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重慶空間代謝組學鹿明

來源: 發布時間:2022-06-07

空間代謝組學:質譜成像方法提供了一種直接獲取代謝網絡信息的途徑,以系統地深入了解大腦的代謝活動。基于KEGG數據庫的Metaboanalyst軟件進行代謝網絡分析。共找到20條KEGG代謝通路,包含126個具有微區信息的代謝物,圖2顯示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代謝、花生四烯酸代謝、精氨酸和脯氨酸代謝、肌酸途徑、GABA能突觸、葡萄糖代謝、谷胱甘肽代謝、甘油磷脂代謝、甘氨酸-絲氨酸和蘇氨酸的代謝、組氨酸代謝、賴氨酸代謝、苯丙氨酸代謝、多胺代謝途徑、嘌呤代謝、嘧啶代謝和TCA循環、色氨酸代謝、酪氨酸代謝、纈氨酸-亮氨酸和異亮氨酸代謝和類固醇***合成途徑。質譜成像技術可以實現生物上千代謝物的定性。重慶空間代謝組學鹿明

空間代謝組學:中文標題:糞便宏基因組和血清代謝組的整合分析揭示腸道微生物組相關代謝物在結直腸*和腺瘤檢測的作用研究對象:人糞便、血清、組織發表期刊:Gut影響因子:23.059發表時間:2021年8月發表單位:國家**中心中國醫學院科學院**醫院運用生物技術:AFADESI-MSI空間代謝組學、LC-MS非靶代謝組、宏基因組、靶向代謝組學空間代謝組學由賀玖明教授團隊提供技術支持。結直腸*(CRC)的早期診斷是提高患者生存率的有效方式。目前臨床常用的非侵入性和入侵式檢測方法因其準確率低或對患者造成傷害,大規模使用仍受限制。因此,發展無創且準確的檢測方法變得尤為重要。重慶空間代謝組學鹿明一文讀懂空間代謝組學:DESI-IMS與MALDI-IMS的區別。

作者進行了空間代謝組學(~50μm的空間分辨率),并根據m/z848.63和m/z844.52對主要的髓鞘標志物進行了成像,推測它們分別屬于Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(圖2G)。白質和灰質的代表性質譜如圖2H所示。結果表明,使用拉曼光譜結構信息和空間代謝組學對髓鞘中的脂質進行特定的成分分析是可能的。對單個有髓組織成分光譜的分析證實,構成有髓組織光譜的主要分子是脂質,包括腦苷脂、膽固醇、鞘磷脂、磷脂酰膽堿,以及程度較小的蛋白質(圖2F)。

空間代謝組學能夠在復雜的EA微環境中區分組織類型,本文作者使用兩個隊列對食管腺*的甘油磷脂特征進行了表征。**初運用空間代謝組學對連續患者的成對手術切除活檢(EA和MHEE)進行甘油磷脂差異分析;(樣本策略)選擇這種取樣方法的目的是為了進行手術切緣分析,并通過取樣更大的樣本來克服**的區域代謝組學差異。接下來,采用內窺鏡活檢對第二組人群進行采樣。這樣就可以從健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上獲得標本。這樣還使作者能夠驗證***個隊列的發現,調查該技術在小樣本上的表現,并演示在內鏡套件中促進診斷的第二次臨床應用。空間代謝組學二維乃至三維的水平,極大拓展了對組學樣品信息的認知。

空間代謝組學研究:一區 | IF:14.553多發性硬化癥的相關空間代謝組學研究。本文為倫敦帝國理工學院Zoltan Takats教授課題組在ACS central science期刊發表的題為“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果,通過拉曼+空間代謝組學+IHC研究方法,發現了新形成的髓鞘與正常髓鞘具有不同的脂質成分,探究了多發性硬化中再髓鞘化形成的機理,描繪了用于關聯生物分子結構和髓鞘成分的分子成像圖譜,為評估再髓鞘化***提供新策略。空間代謝組技術流程 。重慶空間代謝組學鹿明

空間分辨代謝組學代謝組相關材料。重慶空間代謝組學鹿明

隊列1:收集手術切除的食管腺*(EA)組織和與之匹配的健康食管上皮組織(MHEE)。隊列2:收集健康食管上皮組織(來自健康志愿者,HEE)和未經***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活檢樣本,用于發現食管腺*發展進程中甘油磷脂的變化,以及隊列1的外部驗證。樣本制備:樣本制成冰凍組織切片,并結合H&E染色。研究方法:空間代謝組學;qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達;細胞轉染沉默ACYL基因;免疫組化用于分析隊列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關鍵酶的表達。重慶空間代謝組學鹿明

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