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武漢非靶向代謝組學技術服務

來源: 發布時間:2022-01-15

靶向代謝組學:靶向代謝組學(Targeted Metabolomics)是代謝組學研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強,檢測靈敏度高和定量準確等幾個特點。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準確定量定性分析,一方面可以結合其它實驗數據揭示相關的分子生物學作用機制,另一方面,也可以為后續代謝分子標志物的深入研究和開發利用提供有力支持。靶向代謝組學可以用于:驗證有非靶向代謝組學實驗提出的假說;進行基于假說的探索性實驗,針對特定代謝物,研究代謝模型。代謝組學是系統生物學的組成部分。武漢非靶向代謝組學技術服務

代謝組學研究方法:代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜峰,然后了解不同化合物的結構,建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析(metabolomic profiling),研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進行更深入的研究。上海動物靶向代謝組學鑒定什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學?

代謝組學究竟是一門什么樣的研究方向?首先定義什么是代謝組學。簡單的說就是研究生物體對內外刺激的整體代謝應答規律。那么為什么代謝組學是基因組,轉錄組,蛋白質組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向,的執行者蛋白質中很多酶參與了體內的代謝過程。基因測序數量太大,而且基因水平解釋問題往往很吃力。因為基因的調控和生物學事件之間隔了一個很漫長的信號轉導過程。蛋白同理,一是蛋白種類巨大,二是蛋白組學發展進入瓶頸;發展代謝組是因為代謝物種類只有不到1w種,建立它的差異分析更加簡單,同時在價格等方面更有推廣的意義。

藥物代謝和代謝組學區別:代謝組學與藥物代謝不同是它關注的對象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內源性代謝物。這些代謝物是糖,脂肪,蛋白質,核酸,膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的,是一個龐大的混合物。目的是通過樣本的對比,發現潛在標志物,指導疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內變化就好,相當具有靶向性,因此使用的技術手段就是LC-MS。檢測藥物的中間體,和具體的藥效,藥代動的效應。與其他“組學”研究相比,代謝組學的費用更低。

代謝組學比較常用到的數據分析方法:多變量分析:多變量分析方法能同時處理數百或數千個變量,并且能處理變量之間的相互關系。利用變量之間的協方差或相關性,使原始數據在較低維空間上的投影能盡可能地捕獲數據中的信息。但是如果存在大量無信息變量可能會妨礙多變量分析的能力,無信息變量的數量越多,減少真陽性數量的效果就越明顯。多變量分析分為無監督分析方法和有監督分析方法。在代謝組學分析中無監督學習有主成分分析只需要數據集X,而有監督分析方法主要是偏比較小二乘判別分析和正交偏比較小二乘判別分析,這類方法在分析時除了需要數據集X,還需對樣品進行指定并分組, 這樣分組后模型將自動加上另外一個隱含的數據集Y,通常Y的賦值用-1/1或者0/1表示類別信息。代謝組學的研究介于基因、蛋白質和細胞、組織之間。脂質代謝組學多研究

代謝組學技術可應用于疾病早期診斷。武漢非靶向代謝組學技術服務

代謝組學樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時,在中午光照好的時間收集。(2)采集樣本時保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養基或營養液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。武漢非靶向代謝組學技術服務

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