10x Genomics 公司提供的 Visium 空間基因表達解決方案是目前***一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案巧妙的將單細胞測序技術原理和組織切片染色結合在一起，從而研究空間分辨率下整個轉錄組 mRNA 的表達情況，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。空間轉錄組相關的顯微解剖技術通常分為兩類：機械和光學。前者包括 Tomo-seq 等，通過沿感興趣軸，利用冷凍切片機進行組織切片，然后在每個切片上均進行 RNA 測序。10x 提供的載玻片分為兩種：用于摸索組織比較好透化時間的組織優化玻片和用于正式實驗的基因表達玻片。分享歐易生物在空間轉錄組樣本處理、實驗和數據挖掘上的成功經驗，助力各位科研工作者取得新的突破。上海空間轉錄組做什么

1. 10x  Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域，每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots），每個點的直徑為55 μm，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列。10X Visium空間轉錄組的實驗主要分為兩部分：組織學板塊和組學板塊。組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態學信息；組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序，記錄切片的轉錄本信息和空間位置信息 。四川技術空間轉錄組空間轉錄組避免了組織中細胞位置信息的丟失。

基于原位測序的空間轉錄組技術。基于原位測序（ISS）的方法通過測序產生空間轉錄組信息，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個探針與模板匹配，不匹配的探針就會被洗掉。2013年開發的ISS中，每個探針使用一個查詢堿基來測序基因條形碼。FISSEQ和后來的EXeq使用了SOLiD，每個探針使用兩個查詢堿基來測序環化和RCA擴增的cDNAs。在STARmap中，基因條形碼由SEDAL測序，其中還使用了兩個類似固體的查詢堿基來避免錯誤。BARseq還用基因條形碼放大了RCA探針。基于ISS技術的優勢包括：單細胞分辨率、亞細胞轉錄物定位和可應用于更大的組織區域。缺點是：檢測效率較低。

空間轉錄組的應用有哪些？一、發現疾病的空間異質性：同時了解患病組織中的細胞類型及其定位有助于解決空間分辨的轉錄組學問題。在不同的環境下，明智地選擇這些方法在生物學研究中也是至關重要的，例如在神經科學中，基于FISH的方法很普遍；基于LCM的方法適用于小樣本（例如臨床樣本）以及整個轉錄組或基因組分析。二、構建空間轉錄組圖譜：借助于空間分辨的單細胞轉錄組學，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結構的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉錄組技術結合空間轉錄技術，得到多個***的時空轉錄組圖譜（相關研究后續會在如下專輯更新）。結合空間轉錄組測序技術，作者進一步確定和豐富了胚胎心臟基因表達的空間注釋信息。

空間轉錄組數據分析的是根據每個芯片上每個 spot 的基因表達信息進行聚類，然后將 spot 根據坐標位置序列放回到組織的圖像上，同時可以對每個 gene 在組織上表達的空間位置進行定位。獲得測序數據后，首先利用 Space Ranger  軟件可以自動化的對圖像進行處理、數據比對和 Barcode 處理。另外一個軟件 Loupe Cell Browser 是一個適用于 Windows 和 MacOS 的桌面應用程序，它可以快速、輕松地可視化和分析10X Visium 數據。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。空間轉錄組學技術主要包括 MERFISH 和 seqFISH。實力空間轉錄組質量

盡管前傳時代的空間技術被迅速棄用，但其思想和方法是當今時代空間轉錄組學發展的基礎。上海空間轉錄組做什么

空間轉錄組技術作為當今前沿的科研技術，相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中，快速發表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫學科技有限公司（以下簡稱“歐易生物”）主辦的“空間轉錄組學培訓班”落下帷幕。培訓中，歐易講師團隊以其豐富的項目經驗及專業的生信能力，從空間轉錄組學的發展歷程、測序原理、實驗實操及數據挖掘等多維度，向遠道而來的學員們展開了系統性的培訓。

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上海歐易生物醫學科技有限公司一直專注于檢驗檢測服務。（依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動，具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫藥產品、生化產品的研發，醫藥中間體、化工原料及產品（除危險品化學品、監控化學品、易制毒化學品）的研發、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關技術咨詢、技術服務，會務服務，企業管理咨詢。，是一家醫藥健康的企業，擁有自己**的技術體系。公司目前擁有較多的高技術人才，以不斷增強企業重點競爭力，加快企業技術創新，實現穩健生產經營。誠實、守信是對企業的經營要求，也是我們做人的基本準則。公司致力于打造***的科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢。公司力求給客戶提供全數良好服務，我們相信誠實正直、開拓進取地為公司發展做正確的事情，將為公司和個人帶來共同的利益和進步。經過幾年的發展，已成為科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢行業出名企業。