蛋白質乙酰化修飾定義:蛋白質在細胞中經過翻譯后,到被運輸到相應的細胞器并且發生特定的生物學作用前會經過很重要的一步加工,那就是蛋白質翻譯后修飾加工。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的活性、定位或功能。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。常見的蛋白質翻譯后修飾包括磷酸化,乙酰化,糖基化,泛素化等。蛋白質乙酰化修飾,顧名思義指的就是在蛋白質原有基礎上面嫁接上乙酰化基團。在細胞中,乙酰化修飾的反應由乙酰基轉移酶所催化,將乙酰輔酶A的乙酰基轉移并添加在蛋白質賴氨酸殘基上。在早期的研究中,乙酰化修飾一直被認為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾,直到后來研究發現原核細胞中年也存在著蛋白質乙酰化修飾。所以,乙酰化修飾是原核和真核生物所共有的一種翻譯后修飾類型。蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有靈活的特性。江蘇蛋白質丙二酰化修飾組學分析研究
蛋白質磷酸化修飾定義?在哺乳動物細胞生命周期中,大約有1/3的蛋白質發生過磷酸化修飾,在脊椎動物基因中,約有5%的基因編碼的蛋白質是參與磷酸化和去磷酸化過程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通過激發、調節諸多信號通路進而參與調控生物體的生長、發育、逆境應激、疾病發生等多種生命過程,一直是生物學研究的重點與熱點。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團(P04)轉移到不同種類的氨基酸上(主要包括絲氨酸S、蘇氨酸T、酪氨酸Y),從而使蛋白質發生翻譯后修飾的過程。杭州蛋白質翻譯后修飾組學方法蛋白質磷酸化修飾組學具有全方面性。
蛋白質學組翻譯后修飾分析:組蛋白是一類高度保守的蛋白質,是染色質的關鍵成分,是DNA包裝的結構單位。組蛋白的功能受其翻譯后修飾介導。組蛋白翻譯后修飾包括通過絲氨酸或蘇氨酸殘基的磷酸化,賴氨酸或精氨酸的甲基化,賴氨酸的乙酰化和脫乙酰基,賴氨酸的泛素化和磺酰化等對組蛋白進行的共價修飾。組蛋白這些修飾對于核完整性至關重要,因為它們可以調節染色質結構并募集參與基因調節、DNA修復和染色體濃縮的酶。組蛋白的翻譯后修飾大多位于N末端的尾巴上,因為N末端是蛋白質中比較暴露和比較靈活的區域。分析組蛋白翻譯后修飾有助于探索組蛋白修飾與染色體濃縮、DNA轉錄等生物功能之間的關系。
蛋白質泛素化修飾組學技術:泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統介導了真核生物體內80%~85%的蛋白質降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質的活性和定位,調控包括細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內的多種細胞活動。樣品要求:1、SDS-PAGE條帶:5個以上可見考染條帶。2、溶液(目標蛋白質):目標蛋白總量>50μg,目標蛋白濃度>80%。3、溶液(大規模混合蛋白質):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl。蛋白質有哪些翻譯后修飾?
蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,分析組蛋白時其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時,通常需要將被檢測蛋白質消化成3-9kDa范圍內的肽段,因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是,由于儀器的進步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術可以直接對完整的蛋白質進行測序,包括翻譯后修飾的蛋白質和其他大的蛋白質片段,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關的信息,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。自上而下技術對蛋白質的有效分辨率已達到229kDa,一次可以檢測到的蛋白質數量也在增加。自中而下的蛋白質組學技術可用于組蛋白修飾的分析。南京蛋白質亞硝基化修飾組學質譜分析
泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。江蘇蛋白質丙二酰化修飾組學分析研究
蛋白質乙酰化修飾組學定量分析:1. SILAC細胞標記,組織/細胞破碎,提取、提純目的蛋白質(基于SILAC的乙酰化修飾組學定量)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 對多肽片段進行iTRAQ標記(基于iTRAQ的乙酰化修飾組學定量)。4. 使用高效特異性乙酰化抗體對乙酰化修飾肽段進行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS對富集的乙酰化肽段進行序列分析。6. 數據分析,比對不同樣本中蛋白乙酰化修飾水平差異,并對產生變化的生物學意義進行解釋。江蘇蛋白質丙二酰化修飾組學分析研究
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