代謝組學什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學研究。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細胞和微生物、培養液和發酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發生變化,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態,因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請參照譜領生物樣本收集步驟文件。代謝組學先進分析檢測技術結合模式識別和**系統等計算分析方法是代謝組學研究的基本方法。浙江常規靶向代謝組學分析價格
如何獲得高質量GC/MS代謝組學數據?實驗設計先不談,在儀器分析階段,若想獲得高質量數據,有以下幾個方面需要注意。1)前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此,一個項目應當只由一個人負責前處理。推薦使用自動衍生設備,以減少人為的誤差。2)檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態。儀器的控制軟件都有系統自檢功能,可以快速便捷地核查質譜儀器的狀態。但更重要的是氣相色譜狀態,推薦使用一組混標作為儀器質控。在每一個項目開始之前,先進行質控樣檢測,確認氣相色譜的分離度和質譜的整體響應。3)后期數據矯正,特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質控樣本(每個樣品取少量后混合),在后期數據處理時,使用質控樣本結合如LOESS之類的算法對整體數據進行矯正。浙江常規靶向代謝組學分析價格代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發展起來的一門學科。
代謝組學有哪些應用?近年來,代謝組學技術得到了迅速發展,主要可應用于:功能基因組學、疾病早期診斷、病因病機研究、藥物毒理學、中醫藥現代化、植物代謝組學、微生物代謝組學、營養學、環境科學等生命科學的各個領域。為什么要選擇代謝組學?首先需要明確的是代謝組學的目標分析物主要為生物小分子及其代謝產物,如糖、有機酸、脂質、維生素、氨基酸、芳香烴之類等化合物。所以,如果關注的是小分子物質,那么采用代謝組學的方法,可以對樣品內檢測到的小分子物質進行定性、定量分析。同于基因組學和蛋白組學,代謝組學的研究反映某一時刻下正在發生的生命活動情況,研究代謝物的表達量、代謝物與生理病理變化的關系,能夠幫助尋找新的生物標記物,發現新的代謝途徑,以及更進一步深入了解目前已知的這些途徑,應用于疾病的早期診斷、藥物靶點的發現、疾病的病理生理研究。
什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學?(1) 非靶向代謝組學(Untargeted metabolomics)即非目標代謝組學或發現代謝組學,無偏向性地對所有小分子代謝物(一般相對分子量小于1000)同時進行檢測分析的代謝組學。(2) 靶向代謝組學(Trgeted metabolomics)則為目標性代謝組學,著重對于設定好的目標代謝物進行定性、量檢測分析和研究。相比于其他組學,代謝組學有哪些特殊的優勢?系統生物學有基因組學、轉錄組學、蛋白組學和代謝組學。代謝組學作為系統生物學的一個重要的分支,與其他組學相比有著其特有的優勢,主要體現在以下幾點:(1) 基因與蛋白質表達的微小變化會在相應代謝物水平上得到放大,更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關性。代謝組學是效仿基因組學和蛋白質組學的研究思想。
代謝組學(英語:metabolomics)是對細胞,生物流體,組織或生物體內的小分子(通常稱為代謝物,metabolites)的大規模研究。 這些小分子及其在生物系統中的相互作用統稱為代謝組。能夠對生物樣本中的代謝物進行全方面分析的一項新興技術,被定義為代謝組學技術。代謝組學是在后基因組學時代興起的一門跨領域學科,其主要目標是定量的研究生命體對外界刺激、病理生理變化、以及本身基因突變而產生的其體內代謝物水平的多元動態反應。之后得到迅速發展并滲透到多項領域,比如疾病診斷、醫藥研制開發、營養食品科學、毒理學、環境學,植物學等與人類健康護理密切相關的領域。代謝組學的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內所有的低分子量代謝產物。湖北代謝組學分析方法
代謝組學技術可應用于疾病早期診斷。浙江常規靶向代謝組學分析價格
非靶向代謝組學分析流程:1、代謝譜分析(也稱為差異表達分析):在一組實驗和對照樣品中,尋找豐度改變有統計學意義的感興趣代謝物;2、鑒定:進行代謝譜分析后,測定這些代謝物的化學結構;3、解釋:研究流程的結尾的一步,解釋所發現的代謝物與生物過程或生物狀態之間的關聯。代謝組學主要是對生物體受到內部(基因)或外部(飲食、環境等)刺激后所發生生物響應進行綜合分析的研究工具,代謝組學的研究按照研究目的的不同可分為靶向代謝組學和非靶向代謝組學。浙江常規靶向代謝組學分析價格