定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記（label）和非標(biāo)記（labelfree）定量策略，標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記和體外標(biāo)記兩種。細胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中，常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達異常。定量蛋白質(zhì)組學(xué)就是把一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復(fù)雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進行精確的定量和鑒定。非標(biāo)記（labelfree）的定量蛋白組學(xué)技術(shù)，Labelfree定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析，無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強度，從而對肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)進行相對定量。蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的？湖北DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域

蛋白組學(xué)研究怎么做？PRM:平行反應(yīng)監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù)，能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)、目標(biāo)肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，從而實現(xiàn)對目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進行一定定量，因此也被稱之為基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的WesternBlot（LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB）。PRM技術(shù)基于Q-Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜平臺，首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標(biāo)肽段的母離子，隨后在Collisioncell中對母離子進行碎裂，之后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣即可對復(fù)雜樣本中的目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進行準(zhǔn)確地特異性分析。深圳常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)主要技術(shù)蛋白質(zhì)組可以隨著組織、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：特點：（1）不同樣本標(biāo)記之后混樣，統(tǒng)一處理上機，減少了分別上機造成的實驗誤差，并利用同位素標(biāo)簽的豐度來檢測，定量更準(zhǔn)確，重復(fù)性更好；（2）由于需要標(biāo)記試劑標(biāo)記，因此成本相對較高；（3）通量高，在一次實驗中比較多可同時比較8個樣品；（4）利用基于同一個參考樣品的辦法，可以進行多于8個樣品的定量比較；（5）iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：Label-Free定量，即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要對比較樣本做特定標(biāo)記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：TMT定量蛋白組學(xué)技術(shù)：TMT(TandemMassTags)定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這種技術(shù)采用多個（2-10）穩(wěn)定同位素標(biāo)簽，特異性標(biāo)記多肽的氨基基團進行串聯(lián)質(zhì)譜分析，能夠同時比較多達10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對含量，可用于研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達水平的差異。iTRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)是多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這種技術(shù)同TMT定量蛋白組學(xué)技術(shù)相似，可研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達水平的差異。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不僅是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析（QuantitativeProteomics）是對一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進行精確鑒定和定量。可用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白，結(jié)合生物信息學(xué)揭示細胞生理病理等功能，同時也可對某些關(guān)鍵蛋白進行定性和定量分析。目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見標(biāo)記（Label）和非標(biāo)記的（LabelFree）定量策略。定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)常見的幾類主要包括：LabelFree定量蛋白組分析、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白組學(xué)分析、SILAC/Dimethyl標(biāo)記定量蛋白組分析、SWATH定量蛋白組學(xué)、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學(xué)分析。蛋白質(zhì)組學(xué)包括翻譯后的修飾。深圳常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)主要技術(shù)

iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù)。湖北DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域

蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢：1、基礎(chǔ)研究方面：近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域，如細胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)等。在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍，涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象，如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來的發(fā)展中，蛋白質(zhì)組學(xué)的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡椤?、應(yīng)用研究方面：蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景，目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。湖北DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域

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