代謝組學樣本收集注意事項:(1)血液離開動物或人體后,應盡快開展血清、血漿的分離,并嚴格按照操作說明進行。(2)采集到的血清為黃色透明液體、血漿為淡黃色半透明液體,如果發現樣本中是紅色,說明在已經發生了了溶血現象,樣本需重新制備。(3)血清與血漿的主要區別在于血清中不含纖維蛋白原。血清和血漿中脂質,氨基酸,核苷酸等代謝譜存在差別。糞便樣本收集:1.人糞便:(1)用無菌勺挖取新鮮的,排泄中后部的內側糞便(避免尿液及其他壁對樣本污染);(2)分裝樣本20mg/管。(3)迅速放入液氮中冷凍處理至少15min.(4)-80℃冰箱凍存。寄樣需足量干冰。靶向代謝組學(Trgeted metabolomics)則為目標性代謝組學。上海動物靶向代謝組學檢測價格
代謝組學什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學研究。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細胞和微生物、培養液和發酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發生變化,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態,因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請參照譜領生物樣本收集步驟文件。上海農學靶向代謝組學質譜鑒定代謝組學技術可應用于疾病早期診斷。
代謝組學樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時,在中午光照好的時間收集。(2)采集樣本時保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養基或營養液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。
代謝組學比較常用到的數據分析方法:代謝組學分析數據用于統計分析時,數據集通常為一個N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個樣本數,每一行表示一個樣品, K表示K個變量,每一列表示一個變量,在代謝組學中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個變量,不考慮多個變量的相互作用與內在聯系。具有簡單性、易應用性和可解釋性。但是無法基于整體數據對所測樣品的優劣、差異進行綜合評價和分析。差異倍數變化大小(Fold Change,FC)表示實驗組與對照組的含量比值,可以快速考察各個代謝物在不同組別之間的含量變化大小。代謝組學技術可應用于藥物毒理學。
代謝組學應用方向:腸道菌群代謝組學,運用代謝組學檢測腸菌代謝物的動態變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態,直觀的研究腸道菌群與疾病發生的發展的關系,為疾病的預防,調高宿主的健康水平提供新的思路。經典脂質組學:對生物體、組織或細胞中的脂質以及與其相互作用的分子進行全方面系統的鑒定分析。了解脂質的結構和功能,揭示脂質代謝與細胞乃至機體的生理、病理過程之間的關系,普遍運用于分子生理學、功能基因組學以及環境與健康等重要領域。代謝組學主要技術手段是核磁共振。上海農學靶向代謝組學質譜鑒定
代謝組學有哪些特點?上海動物靶向代謝組學檢測價格
靶向代謝組學:靶向代謝組學(Targeted Metabolomics)是代謝組學研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強,檢測靈敏度高和定量準確等幾個特點。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準確定量定性分析,一方面可以結合其它實驗數據揭示相關的分子生物學作用機制,另一方面,也可以為后續代謝分子標志物的深入研究和開發利用提供有力支持。靶向代謝組學可以用于:驗證有非靶向代謝組學實驗提出的假說;進行基于假說的探索性實驗,針對特定代謝物,研究代謝模型。上海動物靶向代謝組學檢測價格
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