對特定類型基因修飾細胞產品的特殊考慮鑒于基因修飾細胞的產品種類繁多、各有特點,除上述一般技術要求外,還應基于產品的特性進行相應的特殊考慮。本指導原則列舉了以下三種情形的特殊考慮。CAR或TCR修飾的免疫細胞對于嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)或T細胞受體(Tcellreceptor,TCR)修飾的免疫細胞,應盡可能采用多種方法評估其靶點相關毒性和脫靶毒性風險。對于靶點相關毒性,應采用體外方法深入分析靶點在人體qiguan、組織和細胞中的表達分布情況,基因表達分析庫和文獻調研也可能會有助于闡明靶點在不同病理生理狀態下的表達是否存在差異。應采用表達和不表達靶抗原的細胞作為靶細胞進行體外試驗,確認CAR或TCR修飾的免疫細胞可特異性的識別和殺傷靶細胞。拷貝數,是指某基因(可以是質粒)在某一生物的基因組中的個數。南京CAR-T載體拷貝數方法
ddPCR與qPCR在監測CART細胞拷貝數靈敏度比較,CAR-T細胞免疫zhiliao發展迅速,CAR-T細胞zhiliao后的動力學監測對患者隨訪至關重要,對指導接受CAR-T細胞zhiliao的患者的臨床決策也很重要。在給藥前,CAR-T細胞產品內的轉基因副本信息,如載體副本數量,對保證患者的安全性非常重要。目前還缺乏開放區域定量檢測CAR-T細胞的實驗方法。一些機構已經建立了內部分析來監測CAR-T細胞頻率。2022年2月11日,MARIA?LUISASCHUBERT等團隊在INTERNATIONALJOURNALOFONCOLOGY上發表了題為:Comparisonofsinglecopygene?basedduplexquantitativePCRanddigitaldropletPCRformonitoringofexpansionofCD19?directedCARTcellsintreatedpatients的研究,將德國海德堡大學醫院建立的定量(q)PCR檢測方法,即基于單拷貝基因的qPCR與德國漢堡-埃彭多夫大學醫學中心建立的數字液滴PCR檢測方法進行了比較。這兩種方法都是duli開發的,能夠準確并定量比較CAR-T細胞頻率,并在臨床監測中起到重要作用。 連云港腺相關病毒載體拷貝數安評用于檢測單個CAR-T細胞的慢病毒載體拷貝數的方法。
人工構建的質粒載體分類:高拷貝數的質粒載體,ColE1、pMB1派生質粒具有高拷貝數的特點。適合大量增殖克隆基因,或需要大量表達的基因產物。低拷貝數的質粒載體,由pSC101派生來的載體特點是分子量小的拷貝數。它有特殊的用途:當有些被克隆的基因的表達產物過多時會嚴重影響寄主菌的正常代謝活動,導致寄主菌的死亡時,就需要低拷貝的載體。失控的質粒載體,這是一類溫度敏感型復制控制質粒。如pBEU1、pBEU2。插入失活型克隆載體。載體的克隆位點位于其某一個選擇性標記基因內部。如pDF41、pDF42。正選擇的質粒載體,直接選擇轉化后的細胞。只有帶有選擇標記基因的轉化菌細胞才能在選擇培養基上生長。
拷貝數,是指某基因(可以是質粒)在某一生物的基因組中的個數。單拷貝就是該基因在該生物基因組中只有一個,多拷貝則指有多個。在細菌細胞中,根據復制特性,質粒分嚴緊型和松弛型兩類,前者在細胞中只含1?2個,而后者含10?15個以上。恒定的拷貝數與質粒復制控制系統、宿主細胞遺傳背景及生長條件有關??截悢底儺?Copynumbervariation,CNV)是由基因組發生重排而導致的,一般指長度為1kb以上的基因組大片段的拷貝數增加或者減少,主要表現為亞顯微水平的缺失和重復。載體拷貝數安評,可咨詢上海唯可生物。
一般情況下重組載體基因較少整合到基因組中,但近年來已發現載體基因整合到特定基因座中導致的可能性。建議設計時充分考慮重組載體的安全性,關注目的基因的啟動子選擇、給藥劑量、整合區域等多種相關因素。建議對病毒載體進行全基因組測序。另外,也可將病毒載體轉導目標細胞后,對整合有載體序列的細胞基因組進行測序,說明載體骨架及目的基因序列的準確性。對于整合型載體還應考慮插入突變的風險,應對插入位點進行分析并說明對細胞存在的潛在的安全性影響,并對分析方法的合理性進行說明。CAR-T載體拷貝數檢測服務,歡迎來電咨詢!浙江慢病毒載體拷貝數安全性評價
檢測細胞中病毒載體拷貝數的引物和探針、試劑盒、方法。南京CAR-T載體拷貝數方法
穿梭質粒:是指一類人工構建的具有兩種不同復制起點和篩選,因而可以在兩種不同類群宿主中存活和復制的質粒載體。此概念不僅用于不同的微生物菌群之間,也可以推廣到真核生物表達載體的構建,如用于枯草的pBE2、酵母的pPIC9K、哺乳動物表達載體pMT2和用于植物細胞的Ti質粒。這些穿梭質粒不僅可以在大腸桿菌中復制擴增,也可以在相應的枯草、酵母、動物或植物細胞中擴增和表達。這樣利于對質粒的分子生物學操作和大量制備。質粒的不相容性:通俗來說,就是一山不能容二虎。但是作為科學來說,我們需要一個嚴謹的定義。“利用同一復制系統的兩個質粒會在復制和隨后向自細胞的分配過程中彼此競爭,這樣的質粒在細菌培養物中不能和平共處,這種現象稱之為不相容性”。南京CAR-T載體拷貝數方法