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來源: 發布時間:2023-07-18

RNA逆轉錄實驗注意事項:防止RNA模板的降解:毫無疑問,RNA質量對cDNA合成結果會產生重要影響。但RNA很脆弱,易于降解。為了保證RNA的完整性,我們需要小心又小心,比如在冰上操作,用RNase-free的頭頭和離心管,減少操作時間等。在反應體系中加入RNase抑制劑也能有效防止RNA降解。另外,建議在進行逆轉錄前,通過瓊脂糖凝膠電泳檢查RNA條帶的質量。通常完整的真核RNA應包括28S、18S條帶,且28S條帶強度一般是18S的兩倍左右。RNA逆轉錄實驗注意事項:選擇合適的引物:OligodT引物和隨機引物都能進行逆轉錄。OligodT引物只能與mRNA的3’端poly(A)結合,沒有rRNA和tRNA的干擾,特異性強。逆轉錄是一種將RNA反轉錄為DNA的生物化學過程。南京一步法逆轉錄酶費用

反轉錄酶的選擇:反轉錄酶(Reversetranscriptase)又稱逆轉錄酶。是以RNA為模板指導dNTP合成互補DNA(cDNA)的酶。一部分反轉錄酶具有RNA酶活性,能夠在轉錄后降解RNA-DNA雜交鏈中的RNA鏈。如果反轉錄酶沒有Rnase酶活性,可加入RNaseH來獲得更高的qPCR效率。常用的酶包括Money鼠白血病病毒(MMLV)反轉錄酶和禽成髓細胞瘤病毒(AMV)反轉錄酶。依據RT-PCR,理想的狀態下是選擇具有較高熱穩定性的反轉錄酶,cDNA的合成才能在較高的溫度下進行,確保成功轉錄具有較高二級結構的RNA,并確保在整個反應過程中的全部活性,從而得到質量更高的cDNA。南京一步法逆轉錄酶費用逆轉錄也可作為RNA表達譜的分析方法。

莖環法逆轉錄是一種逆轉錄反應的技術,它利用莖環結構的RNA分子作為反向引物,在逆轉錄過程中特異性地擴增目標RNA分子。該技術在分子生物學和醫學研究中得到了普遍的應用,特別是在RNA的研究和檢測中具有獨特的優勢。莖環法逆轉錄技術的基本原理是利用逆轉錄酶和莖環結構的RNA作為反向引物,將RNA逆轉錄成cDNA,并在PCR反應中擴增。莖環結構的RNA分子具有較高的穩定性和特異性,可以特異性地識別和結合目標RNA分子,從而在逆轉錄反應中作為反向引物擴增目標cDNA。此外,由于莖環結構的RNA分子與目標RNA分子的堿基序列互補,因此莖環法逆轉錄技術可以避免隨機引物引起的非特異擴增。

miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR,miRNA與mRNA的在qRT-PCR過程有所不同。一般來講,mRNA比較長,其長度通常在幾百至幾千個核苷酸,因此使用隨機引物(RandomPrimerp(dN)6)即可隨機結合到mRNA的各位置進行逆轉錄。由于qPCR的過程只需擴增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用隨機引物的逆轉錄產物盡管不完整,也完全能夠滿足qPCR的需求。當然,也可以使用OligodT引物統一從mRNA的ployA尾巴開始逆轉錄。這種逆轉錄引物在擴增cDNA全長時是必須的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物進行逆轉錄。逆轉錄實驗過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。

逆轉錄常見問題及解決方法之RNA濃度不高:a)、原始組織樣本或細胞量太少:提高加入量。b)、RNA發生降解:如果使用者確定提取RNA的試劑/器具沒有問題,RNA的降解通常發生在樣品破碎/勻漿階段。有兩個辦法可以徹底抑制內源RNase活性:1.立即加入裂解液并且徹底而迅速地勻漿。這只適合培養細胞及內源RNase含量較低的并且較容易勻漿的組織,2.對于內源RNase含量高或不易勻漿的組織,如肝臟、胰腺、脾臟、肌肉等,或植物組織,需要切成小塊后立即投入液氮冷凍,再按說明進行破碎/勻漿。c)、加入異丙醇后室溫沉淀10min或-20C冰沉淀30min即可,無需過夜沉淀。逆轉錄在研究RNA表達調控等領域有普遍的應用前景。廣州彩色逆轉錄酶

逆轉錄實驗前要對反應體系進行無RNA和無反轉錄酶的對照。南京一步法逆轉錄酶費用

逆轉錄是指以RNA為模板合成DNA的過程,即將遺傳信息由RNA逆向傳給DNA的過程,其遺傳的傳遞方向與轉錄相反。反轉錄酶也可寫成逆轉錄酶又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。是以RNA為模板指導三磷酸脫氧核苷酸合成互補DNA(cDNA)的酶。哺乳類C型病毒的反轉錄酶和鼠類B型病毒的反轉錄酶都是一條多肽鏈。鳥類RNA病毒的反轉錄酶則由兩上亞基結構。真核生物中也都分離出具有不同結構的反轉錄酶。RNA指導的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。南京一步法逆轉錄酶費用

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