蛋白質學組翻譯后修飾分析自中而下分析策略：自中而下的蛋白質組學技術可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同，直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后，用GluC進行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜（WCX-HILIC）與配備電子轉移解離（ETD）的高分辨率質譜聯機聯用，對樣品進行理想的分離。譜識別可以用傳統的軟件進行，但是由于估計適當的錯誤發現率的問題，需要對結果進行過濾。自上而下的技術可以直接引入完整的蛋白質并在串聯質譜儀上對其進行片段化，不需要蛋白質水解消化。目前，有兩種完全分離蛋白質的方法：離線和在線。前者用四維分離法，后者用WCX-HILIC。在細胞中，乙酰化修飾的反應由乙酰基轉移酶所催化，將乙酰輔酶A的乙酰基轉移并添加在蛋白質賴氨酸殘基上。武漢蛋白質丙二酰化修飾組學質譜分析

蛋白質磷酸化修飾組學：磷酸化蛋白質是由蛋白激酶將ATP或GTP分子上的磷酸基團轉移到底物蛋白特定的氨基酸側鏈上形成的。蛋白質磷酸化是一種可逆的蛋白質翻譯后修飾。在哺乳動物的細胞生命周期中，至少有三分之一的蛋白質發生磷酸化修飾。磷酸化修飾參與許多信號轉導途徑和細胞代謝過程，且許多已知的疾病也與蛋白質的異常磷酸化有關。因此，對磷酸化蛋白質組進行定量研究，尋找差異表達的磷酸化蛋白質，有助于發現疾病的生物標志物和尋找新的具有診療潛力的藥物靶標。杭州蛋白質丙酰化修飾組學類型蛋白質糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質上的過程。

蛋白翻譯后修飾組學技術在準確醫學中的應用：盡管目前大數據的獲得會采用基因組學和轉錄組學，但是關鍵的發現還是依賴蛋白質組數據而得到的。近來越來越多的研究表明蛋白組學驅動的準確的醫學具有極大的實用性和普適性，蛋白組學的研究更加速了臨床轉化的進程。蛋白翻譯后修飾（post-ranslational modification, PTM)賦予了蛋白種類的豐富性及蛋白功能的多樣化，研究蛋白翻譯后修飾不只可以確定蛋白修飾（磷酸化、泛素化、酰化、甲基化、SUMO化等）或蛋白酶裂解的新位點，還可以發現生物標記物及探索藥物/化學調節物的作用機制。

蛋白質學組翻譯后修飾自下而上分析策略：常用的糖蛋白分離和富集技術有：a. 凝集素親和技術；b. 肼化學富集；c. 親水性相互作用色譜法；d. β-消除/邁克爾加成反應。基于質譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點測定方法有：a. PNGase F酶法；b. Endo H酶法；c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化：泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽，在真核生物中高度保守，可通過異肽鍵與目標蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標記，泛素用親和標簽（通常為6xHis）進行標記，并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結構，經胰蛋白酶水解后，Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上，使肽的質量增加114，因此可作為泛素定位位點的質量標記。用HPLC對樣品進行預分離，使用針對特定殘留結構的抗體富集泛素化肽，可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯質譜可以鑒定泛素化位點。蛋白質乙酰化修飾，顧名思義指的就是在蛋白質原有基礎上面嫁接上乙酰化基團。

蛋白質磷酸化修飾類型：根據磷酸氨基酸殘基的不同，可將磷酸化蛋白質分為4類，即O-磷酸鹽蛋白質、N-磷酸鹽蛋白質、酰基磷酸鹽蛋白質和S-磷酸鹽蛋白質。1、O-磷酸鹽蛋白質通過羥氨基酸（如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸）的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質通過精氨酸、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成。3、 酰基磷酸鹽蛋白質通過天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸鹽蛋白質通過半胱氨酸磷酸化形成。蛋白質磷酸化修飾鑒定方法：免疫印跡技術是在凝膠電泳和固相免疫測定技術基礎上發展起來的、根據特定抗原-抗體的特異性反應來檢測復雜樣品中的某種蛋白質的免疫生化分析方法。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。杭州蛋白質丙酰化修飾組學類型

蛋白質翻譯后修飾是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程。武漢蛋白質丙二酰化修飾組學質譜分析

質譜分析乙酰化蛋白質組：質譜分析技術可以對蛋白質組中的乙酰化蛋白進行鑒定、乙酰化位點定位以及定量。當質譜用于乙酰化定量蛋白組研究中時，因為乙酰化蛋白質在生物樣本中含量低、動態范圍廣，需要先對乙酰化肽段進行富集，然后再對富集得到的乙酰化肽段樣品進行定量分析。質譜定量乙酰化蛋白組采用肽段預分離降低高豐度蛋白的影響，結合免疫共沉淀通過高效的抗體富集乙酰化的肽段，從而實現大規模乙酰化的鑒定及定量。為了鑒定和定量更多的乙酰化肽段，在酶切過程中還可使用多種不同的酶對蛋白樣品進行酶切。武漢蛋白質丙二酰化修飾組學質譜分析

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