代謝組學發展前景:代謝組學是繼基因組學、蛋白質組學、轉錄組學后出現的新興“組學”,每年發表的代謝組學研究的文章數量都在不斷增加。代謝組學的發展很迅速,盡管還沒有經典論文出現,但是研究人員相信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學將在臨床上發揮更大的作用。許多公司通過市場研究發現,健康人并不希望進行基因型分析,所以,對于這些人群來說,基因組學研究在臨床上的應用很有限。而代謝組學與臨床化學較為相似,且相對于基因組學來說,提供的個人信息更少,故其在臨床上的應用有可能產生一定的影響。與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學將在臨床上發揮更大的作用。江蘇植物靶向代謝組學方法
代謝組學如何控制臨床樣本的質量?對于臨床的樣本建議每組比較低的25個生物學重復,達到30例以上比較好。因為臨床樣本受外界環境和遺傳背景影響較大,需要很多生物學重復來消除這些外在影響。此外,在樣本收集過程中,應保持收養的時間段和操作程序盡可能一致。代謝組學樣本收集取樣基本原則:表示性和一致性:驗組與對照組樣本在取材部位、時間處理等方面盡可能保持一致,從而保證實驗的可信度;迅速性:操作過程迅速,很大限度縮短樣本采集到實驗的時間;低溫原則:所有樣本離體后,分離步驟應在4℃或冰上進行,分離好的樣本立即存于-80℃,以免樣本產生進一步代謝活動。江蘇植物靶向代謝組學方法與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。
GC-MS非靶向代謝組學能檢測到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準確度?GC/MS的定性有雙重標準,一是保留指數,二是質譜信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的軟電離源,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,能量較強且穩定,在將代謝物分子電離后,分子離子峰進一步碎裂產生豐富的碎片離子。因此,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,將儀器得到的實際指紋圖譜和質譜庫(如NIST庫)進行比對后,我們將會得到一個叫相似度的指標。保留指數和相似度都必須滿足設定的閾值,軟件才會給出色譜峰的定性結果。然后采用標準品質譜信息進行完全比對定性,也就是說只有經過標準品比對,代謝物才是被100%定性。
代謝組學在系統生物學中有什么作用?它的地位如何?代謝物作為生物體表型的基礎能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現象揭示生命本質。代謝組學本質上是指從整體上研究生物體的代謝物,是對某一生物、組織或細胞中的所有低分子量代謝產物進行定性與定量分析的一門科學。代謝組學以指標分析為基礎,高通量檢測為手段,通過研究生物體內代謝物的種類與數量及其變化規律來闡述機體在正常生命狀態及環境變化后的代謝過程。代謝組是系統生物學的分支學科之一。其研究內容主要包括對代謝物進行定性或定量分析,不同基因型的生物體進行代謝組學表型研究,不同生長環境及加物理、化學或生物性刺激后個體代謝產物的應答,進行代謝途徑或代謝網絡解析與轉基因評價。代謝組學可與生物表型變化建立直接相關性。
代謝組學的研究領域有哪些?1、疾病機制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發。4、藥物作用機制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細胞代謝組學研究。7、微生物代謝組學研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少?不同檢測平臺的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,可達到fM級。另外,相同含量的不同物質,由于自身化學性質不同,質譜的離子化效率、信號響應強度會差異很大。物質的檢測靈敏度跟自身的化學性質有關,化學性質的影響主要表現在離子化效率和質譜碎裂行為兩方面。因此,相同含量的不同物質,可能一個能檢測出來,另一個檢測不出來。代謝組學在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。江蘇植物靶向代謝組學方法
代謝組學先進分析檢測技術結合模式識別和**系統等計算分析方法是代謝組學研究的基本方法。江蘇植物靶向代謝組學方法
代謝組學樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時,在中午光照好的時間收集。(2)采集樣本時保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養基或營養液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。江蘇植物靶向代謝組學方法
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