轉錄組學技術路線及研究意義：轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。相對于傳統的芯片雜交平臺，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更準確的數字化信號，更高的檢測通量以及更普遍的檢測范圍，是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。基于高通量測序平臺的轉錄組測序技術能夠全方面獲得物種特定組織的轉錄本信息，從而進行基因表達水平研究、新轉錄本發現研究、轉錄本結構變異研究等。轉錄組學無需了解物種基因信息，能夠直接對任何物種進行轉錄組分析。山東高通量轉錄組學研究

單細胞轉錄組學技術：Anydeplete技術首先通過隨機引物進行一鏈合成，一鏈合成引入核苷酸類似物，用于酶切打斷，二鏈合成同樣引入核苷酸類似物用于保證鏈特異性。然后兩端加上接頭，接頭一條鏈也帶有核苷酸類似物，用于酶切降解。當形成單鏈文庫后，設計特異性引物與rRNA形成文庫結合，一輪退火延伸，rRNA文庫形成雙鏈結構。Reverseadaptor上帶有特異的酶切位點，當形成雙鏈結構酶切位點被識別，切去接頭，這樣rRNA形成的文庫不帶有完整的接頭，而其他文庫帶有完整接頭，通過PCR擴增富積既能得到想要的信息，包含mRNA及LncRNA信息。同樣Anydeplete技術與10×genomics技術一樣，包含分子標簽，可分析duplication及PCR產生突變位點。杭州宏轉錄學組技術轉錄組學無需預先設計特異性探針。

RNA-Seq轉錄組學技術優勢：相比基因芯片和標記的堿基序列的測序方法，RNA-seq具有一定的優越性。與基因芯片相比，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用來測量基因的表達水平情況，還可以揭示未知的轉錄組和拼接亞型，并為選擇性拼接亞型提供定量分析。相對于傳統的芯片雜交平臺，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更精確的數字化信號、更高的檢測通量以及更普遍的檢測范圍，是目前深入研究復雜性轉錄組的強大工具。鑒于這些優勢，RNA-Seq很快就被應用到關于瘤病相關研究的多個方面。

轉錄組學測序比其他研究方法有哪些優勢?轉錄組學測序具有以下優勢：（1）可以直接測定每個轉錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度，同時不存在傳統微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題；（2）靈敏度高，可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本；（3）可以對任意物種進行全基因組分析，無需預先設計特異性探針，因此無需了解物種基因信息，能夠直接對任何物種進行轉錄組分析，同時能夠檢測未知基因，發現新的轉錄本，并準確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區域。（4）檢測范圍廣，高于6個數量級的動態檢測范圍，能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。轉錄組學分析轉錄本的結構和表達水平的同時，還能發現未知轉錄本和稀有轉錄本。

宏轉錄組學也稱為環境轉錄組學，指從整體水平上研究某一特定環境、特定時期菌群群體全部基因轉錄情況以及轉錄調控規律，以揭示微生物在不同環境壓力下的適應機制，探索環境與微生物之間的相互作用機理。其適用范圍包括人體微生態、環境、工業、農業等領域。宏轉錄組學以生態環境中的全部RNA為研究對象，避開了微生物分離培養困難的問題，能有效的擴展微生物資源的利用空間。應用領域：包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物。轉錄組學能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。廣州全轉錄學組分析

基于高通量測序平臺的轉錄組學測序技術能夠全方面獲得物種特定組織的轉錄本信息。山東高通量轉錄組學研究

轉錄組學和基因組學目前有實用價值嗎?二者實用價值非常大，尤其是對有瘤的患者的醫治，簡直顛覆了傳統醫治的模式。轉錄組和基因組月在生物學研究中有著重要價值。例如研究某個基因功能的時候，可以構建該基因的敲除或者過表達生物，然后對比野生型進行轉錄組分析看看該基因涉及什么表達網絡。此外在醫學方面的應用也很大，例如在有的瘤病人中進行基因組學測序和分析能夠了解其中的發生的發展的驅動基因，然后能根據發展的驅動基因研究靶向藥物，從而推動瘤的藥物研發和醫治！山東高通量轉錄組學研究

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