空間轉錄組的應用有哪些?一、構建空間轉錄組圖譜:借助于空間分辨的單細胞轉錄組學,建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結構的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉錄組技術結合空間轉錄技術,得到多個***的時空轉錄組圖譜(相關研究后續會在如下專輯更新)。二、描繪胚胎發育和空間藍圖:胚胎發育是一個復雜的過程,其中動態變化在生物分子水平上迅速發生。對這種微觀變化的時間和空間方面的分析都具有挑戰性。預期使用空間轉錄組學技術可以表征胚胎發育的空間表達藍圖。HE 染色適用于空間轉錄組的組織學呈現方法。江蘇空間轉錄組多少錢
歐易生物自引進10x Visium空間轉錄組以來已經完成了上百例樣本測序,在樣本包埋、切片、實驗和數據分析上積累了大量寶貴的經驗。本次培訓班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉錄組的研究熱點和方案設計,分享歐易生物在樣本處理、實驗和數據挖掘上的成功經驗,助力各位科研工作者取得新的突破。招生對象:A、對空間轉錄組感興趣,期望了解空間轉錄組技術,或近期準備開展空間轉錄組測序項目B、項目已經開展,需要深入挖掘數據的科研工作者。江西歐易生物空間轉錄組做什么空間轉錄組組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像,記錄切片的形態學信息。
10x Genomics 公司提供的 Visium 空間基因表達解決方案是目前***一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案巧妙的將單細胞測序技術原理和組織切片染色結合在一起,從而研究空間分辨率下整個轉錄組 mRNA 的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。空間轉錄組相關的顯微解剖技術通常分為兩類:機械和光學。前者包括 Tomo-seq 等,通過沿感興趣軸,利用冷凍切片機進行組織切片,然后在每個切片上均進行 RNA 測序。10x 提供的載玻片分為兩種:用于摸索組織比較好透化時間的組織優化玻片和用于正式實驗的基因表達玻片。
10x Genomics空間轉錄組技術的準確性高嗎?下圖是一個將10x Genomics空間轉錄組技術應用于小鼠海馬體研究的案例。A圖為腦組織切片的HE染色結果,從10x Genomics空間轉錄組分析結果中,可以清晰看到Tmsb4x(B圖)和Selenow(C圖)在海馬體區域高表達,和已知的研究結果一致性較高。開展10x Genomics空間轉錄組需要做哪些準備?空間轉錄組是一項十分前沿的技術,涉及到很多細節方面的準備工作,例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區域的確認等一系列內容。而且實驗中存在很多不確定性因素,處理不慎容易導致整個項目失敗。通過培訓系統掌握空間轉錄組測序原理和方案設計思路,助力科學研究。
1. 空間轉錄組實驗步驟A。切片制備和優化:取新鮮組織、冷凍、切片,并進行HE染色成像,優化確定切片是否覆蓋靶向區域。空間轉錄組實驗步驟B。切片固定和透化:將組織切片放置在含有與RNA結合捕獲探針的載玻片上,并進行固定和透化,使細胞中的 mRNA 得到釋放,并結合到相應的捕獲探針上,從而獲取基因表達信息。空間轉錄組實驗步驟c。逆轉和文庫構建:以捕獲的 RNA 為模板,進行 cDNA 合成,和測序文庫制備。空間轉錄組實驗步驟d。高通量上機測序:對制備好的測序文庫,進行二代高通量短讀長測序。空間轉錄組實驗步驟e。數據可視化分析:結合HE結果,確定哪些基因有表達,表達量高低,以及這些基因的空間位置信息。空間轉錄組測序結果為未來人類心臟發育的研究提供重要的借鑒意義。海南空間轉錄組價格
10X Visium空間轉錄組的實驗主要分為兩部分:組織學板塊和組學板塊。江蘇空間轉錄組多少錢
10x Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域,每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcoded spots),每個點的直徑為55 μm,點和點之間中心的距離為100 μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析,以確定哪些數據來自哪個位置,從而實現空間基因表達的可視化。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗,致力通過高效的服務,助力各位科研工作者取得新的突破。江蘇空間轉錄組多少錢
上海歐易生物醫學科技有限公司坐落在聯航路1188號25幢,是一家專業的檢驗檢測服務。(依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動,具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫藥產品、生化產品的研發,醫藥中間體、化工原料及產品(除危險品化學品、監控化學品、易制毒化學品)的研發、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關技術咨詢、技術服務,會務服務,企業管理咨詢。公司。目前我公司在職員工以90后為主,是一個有活力有能力有創新精神的團隊。公司業務范圍主要包括:科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢等。公司奉行顧客至上、質量為本的經營宗旨,深受客戶好評。公司憑著雄厚的技術力量、飽滿的工作態度、扎實的工作作風、良好的職業道德,樹立了良好的科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢形象,贏得了社會各界的信任和認可。