代謝組學介紹：通過液質聯用（LC-MS）方法檢測生物體受外界刺激前后體內大多數小分子代謝物的動態變化，重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物，進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系，其研究對象大多是分子量1500Da以內的小分子物質。技術優勢：較高的靈敏度、分辨率；較寬的動態范圍；適合對標本中未知代謝物的探索研究；適合于生物樣本中復雜代謝產物的檢測和潛在標志物的鑒定。代謝組學應用方向： 土壤代謝組學。研究土壤中有機質及土壤微生物代謝含量變化及相互作用，了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力，為探索調節、控制和改善土壤環境質量提供重要的參考。代謝組學技術可應用于病因病機研究。四川非靶向代謝組學分析鑒定

代謝組學研究方法：代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜峰，然后了解不同化合物的結構，建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析（metabolomic profiling）,研究人員假定了一條特定的代謝途徑，并對此進行更深入的研究。南京個性化定制靶向代謝組學技術分析代謝組學是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產物進行定性和定量分析的一門新學科。

靶向代謝組學分析成功的關鍵因素是準確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學鑒定一般采用 GC/MS 系統的選擇性離子監測 (SIM)，或在三重串聯四極桿 LC/MS 系統上用多反應離子監測 (MRM) 進行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度，在單四極桿質譜中,這種靈敏度增強的原因是延長了所選擇離子的采集時間。因為監測的是一個很小的質量窗口，所以質量色譜圖只表示對極為特定質量的檢測。在大多數情況下，靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進行質譜定量的選擇方法，與 SIM 相比更為靈敏、更加特異。可以產生獨特的碎片離子，可對非常復雜基質中的目標化合物進行監測和定量。

如何獲得高質量GC/MS代謝組學數據？實驗設計先不談，在儀器分析階段，若想獲得高質量數據，有以下幾個方面需要注意。1）前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此，一個項目應當只由一個人負責前處理。推薦使用自動衍生設備，以減少人為的誤差。2）檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態。儀器的控制軟件都有系統自檢功能，可以快速便捷地核查質譜儀器的狀態。但更重要的是氣相色譜狀態，推薦使用一組混標作為儀器質控。在每一個項目開始之前，先進行質控樣檢測，確認氣相色譜的分離度和質譜的整體響應。3）后期數據矯正，特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質控樣本（每個樣品取少量后混合），在后期數據處理時，使用質控樣本結合如LOESS之類的算法對整體數據進行矯正。代謝組學作為系統生物學的一個重要的分支，與其他組學相比有著其特有的優勢。

代謝組學比較常用到的數據分析方法：多變量分析：多變量分析方法能同時處理數百或數千個變量，并且能處理變量之間的相互關系。利用變量之間的協方差或相關性，使原始數據在較低維空間上的投影能盡可能地捕獲數據中的信息。但是如果存在大量無信息變量可能會妨礙多變量分析的能力，無信息變量的數量越多，減少真陽性數量的效果就越明顯。多變量分析分為無監督分析方法和有監督分析方法。在代謝組學分析中無監督學習有主成分分析只需要數據集X，而有監督分析方法主要是偏比較小二乘判別分析和正交偏比較小二乘判別分析，這類方法在分析時除了需要數據集X，還需對樣品進行指定并分組, 這樣分組后模型將自動加上另外一個隱含的數據集Y，通常Y的賦值用-1/1或者0/1表示類別信息。代謝組學主要技術手段是核磁共振。貴陽LC-MS／MS非靶向代謝組學分析方法

代謝組學作為系統生物學的重要組成部分，在臨床醫學領域具有普遍的應用前景。四川非靶向代謝組學分析鑒定

代謝組學樣本收集注意事項：（1）血液離開動物或人體后，應盡快開展血清、血漿的分離，并嚴格按照操作說明進行。（2）采集到的血清為黃色透明液體、血漿為淡黃色半透明液體，如果發現樣本中是紅色，說明在已經發生了了溶血現象，樣本需重新制備。（3）血清與血漿的主要區別在于血清中不含纖維蛋白原。血清和血漿中脂質，氨基酸，核苷酸等代謝譜存在差別。糞便樣本收集：1.人糞便：（1）用無菌勺挖取新鮮的，排泄中后部的內側糞便（避免尿液及其他壁對樣本污染）；（2）分裝樣本20mg/管。（3）迅速放入液氮中冷凍處理至少15min.（4）-80℃冰箱凍存。寄樣需足量干冰。四川非靶向代謝組學分析鑒定

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