關(guān)性并不高，就簡單地測試了酵母中mRNA和對應(yīng)蛋白質(zhì)的定量相關(guān)性，結(jié)果是，低豐度蛋白與mRNA的相關(guān)性尤其低，而高豐度蛋白和其mRNA的相關(guān)性則高，經(jīng)過平均后r值只...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時應(yīng)該注意些什么問題？覆蓋率：覆蓋率越高，檢測和鑒定含有修飾基團(tuán)的肽幾率就越大。修飾位點(diǎn)的占有率：被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低，則檢測到修飾肽的機(jī)會會隨之減少。如果百分比較高（> 30％），則有助于識別修飾位點(diǎn)。棕櫚?；鞍?..

蛋白質(zhì)組學(xué)植物篇樣品寄樣要求：植物相較于動物，蛋白占比不高，所以送樣在量上面的要求會多一些，推薦送500mg以上的量可以確保實驗?zāi)軌蛱崛〉匠渥愕牡鞍?。如果是種仁、豆類等蛋白含量比較高的，200mg足以完成抽提。處理樣本需要用PBS將樣本表面的泥土等雜質(zhì)沖洗干凈...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域：海洋水產(chǎn)：生長發(fā)育機(jī)制，漁業(yè)資源，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等；微生物：致病機(jī)理，耐藥機(jī)制，病原體-宿主相互作用研究等；生物醫(yī)藥：生物標(biāo)志物，疾病機(jī)理機(jī)制，疾病分型，藥物開發(fā)，個性化醫(yī)治等；環(huán)境科學(xué)：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危害風(fēng)險評估研究...

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法：等電聚焦：等電聚焦（isoelectric focusing，IEF）是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點(diǎn)不同的蛋白質(zhì)的電泳技術(shù)。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點(diǎn)進(jìn)行分離，等電聚焦中，蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個連...

蛋白質(zhì)組學(xué)是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益，是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時代的特征。蛋白質(zhì)是生命存在和運(yùn)動的物質(zhì)基礎(chǔ)，是細(xì)胞增殖、分化、衰老和凋亡等...

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理：盡管質(zhì)譜儀器的分析能力近年來有了長足的發(fā)展，但是由于蛋白翻譯后修飾化學(xué)計量值低、復(fù)雜性大，直接將蛋白組(如全細(xì)胞裂解產(chǎn)物，組織勻漿產(chǎn)物或全血清蛋白)的酶解肽段送入質(zhì)譜鑒定和定量PTM是非常困難的。因此，很多翻譯后修飾的富集方法會被...

乙?；揎椀鞍捉M學(xué)簡介：乙?；前岩环N乙酰官能基團(tuán)添加到另一種有機(jī)化合物上，并進(jìn)行結(jié)合的過程。乙酰化也是細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的一種重要形式，其主要發(fā)生在組蛋白賴氨酸上，是由組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶 (HATs) 催化的，其反過程去乙?；山M蛋白去乙酰酶 (Histo...

4D定量蛋白質(zhì)組學(xué) ：目前，蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時間（retention time）、質(zhì)荷比（m/z）、離子強(qiáng)度（intensity）這三個維度對肽蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量，即3D蛋白質(zhì)組學(xué)。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度，離子...

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTMs）是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后的化學(xué)修飾過程。蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTMs）通過給蛋白質(zhì)添加磷酸酯、乙酸酯、酰胺基或甲基等官能團(tuán)增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性，并影響正常細(xì)胞生物學(xué)和發(fā)病機(jī)理的幾乎所有方面。蛋白質(zhì)翻譯后修飾...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析策略：早期蛋白質(zhì)組研究的大部分工作集中在細(xì)胞生長的不同時期，或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質(zhì)表達(dá)水平的變化。然而，許多生命過程不僅受蛋白質(zhì)的相對豐度控制，還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此，揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質(zhì)復(fù)雜性和多樣的...

什么是轉(zhuǎn)錄組測序？轉(zhuǎn)錄組廣義上指在某一生理條件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狹義上指所有mRNA的組合。轉(zhuǎn)錄組測序的研究對象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，主要包括mRNA和ncRNA。轉(zhuǎn)錄組...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的方法：轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門在整體水平上研究細(xì)胞中所有基因轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。在早期，由于測序價格昂貴、基因序列數(shù)目有限，轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究者只能進(jìn)行極少數(shù)特定基因的結(jié)構(gòu)功能分析和表達(dá)研究。近十幾年，分子生物學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展使高通量分析成為可能，這為真正...

什么叫轉(zhuǎn)錄組？廣義轉(zhuǎn)錄組是指生命單元(通常是一種細(xì)胞)中所有按基因信息單元轉(zhuǎn)錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個特定細(xì)胞所有轉(zhuǎn)錄本的總和.它的研究對象就是這些RNA與蛋白質(zhì)分子和它們所組成的基因功能網(wǎng)絡(luò)以及它們與細(xì)胞功能的關(guān)系.而...

蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)鑒定：蛋白質(zhì)翻譯后修飾（Post-Translational Modifications, PTMs）幾乎參與了細(xì)胞所有正常生命活動的過程，并發(fā)揮十分重要的調(diào)控作用。蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)能夠影響蛋白的多種屬性，包括蛋白質(zhì)折疊、活性以及之后的功能，對...

circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)生物學(xué)功能：circRNA主要存在于細(xì)胞質(zhì)或外泌體中，具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年，大量的研究表明circRNA在生物的生長發(fā)育、脅迫應(yīng)答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關(guān)，并預(yù)測其在疾病診斷標(biāo)記物等方面的應(yīng)...

蛋白質(zhì)組學(xué)介紹：蛋白質(zhì)組學(xué)，指對某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)及其特征進(jìn)行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究，以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動的分子網(wǎng)絡(luò)。研究的內(nèi)容主要包括：組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細(xì)胞定位和三維...

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？作為主要研究策略的蛋白質(zhì)組學(xué):這與題目中的描述更相關(guān)些，蛋白質(zhì)組學(xué)是研究中的關(guān)鍵方法(甚至是唯1方法)。具體而言，蛋白質(zhì)組學(xué)在此類應(yīng)用中，更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學(xué):事實上，在當(dāng)前的生...

單細(xì)胞 RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)的工作流程：單細(xì)胞 RNA 測序等高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)通常從針對不同瘤和組織類型（解離、分選和分離細(xì)胞等）量身定制的實驗工作流程開始，然后產(chǎn)生可以比對的序列，量化、質(zhì)量控制 (QC) 過濾和以不同方式標(biāo)準(zhǔn)化，以實現(xiàn)許多下游計算...