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四川甲基化修飾蛋白質組學方法

來源: 發布時間:2022-01-11

蛋白質翻譯后修飾組學:翻譯后修飾自下而上分析策略:自下而上蛋白質組學是一種基于肽段分析的技術。對于不同類型的翻譯后修飾,具體的分析策略存在差異。蛋白質的糖基化具有異質性。不同的糖鏈可以連接到同一位點上,不同位點可以連接到同一蛋白質上的不同糖鏈上。糖基化的異質性嚴重阻礙了糖蛋白的分離和分析。不同糖類型的相同蛋白質,在電泳上會出現分散的條帶,導致信號分散。此外,對低豐度蛋白質的識別性差導致糖蛋白在色譜圖中分離不佳,質譜中有一簇分子量不準確的分辨不清的峰。目前,蛋白糖基化研究的主要策略是利用現有的技術體系對糖基化蛋白的糖基化肽段進行分離和富集,消除糖基化的異質性及其對質譜的影響,標記糖基化位點。質譜可以分辨蛋白質修飾前和修飾后分子量上的變化。四川甲基化修飾蛋白質組學方法

蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率:被修飾的蛋白質的百分比低,則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識別修飾位點。棕櫚酰化蛋白修飾質譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M蛋白質與細胞膜的結合。蛋白質可以由一個棕櫚?;M成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質,如豆蔻?;?。由于對S-棕櫚?;鞍追治鋈匀痪哂刑魬鹦?,由于S-棕櫚?;揎椀鞍讈喫揭约笆杷院蜐撛诓环€定的硫代質鏈的S-脂?;摹,F在常用的幾種方法可以捕獲S-脂?;鞍滓约皩δ繕诵揎椀鞍走M行捕獲。山東丙?;揎椀鞍踪|組學分析研究蛋白質磷酸化修飾怎么定義?

蛋白質乙?;揎椂x:蛋白質在細胞中經過翻譯后,到被運輸到相應的細胞器并且發生特定的生物學作用前會經過很重要的一步加工,那就是蛋白質翻譯后修飾加工。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的活性、定位或功能。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。常見的蛋白質翻譯后修飾包括磷酸化,乙酰化,糖基化,泛素化等。蛋白質乙?;揎?,顧名思義指的就是在蛋白質原有基礎上面嫁接上乙?;鶊F。在細胞中,乙酰化修飾的反應由乙?;D移酶所催化,將乙酰輔酶A的乙?;D移并添加在蛋白質賴氨酸殘基上。在早期的研究中,乙?;揎椧恢北徽J為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾,直到后來研究發現原核細胞中年也存在著蛋白質乙?;揎?。所以,乙酰化修飾是原核和真核生物所共有的一種翻譯后修飾類型。

蛋白磷酸化檢測方法:一、Western Blot檢測方法優勢:1. WB方法簡便,多數實驗室具備Western Blot設備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏,能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白,可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集,再進行WB檢測被磷酸化的蛋白,檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質譜檢測方法:Western Blot的方法雖然簡便,但是對于大規模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質譜儀,如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠,或者2D-PAGE膠等分離目標蛋白,將含有目標蛋白的條帶切下,胰酶消化,LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標蛋白的磷酸化水平。乙酰化修飾是原核和真核生物所共有的一種翻譯后修飾類型。

質譜分析蛋白翻譯后修飾原理:相較于沒有發生翻譯后修飾的蛋白,翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質譜分析過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質譜進行分析;通過質譜分析,得到的是一系列肽段的相對分子質量信息。對于某一個特定的肽段而言,在沒有發生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的,當它發生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,因為磷酸根的分子量也是確定的,所以在質譜檢測過程中如果發現部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,則可以假設這個肽段發生了磷酸化修飾,再通過二級或多級質譜的譜圖進行二次確認即可實現翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點分析等。在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質譜進行分析。山東丙?;揎椀鞍踪|組學分析研究

乙酰化修飾對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著非常重要的作用。四川甲基化修飾蛋白質組學方法

蛋白質乙酰化修飾組學技術:乙酰化修飾是體內保守的可逆轉的蛋白修飾,對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著重要的作用。此外,還存在的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調節。采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙酰化鑒定的影響,再結合免疫共沉淀通過抗體富集乙酰化的肽段,從而實現乙?;蔫b定及定量。樣品要求:1、SDS-PAGE條帶:5個以上可見考染條帶。2、溶液(目標蛋白質):目標蛋白總量>50μg,目標蛋白濃度>80%。3、溶液(大規?;旌系鞍踪|):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl。四川甲基化修飾蛋白質組學方法

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