iTRAQ蛋白質組學研究實用案例:2021年8月,浙江大學藥學院何俏軍、羅沛華團隊在Autophagy期刊發表了題為“Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib”的研究成果,通過動物模型、功能實驗、iTRAQ蛋白質組學等研究方法,發現了舒尼替尼誘導的自噬導致心肌細胞凋亡和心臟功能障礙,探究了舒尼替尼誘導的適應不良自噬通過TOLLIP介導的內體相關通路選擇性降解心肌細胞存活介質CCN2的機理,揭示了調節心肌細胞死亡的自噬降解新靶標蛋白。為提高基于舒尼替尼的*****安全性提供了方法及理論依據。中文標題:CCN2的自噬降解導致舒尼替尼的心臟毒性研究對象:小鼠發表期刊:Autophagy影響因子:16.016發表時間:2021年8月合作單位:浙江大學藥學院運用生物技術:iTRAQ蛋白質組學(由鹿明生物提供技術支持)蛋白組學研究必看的經典綜述。山東dia定量蛋白組學
采用TMT標記定量蛋白質組學技術對三個脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進行了蛋白質組學分析,共鑒定了5,477個蛋白質。對測試樣本進行了PCA分析,結果顯示,不同組間樣品具有很好的區分,每組的三個重復樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個試驗組之間共有815個差異表達蛋白。其中,198個(32%)和198個(26%)蛋白質豐度增加,而420個(68%)和558個(74%)蛋白質豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個蛋白質的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。安徽外泌體蛋白組學檢測蛋白組學常見研究模式 | 蛋白質組專題_鹿明生物。
iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法:2021年4月,南京林業大學喻方圓教授(一作:吳岐奎)課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通過轉錄組學+iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法,分析東京野茉莉種子發育過程中脂肪酸生物合成相關基因的表達趨勢,確定油脂積累的主要影響因子并構建其調控網絡。為野茉莉屬植物種子油用研究和后續功能分析研究提供了一定的研究基礎。
作者使用通過單細胞蛋白組學產生的數據來觀察在腎小球細胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質細胞。208個Glom富集區蛋白富含囊泡中間運輸和細胞成分組織調節作為其**重要的生物學過程,細胞骨架蛋白結合和肌動蛋白結合是**重要的分子功能,肌動蛋白細胞骨架是**豐富的細胞成分。富含247個PT的蛋白質主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中,這些蛋白質的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發現的67種蛋白質中,有41種已被報導存在于腎臟中,在這41種蛋白質中,18種(43.9%)與單細胞蛋白組學結果一致,23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。修飾蛋白質組試劑及服務,蛋白質組學解決方案。
蛋白質磷酸化修飾是指在磷酸化激酶的作用下將ATP的磷酸基轉移到蛋白質特定氨基酸上的過程,是生物體內**為常見、**為重要的翻譯后修飾之一。生物體內蛋白質的磷酸化修飾是一個瞬時且可逆的過程,通過磷酸化修飾可以改變蛋白質空間構象,從而影響蛋白質的定位、活性及其與其他蛋白的相互作用上海鹿明生物科技有限公司多年來,一直專注于生命科學和生命技術領域,是國內早期開展以蛋白組學和代謝組學為基礎的多層組學整合實驗與分析的團隊。影響因子:13.511發表時間:2022-01-06發表單位:***醫學研究院生物工程研究所運用生物技術:磷酸化蛋白質組學(歐易鹿明提供)、LC-MS靶向代謝組學蛋白組學方案為組學研究涉及的樣本獲取,前處理,數據采集到分析的各個環節提供自動化。江蘇蛋白組學 武漢
蛋白質組與代謝組聯合分析。山東dia定量蛋白組學
轉錄組學和蛋白質組學分析作者通過轉錄組學和蛋白質組學分析暴露于DON的C2C12細胞的差異基因(DEG)。轉錄組學鑒定了2387個DEG,其中72%被下調。蛋白質組學鑒定出402個DEG,其中74%被下調。GO和KEGG通路富集分析表明,轉錄組學DEGs參與了“男性主要性征的發育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調節”等生物學過程。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白質消化吸收”。蛋白質組學分析中,富集到了“肌肉收縮”、“中間絲解聚”和“脂質轉運”等生物學過程。細胞成分中富集到“細胞骨架”、“細胞外基質”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”、“系統性紅斑狼瘡”、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質消化和吸收”。前兩條通路與上調的DEG相關,而后兩條通路與下調的DEG相關,這與轉錄組學結果一致。山東dia定量蛋白組學
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