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江蘇如何處理代謝組學數據

來源: 發布時間:2022-06-10

雙平臺代謝組學研究,2022年02月,中國中醫科學院廣安門醫院李敏教授課題組在Biomedicine & Pharmacotherapy發表的題為 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果,發現了***通絡方可有效地防治糖尿病并發癥形成與發展,探究了***通絡方防治糖尿病視網膜病變的作用機制,***通絡方可改善糖尿病大鼠視網膜組織病理損害;提高視網膜緊密連接蛋白,保護血-視網膜屏障;抑制p38MAPK相關通路及IncRNA MALAT1水平;降低全身及局部視網膜的炎癥及氧化應激水平。為***通絡方防治糖尿病視網膜病變提供了實驗依據。LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學主要用于***的中藥成分分析。常用的代謝組學相關數據庫有人類代謝組數據庫KEGG數據庫、Reactome數據庫。江蘇如何處理代謝組學數據

GC-MS非靶向代謝組學研究:不同分子量聚乙烯顆粒改變了玉米根際土壤微生物群落組成和代謝譜AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究對象:聚乙烯顆粒、玉米、根際土壤發表期刊:JournalofHazardousMaterials影響因子:10.588組學技術:GC-MS非靶向代謝組學和16SrRNA測序(由歐易/鹿明生物提供技術支持);這項研究的重點是確定不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環境的機制。本文運用非靶向代謝組學,微生物16SrRNA測序等方法研究的結果證實,不同分子量的PE顆粒對土壤-植物系統有不利影響。不同分子量的PE顆粒在形狀和表面微觀結構上存在明顯差異。土壤蔗糖酶和過氧化物酶對不同分子量的PE顆粒有***響應。江蘇如何處理代謝組學數據代謝組學-對生物體內所有代謝物進行定量分析。

GC-MS非靶向代謝組學等研究方法:2021年10月,廣東石油化工大學環境科學與工程學院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學等研究方法,發現包括糖酵解/糖異生、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝、谷胱甘肽代謝、胺素代謝,丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞。大多數差異表達的代謝物被下調,表明有機磷阻燃劑對代謝功能和關鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機磷阻燃劑對環境產生的風險提供了新的見解。

非靶向代謝組學研究:通過在三個成熟階段收獲兩個東方甜瓜品種的果實作者使用非靶代謝組學聯合轉錄組學發現可溶性糖和有機酸在轉錄組水平和代謝組水平的差異現象。這項研究運用多組學技術聯合揭示了兩個品種成熟過程中關鍵的代謝和轉錄特征。在本研究中,通過代謝和轉錄組分析的綜合分析,研究了控制兩個東方甜瓜品種'甜寶'和'小翠瓜'中糖和有機酸代謝的基因網絡。篩選了與糖和有機酸代謝相關的關鍵代謝物和候選基因,并討論了甜瓜品種甜度不同的可能解釋。研究結果提高了對決定甜瓜發育和成熟過程中糖和有機酸積累和代謝的分子機制的理解。代謝組學-歐易生物/鹿明生物 客戶好評 專注代謝組學研究。

代謝組學研究,2021年12月威爾康奈爾醫學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通過蛋白質組學和代謝組學研究方法,發現了高度轉移性 SOX2/OCT4+ 細胞的離散亞群表現出細胞內銅水平升高特征,探究了TM 介導的復合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細胞群中的主要代謝缺陷,AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉移軸,為高風險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據。代謝組學分析價格-歐易生物特色研究-多項目經驗-自有實驗室代謝組學。江蘇如何處理代謝組學數據

基于 LC-MS/GC-MS代謝組學 從樣本采集到數據分析。江蘇如何處理代謝組學數據

糞便代謝組分析,中文標題:二烯丙基二硫化物(DADS)通過調節腸道微生物群和代謝物來保護小鼠腸道及改善白色念珠菌***研究對象:小鼠糞便發表期刊:FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影響因子:5.293發表時間:2022年1月7日合作單位:復旦大學上海市第五人民醫院創傷急危重癥醫學科運用生物技術:糞便代謝組分析(由鹿明生物提供技術支持)、微生物16SrRNA測序。文章通過建立DSS 誘導的腸道白色念珠菌小鼠模型,模擬人類腸道******。一方面證實了白色念珠菌可以增強 DSS 結腸炎的嚴重程度,另一方面通過微生物組學和代謝組學等手段確認了 DADS ***可以改善腸道生態失調(改變腸道微生物群和代謝物)、腸道通透性和全身炎癥反應。深入了解 DADS ***的效果可能會為腸道白色念珠菌***提供新的***策略。江蘇如何處理代謝組學數據

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