蛋白質組學技術方法介紹:蛋白質組學技術方法:生物質譜:生物質譜技術是蛋白質組學研究中比較重要的鑒定技術,其基本原理是樣品分子離子化后,根據不同離子之間的荷質比(M/E)的差異來分離并確定分子量。對于經過雙向電泳分離的目標蛋白質用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵)成肽段,對這些肽段用質譜進行鑒定與分析。目前常用的質譜包括兩種:基質輔助激光解吸電離-飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)和電噴霧質譜(ESI- MS)。在未來的發展中,蛋白質組學的研究領域將更加普遍。四川常規蛋白質組學鑒定
蛋白組學技術:質譜技術相較于傳統蛋白質鑒定技術而言,擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。質譜鑒定蛋白質的基本原理是先將樣品分子離子化,然后根據不同離子之間的質荷比差異來分離并確定蛋白質的相對分子質量。根據蛋白質酶解后所得到的肽質量指紋圖譜、肽序列標簽、和肽階梯序列去檢索蛋白質或核酸序列數據庫,質譜技術可達到對蛋白質的快速鑒定和高通量篩選。因產生離子的方法不同而發展起來的質譜包括基質輔助激光解吸離子化質譜、電噴霧離子化質譜、表面增強激光解吸離子化質譜等。河南Label free非標記定量蛋白質組學技術在當前的生物醫學研究和臨床診斷中,蛋白質組學相關技術有非常多的應用。
我們究竟怎么研究蛋白質組學呢?目前高通量檢測蛋白質的方法中,還是首推基于質譜的方法,納流液相可以將復雜樣品中的肽段高效地分離,然后依次進入質譜,對每個被離子化的肽段及其碎裂后碎片的荷質比進行分析,從而得到該肽段的序列信息,然后根據對應的色譜峰面積或者報告離子強度等信息,我們又可以得到該肽段的定量信息。蛋白組學研究怎么做?當下蛋白組學研究中應用比較普遍的技術是同位素標記定量(iTRAQ/TMT技術)。iTRAQ/TMT技術是利用DDA掃描模式,其掃描的方式是將一級質譜信號比較強的Top20的多肽進行二級打碎,然后進入二級質譜進行檢測。其優勢是二級譜圖采集的肽段信息都來源于同一條多肽,有利于后續的定性分析。
蛋白質組學描述: 蛋白質組(proteome):一種細胞、組織或生物體完整基因組所對應的全套蛋白質。蛋白質組學(proteomics):研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、變化、定位及相互作用規律的科學。蛋白質譜技術: 蛋白質譜技術是蛋白質鑒定分析的主要支撐技術,它通過測定樣品離子的質荷比(m/z) 來進行成分和結構分析。高靈敏度,精確度;能同時提供樣品的精確分子量和結構信息;既可用于定性分析,也可用于定量分析。標記定量技術原理: 在一級質譜圖中,任何一種iTRAQ/TMT試劑標記不同樣本中的同一蛋白質表現為相同的質荷比; 在二級質譜圖中,報告離子表現為不同質荷比的峰,因此根據波峰的高度及面積,可以鑒定出蛋白質和分析出同一蛋白質不同處理的定量信息。蛋白質組研究技術涉及到各種重要的生物學現象,如信號轉導、細胞分化、蛋白質折疊等等。
蛋白質組學:質譜分析蛋白質組學的基本原理主要是通過測定被測樣品離子的理化性質來進行分析,根據樣品的質量譜圖和相關信息從而得到定性和定量結果。目前,蛋白質組學質譜分析一般是根據保留時間(retentiontime)、質荷比(m/z)、離子強度(intensity)這三個維度對肽蛋白質進行鑒定和定量,即3D蛋白質組學。4D蛋白質組學在3D蛋白質組學的基礎之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),主要根據離子的形狀和截面對離子進行分離,能夠區分m/z差值非常小的肽段,使低豐度蛋白信號能夠被區分和識別出來。4D蛋白質組學基于timsTOFPro質譜儀,結合PASEF(ParallelAccumulationSerialFragmentation,同步累積連續碎裂)與TIMS(TrappedIonMobilitySpectrometry,離子遷移譜),可重復測量所有檢測離子的碰撞截面(CCS),能更快、更靈敏的進行蛋白質組定性和定量。蛋白質組研究技術覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。四川定量乙酰化蛋白質組學技術服務
蛋白質組學技術的本質(從分析化學角度來看),就是對蛋白質的定性定量分析。四川常規蛋白質組學鑒定
蛋白質組學樣品寄樣要求:動物組織的樣本蛋白量相對較高,送樣量的要求也相對比較寬松,一般提供50~100mg的量即可。此外,組織上有血跡、脂肪、結締組織的還需要用PBS和組織剪將其清理干凈。送樣前將樣品用液氮速凍5min,放置在-80℃保存,送樣時需要置于干冰環境中運輸。動物的懸浮培養細胞也是比較熱門的蛋白組學研究對象,如果想做細胞的蛋白組學,起碼需要1×107個細胞,離心后收集,置于-80攝氏度環境中。蛋白質組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質及其特征進行大規模、系統化地研究,以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網絡。四川常規蛋白質組學鑒定