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江蘇靶向代謝組學鑒定

來源: 發布時間:2022-05-09

代謝組學概念:基因與蛋白質的表達緊密相連,而代謝物則更多地反映了細胞所處的環境,這又與細胞的營養狀態,藥物和環境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關。因此有人認為,“基因組學和蛋白質組學告訴你什么可能會發生,而代謝組學則告訴你什么確實發生了。”代謝組學的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內所有的低分子量代謝產物,代謝組學則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內所有低分子量代謝產物同時進行定性和定量分析的一門新學科。它是以組群指標分析為基礎,以高通量檢測和數據處理為手段,以信息建模與系統整合為目標的系統生物學的一個分支。代謝組學是在基因組學和蛋白質組學之后新近發展起來的一門學科。江蘇靶向代謝組學鑒定

靶向代謝組學:靶向代謝組學分析主要是以標準品為參照,對特定的代謝物群進行有針對性地、特異性地檢測與分析。通常采用的技術方案包括常規的液質聯用(LC-MS)分析技術和選擇性反應/多反應監測技術(MRM/ SRM)。常規分析法首先利用LC-MS的方法對待分析樣本進行大規模代謝組分析,然后通過與相同分析條件下標準品的分析結果進行比對,實現對樣本內目標代謝群的定性和定量分析。MRM/SRM技術是基于已知或假定的反應離子信息,有針對性地選擇數據進行質譜信號采集,對符合規則的離子對進行信號記錄,去除不符合規則離子信號的干擾。定量過程中,該技術首先篩選到目標代謝物特異性的母離子,然后選擇性地對這些母離子進行碰撞誘導,去除其他離子的干擾,只對選定的特異MS/MS2離子進行質譜信號的采集,從而實現對目標代謝分子更為特異、靈敏、準確的分析。四川動物靶向代謝組學技術服務代謝組學是繼基因組學、蛋白質組學、轉錄組學后出現的新興“組學”。

靶向代謝組學:靶向代謝組學(Targeted Metabolomics)是代謝組學研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強,檢測靈敏度高和定量準確等幾個特點。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準確定量定性分析,一方面可以結合其它實驗數據揭示相關的分子生物學作用機制,另一方面,也可以為后續代謝分子標志物的深入研究和開發利用提供有力支持。靶向代謝組學可以用于:驗證有非靶向代謝組學實驗提出的假說;進行基于假說的探索性實驗,針對特定代謝物,研究代謝模型。

GC-MS非靶向與代謝組學的關系?代謝組學是運用多種技術手段,研究生物體系中小分子代謝物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質等)的種類、數量及變化規律的科學,是系統生物學的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學是對生物體內源性代謝物進行系統全方面的分析平臺。氣相色譜-質譜聯用(GC-MS)技術因為其較為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現性好,擁有大量標準質譜圖數據庫的特點,被大量地運用在植物、動物、微生物的研究中。隨著信息科學和分析技術的發展,運用GC-MS非靶向代謝組學研究疾病機制和發現藥物靶點的方法日趨成熟,其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學也在代謝性疾病等藥物靶點、疾病機制研究和藥物靶點發現中提供重要參考和啟示。代謝組學技術得到了迅速發展。

代謝產物是基因表達的產物,在代謝酶的作用下生成。雖然與基因或蛋白質相比,代謝產物較小,但是不能形成代謝產物的細胞是死細胞,因此不能小看代謝產物的重要性。研究人員通過對機體代謝產物的深入研究,可以判斷機體是否處于正常狀態,而對基因和蛋白質的研究都無法得出這樣的結論。事實上,代謝組學研究已經能診斷出一些代謝類疾病,如糖尿病、肥胖癥,代謝綜合癥。目前,已經研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環(TCA),糖酵解,花生四烯酸 (AA)/炎癥途徑。代謝組學的代謝產物是基因表達的產物。江蘇靶向代謝組學鑒定

代謝組學技術可應用于病因病機研究。江蘇靶向代謝組學鑒定

靶向代謝組學的一般分析流程為:1. 數據采集 第1步是得到標準品。如果無法從市場上買到,就必須定制合成。然后通過優化產物離子碰撞能量以得到的信號,再通過測定三重串聯四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數據進行處理,得到報告。3. 統計分析和解釋 將定量報告輸入統計分析軟件包,用統計工具,如ANOVA,對數據進行處理。靶向分析:在基于質譜的代謝組學分析中,要意識到離子強度和色譜保留時間都會隨著時間的推移而產生漂移,所以在實驗中,要按隨機順序對樣本進行檢測,且數據需要在同天同一批次進行采集,以減少誤差。江蘇靶向代謝組學鑒定