代謝組學概念:基因與蛋白質的表達緊密相連,而代謝物則更多地反映了細胞所處的環境,這又與細胞的營養狀態,藥物和環境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關。因此有人認為,“基因組學和蛋白質組學告訴你什么可能會發生,而代謝組學則告訴你什么確實發生了。”代謝組學的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內所有的低分子量代謝產物,代謝組學則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內所有低分子量代謝產物同時進行定性和定量分析的一門新學科。它是以組群指標分析為基礎,以高通量檢測和數據處理為手段,以信息建模與系統整合為目標的系統生物學的一個分支。靶向代謝組學著重對于設定好的目標代謝物進行定性、量檢測分析和研究。廣東非靶向代謝組學
代謝組學是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內源性代謝物質的代謝途徑及其所受內在或者外在因素的影響及隨時間變化的規律。代謝組學通過揭示內在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發生的一系列生物事件。代謝組學在系統生物學的末端。以人體為例,對基因序列信息研究是基因組學的范疇。轉錄組學研究基因在外在或內在環境刺激下不同的表達。基因信息翻譯成蛋白質后,各種蛋白的形狀、功能、相互關系是蛋白組學的研究范疇。各種營養物質經過人體的消化、代謝后的代謝物,就是代謝組學的研究范圍。深圳非靶向代謝組學研究方法代謝組學在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。
LC-MS非靶向代謝組學:LCMS非靶向是通過液質聯用(LC–MS)方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產物的動態變化,從中找出表達差異的代謝物,進而闡明生物體代謝相關過程的代謝組學技術。LCMS非靶向代謝組學適用于分析難揮發或熱穩定性差的代謝產物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實現了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯質譜儀在MS掃描模式下,可實現高低碰撞能量快速切換,同時采集代謝物的一二級質譜信息,結合代謝組學數據處理軟件對質譜信息的解析,在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。
代謝組學樣品收集方法及所需樣本量是什么?(1) 血清樣品: 避免反復凍融。血液收集在離心管中靜置30分鐘進行凝血。8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存;單個樣本要求體積為50μL。(2) 尿液樣品:臨床樣本請全部取清晨第1次尿液。尿液直接分裝到離心管中,8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存,-80度凍存;單個樣本要求體積為100μL。(3) 其他樣本收集辦法請咨詢譜領工作人員。代謝組學技術可應用于病因病機研究。
代謝組學有哪些研究方式?根據有沒有研究目標或方向來確定,在不確定代謝物或者代謝途徑時可使用非靶向代謝組學尋找切入點,在有目標時則使用靶向定量進行深入研究,針對性研究脂質的則可以使用脂質組學技術。另外比較新的,譜領生物還提供基于穩定性同位素示蹤技術的代謝流組學技術服務來研究代謝流量問題。什么是代謝組學?代謝組學是末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內源性代謝物質的代謝途徑及其所受內在或者外在因素的影響及隨時間變化的規律。代謝組學通過揭示內在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發展過程。代謝組學技術可應用于疾病早期診斷。江蘇靶向代謝組學技術服務
與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。廣東非靶向代謝組學
代謝組學疾病診斷應用: 代謝組學研究人員已經對此進行了研究。新生兒是否缺失酶基因,可以在出生時就檢測出來。可檢測出包括涉及合成途徑中的基本成分(如氨基酸)的酶。酶缺失的結果就是相應的代謝產物過少或過多。尿癥(PKU)是一種常見的嬰兒疾病。這種疾病是由于缺失將苯丙氨酸水解成酪氨酸所必須的苯丙氨酸水解酶基因,導致血液中苯丙氨酸累積造成的。若是不能及時檢測出這種天生的代謝缺乏,在嬰兒出生后九個月內,就會引起無法挽救的大腦損傷。這種疾病通過簡單的血樣和尿素化驗就可以確診。而血樣和尿素化驗以后也將成為代謝指紋研究方法的一部分。像尿癥那樣的疾病,研究人員正試圖從疾病的生物化學基礎著手,而不是只有檢測生物標記物。他們希望通過代謝組學,可以找到更好的方法去治這些疾病。廣東非靶向代謝組學
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