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深圳醫學蛋白質組學質譜分析

來源: 發布時間:2022-04-01

蛋白質組學在醫療和健康方面有什么應用?基于質譜的蛋白質組學是目前比較主流的高通量蛋白質研究手段,當前在醫療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉化醫學。隨著質譜、系統生物學、生物信息學等相關學科的發展,我認為今后我們會更多地在現實生活中見到蛋白質組學相關的應用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變(鐮刀形紅細胞癥)、糖化血紅蛋白比例測定等。從測試體量估計,應該遠小于1%的ELISA測試量。由于成本和通量等原因,蛋白質組學技術并不如ELISA適合大量的日常分析。但對于一些分析有問題的項目,采用基于質譜(或二維膠等手段)的蛋白質組學有獨特的技術優勢。另外,蛋白質組學方法開發和驗證周期短,在中高級特殊應用(如極少使用的特殊蛋白指標臨床檢測、未知疾病研究和控制)中也有其獨特優勢。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質分子”。深圳醫學蛋白質組學質譜分析

蛋白質組學技術:等電聚焦:等電聚焦(isoelectricfocusing,IEF)是一種利用有pH梯度的介質分離等電點不同的蛋白質的電泳技術。等電聚焦凝膠電泳依據蛋白質分子的靜電荷或等電點進行分離,等電聚焦中,蛋白質分子在含有載體兩性電解質形成的一個連續而穩定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質是脂肪族多氨基多羧酸,在電場中形成正極為酸性,負極為堿性的連續的pH梯度。蛋白質分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場中移動;當蛋白質遷移至其等電點位置時,其靜電荷數為零,在電場中不再移動,據此將蛋白質分離。上海新型修飾蛋白組學領域蛋白質組學技術有生物質譜。

LabelFree(非標記蛋白質組學技術):應用:1.需要快速在大量樣本中找到差異表達的蛋白組合。2.需要在較短時間以較低成本得到具有提示意義的蛋白表達數據。3.需要檢測的樣品蛋白含量低。4.需要檢測相互作用蛋白。技術特點:1.對質譜儀器設備要求較高,色譜和質譜需要同時有較好的穩定性和重復性。2.需要有特殊的定量分析軟件。3.對樣品中蛋白質總量要求較低,實驗周期短,實驗費用低。4.不需要額外并且昂貴的標記試劑,排除了標記過程帶入實驗誤差的風險,同時也不必考慮標記效率的問題。

蛋白質組的研究不但能為生命活動規律提供物質基礎,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質分子”,它們可成為新藥物設計的分子靶點,或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實,那些世界范圍內銷路比較好的藥物本身是蛋白質或其作用靶點為某種蛋白質分子。因此,蛋白質組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業帶來巨大的利益。蛋白質組學的研究是生命科學進入后基因時代的特征。質譜技術相較于傳統蛋白質鑒定技術而言,擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。

蛋白質組學發展趨勢:技術發展方面:蛋白質組學的研究方法將出現多種技術并存,各有優勢和的特點,而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發展新方法外,更強調各種方法間的整合和互補,以適應不同蛋白質的不同特征。另外,蛋白質組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術新方法的活水之源,特別是,蛋白質組學與其它大規模科學如基因組學,生物信息學等領域的交叉,構成組學(omics)生物技術研究方法,所呈現出的系統生物學(SystemBiology)研究模式,將成為未來生命科學比較令人激動的新前沿。蛋白質組與基因組相對應,也是一個整體的概念。Label free非標記定量蛋白質組學價格

蛋白質組隨著基因組學研究的不斷深入,蛋白質組學已逐漸成為研究熱點。深圳醫學蛋白質組學質譜分析

LabelFree(非標記蛋白質組學技術):在非標記策略的定量模型中,主要涉及兩種不同的算法:其一,以肽段的色譜峰積分面積為基礎,通過比較一對生物樣品中相對應到蛋白質酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度;其二,以肽段被質譜檢測的計數為基礎,通過歸一化來表征被檢測蛋白質的相對豐度。非標記技術認為肽段在質譜中被捕獲檢測的頻率(Counts)與其在混合物中的豐度成正相關,因此蛋白質被質譜檢測的計數反映了蛋白質的豐度,通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯系起來,從而對蛋白質進行定量。深圳醫學蛋白質組學質譜分析

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