單細胞轉錄組學技術：單細胞轉錄組目前主要有三種方法：SMART擴增技術、10×genomics技術及Andeplete技術。SMART擴增技術比較關鍵的技術，就是設計了2個特殊的引物。再配合用MMLV逆轉錄酶進行逆轉錄。特殊引物1由中間PolyT序列加上一段通用序列及3’末端兩個簡并堿基構成，但在PolyT的3’端倒數第二個堿基是A、C、G而非T的簡并堿基，而倒數第1個為簡并堿基，這樣做的好處是讓它正好結合在mRNA的3’端連到Poly(A)尾巴的這個連接處，而不會結合到mRNA的別的地方。這樣就保證了逆轉錄的起始位置正好是mRNA的3’端的序列終止位置。MMLV逆轉錄酶，這個酶有個特點，就是它在轉錄到mRNA的5’端末端的時侯，會在新合成的cDNA的3’末端，多加出幾個C堿基來。轉錄組具有時間特異性的特點。江蘇靶向轉錄組學分析鑒定

轉錄組學研究的方法：在早期，由于測序價格昂貴、基因序列數目有限，轉錄組學研究者只能進行極少數特定基因的結構功能分析和表達研究。近十幾年，分子生物學技術的快速發展使高通量分析成為可能，這為真正意義上的轉錄組學的研究奠定了基礎。這些高通量研究方法主要可以分為兩類：一類是基于這類方法包括表達序列標簽技術、基因表達系列分析技術、大規模平行測序技術、RNA測序技術其中，Microarray和EST技術是較早發展起來的先驅技術，SAGE、MPSS和RNA-sea是高通量測序條件下的轉錄組學研究方法轉錄組學研究有助于了解特定生命過程中相關基因的整體表達情況，進而從轉錄水平初步揭示該生命過程的代謝網絡及其調控機理。濟南mRNA-seq轉錄組學技術服務相對于傳統的芯片雜交平臺，轉錄學組測序無需預先針對已知序列設計探針。

轉錄組是干什么用的，和表達譜有什么區別？轉錄組，指細胞某一時期所有基因的轉錄水平。轉錄組學，是一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調控規律的學科。簡而言之，轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。對RNA的分析。分析應該是分幾個維度的DNA到RNA，RNA的剪切拼接，RNA的翻譯。表達譜有兩種，分別是基因表達譜和蛋白質表達譜。基因表達譜是指細胞中所有基因表達的格局。通過比較分析基因表達譜，可從整體水平研究代謝機制，認識基因相互作用的網絡關系，發現重要基因。

轉錄組學應用領域：農林領域：生長發育機制，抗逆脅迫機制，育種，物種保護研究等；畜牧業：生長發育機制，致病機理研究，肉類及乳制品品質研究等；海洋水產：生長發育機制，漁業資源，漁業環境與水產品安全等；微生物：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；生物醫藥：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，藥物開發，個性化醫治等；環境科學：發酵過程優化，生物燃料生產，環境危害風險評估研究等；食品科學：食品儲藏及加工條件優化，食品組分及品質鑒定，功能性食品開發，食品安全監檢測等。轉錄組具有組織特異性的特點。

RNA-Seq轉錄組學技術優勢：RNA-seq技術可以檢測到低水平表達、未識別的轉錄子和新拼接亞型基因。另一方面，與基因芯片相比，RNA-Seq有一個更廣的檢測動態范圍，可以研究編碼和非編碼RNA，更易于基因網絡的構建、發現選擇性剪切轉錄物，檢測到等位基因的具體表達方式，也可以用來提取基因型信息。在RNA-Seq單細胞研究中，一個主要優勢是可以分析整個轉錄序列，而不是有限制數量的基因，并且，研究DNA和RNA的方法并不是相互排斥的，他們可以相互結合使用，產生更多的生物學上重要的信息。轉錄組學無需了解物種基因信息，能夠直接對任何物種進行轉錄組分析。濟南mRNA-seq轉錄組學技術服務

轉錄組學可應用于表達差異的研究。江蘇靶向轉錄組學分析鑒定

單細胞轉錄組學技術：Anydeplete技術首先通過隨機引物進行一鏈合成，一鏈合成引入核苷酸類似物，用于酶切打斷，二鏈合成同樣引入核苷酸類似物用于保證鏈特異性。然后兩端加上接頭，接頭一條鏈也帶有核苷酸類似物，用于酶切降解。當形成單鏈文庫后，設計特異性引物與rRNA形成文庫結合，一輪退火延伸，rRNA文庫形成雙鏈結構。Reverseadaptor上帶有特異的酶切位點，當形成雙鏈結構酶切位點被識別，切去接頭，這樣rRNA形成的文庫不帶有完整的接頭，而其他文庫帶有完整接頭，通過PCR擴增富積既能得到想要的信息，包含mRNA及LncRNA信息。同樣Anydeplete技術與10×genomics技術一樣，包含分子標簽，可分析duplication及PCR產生突變位點。江蘇靶向轉錄組學分析鑒定

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