CIRCLE-Seq，將gDNA打斷并環化，環化的DNA與CRISPR/RNP孵育，NGS測序檢測線性化的DNapian段，確定脫靶位點。PCR富集后測序，成本相對較低，能檢測低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應評估，安必奇生物提供sgRNA脫靶效應評估服務，幫助您挑選高度特異，脫靶率低的sgRNA進行后續實驗。同時，我們也協助您檢測分析基因編輯后細胞樣品的脫靶情況，通過各種高通量測序檢測技術，我們能準確的分析全基因組范圍內的脫靶位點，推動CRISPR/Cas9技術在zhiliao藥物開發和臨床研究中的應用。我們的優勢：靈敏度高：能檢測低頻脫靶突變★準確性高：檢測結果可通過實驗驗證★多種檢測方法可選擇以滿足不同的實驗需求如何檢測是否發生脫靶? 基因編輯的脫靶率檢測一般有兩種方法。北京種子脫靶檢測評估

通常不需要進行標準的遺傳毒性組合試驗，但應根據基因zhiliao產品的特點、產品的具體適應癥、載體的已有信息、導入基因序列結構等，評估基因zhiliao產品整合進基因組的可能性，判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究，如研究基因組修飾的發生情況，并檢測隨后可能發生的異常細胞行為；評估插入突變（插入位點、插入拷貝數等）引起的遺傳毒性風險。當基因zhiliao產品采用基因編輯或轉座子技術時，需要關注脫靶編輯、轉座子轉座印跡引起的遺傳毒性問題；鑒定/表征基因組整合位點。連云港種子脫靶檢測政策脫靶檢測方法，推薦唯可生物，實驗實力強，專業性高，檢測效率高，結果準確率高。

堿基編輯器：CBE：胞嘧啶堿基編輯器(Cytosine base editor，CBE)，依賴于胞嘧啶核苷脫氨基酶，通過將胞嘧啶核苷脫氨轉換為尿嘧啶核苷，尿嘧啶核苷在DNA復制和修復過程中會轉換為胸腺嘧啶核苷，從而實現C到T的轉換。已開發出四代CBE（BE1、BE2、BE3和BE4），由于BE3引起的脫靶效應相對較少，因此它已在動物（小鼠）、細菌和植物細胞中廣用于編輯細胞的基因組成。腺嘌呤堿基編輯器(Adenine base editor，ABE)，依賴于腺嘌呤核苷脫氨基酶，通過將腺嘌呤核苷脫氨轉換為次黃苷，然后在DNA復制和修復過程中會轉換為鳥嘌呤核苷，從而實現腺嘌呤(A)到鳥嘌呤(G)的轉換。新開發的堿基編輯器ABE8e，比ABE7.10增加了590倍的靶向活性。

細胞外檢測方法：細胞外檢測方法較為直接，將基因組提純后進行CRISPR體外切割實驗，再捕獲發生脫靶切割的位點即可。1) Digenome-seqDigenome-seq是較早提出的一類細胞外脫靶位點檢測方法，提純的基因組DNA被Cas9/sgRNA切割后，再經過標準的全基因組測序流程獲得測序數據，之后需要較為復雜的生物信息學分析才能夠獲得CRISPR切割位點的信息。總體來講，這種方法測序成本較高，并且檢測靈敏度也有限。2)SITE-seq為了有效檢測到低頻脫靶位點，一般需要在建庫時定向捕獲CRISPR切割位點。SITE-seq就是這樣一種測序方法，提純的基因組DNA經過Cas9/sgRNA切割后，在切割位點末端連接帶Biotin的接頭；再隨機打斷基因組，在另一端連接第二個接頭；經過鏈霉親和素磁珠純化，只有一輪被Cas9切割的DNA才能夠被純化并測序，實現了CRISPR切割位點的富集。該方法雖然提高了脫靶位點的檢測靈敏度，但有著較高的實驗要求，每次需要投入大量的基因組DNA，并且無法區分提純基因組DNA時發生的隨機斷裂和Cas9的切割，導致產出較為明顯的背景信號。同時，由于一輪Biotin接頭只會接在Cas9切割位點的一側，導致測序結果里只能看到脫靶位點一側的序列。基因編輯脫靶檢測，推薦唯可生物，實驗實力強，專業性高，檢測效率高，結果準確率高。

gRNA的長度和錯配： 17個核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下，18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細胞中減少潛在脫靶效應的指導方針：1) 應避免在PAM的7-10 bp范圍內靶序列有超過3個錯配；2) 在PAM的12 bp內，應避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應。gRNA的化學修飾：在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦酰基乙酸酯會導致位點特異性修飾，使脫靶切割減少40-120倍，同時保持靶向性能。gRNA上游5'發夾結構的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性，降低脫靶效應。脫靶檢測評估標準，推薦唯可生物，實驗實力強，專業性高，檢測效率高，結果準確率高。無錫定量脫靶檢測評估

脫靶切割位點已在基因編輯技術,CRISPR / Cas9,ZFNs和TALEN。北京種子脫靶檢測評估

目前鼓潤已掌握了該項技術，簡述如下：1、CRISPR與dsODNtag整合的實驗技術及高通量測序建庫流程將靶向于目標基因組位點的CRISPR質粒與dsODNtag以核電轉的方式同時轉染入真核細胞，CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后，dsODNtag將整合入斷點處，作為后續分析在靶與脫靶情況的標記。轉染后3天收集細胞的DNA進行高通量建庫。2、GUIDE-seq生信分析方法1）搭建了高通量測序的數據分析流程。2）利用該技術分析了CRISPR靶向編輯某細胞系基因的在靶與脫靶情況。其中一例樣品的分析結果如圖4所示：Sequencesofoff-targetsitesidentifiedbyGUIDE-seq.Theintendedtargetsequenceisshowninthetoplinewithcleavedsitesshownunderneathandwithmismatchestotheon-targetsiteshownandhighlightedincolor.GUIDE-seqsequencingreadcountsareshowntotherightofeachsite.3）利用PCR擴增技術聯合Sanger測序鑒定了分析出的脫靶位點。北京種子脫靶檢測評估