代謝組學研究方法：代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜峰，然后了解不同化合物的結構，建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析（metabolomic profiling）,研究人員假定了一條特定的代謝途徑，并對此進行更深入的研究。代謝組學作為系統生物學的一個重要的分支，與其他組學相比有著其特有的優勢。常規靶向代謝組學領域

代謝組學：代謝組學 （metabolomics）的出現是生命科學研究的必然。是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產物進行定性和定量分析的一門新學科。代謝組作為系統生物學的重要組成部分，在臨床醫學領域具有普遍的應用前景。 代謝產物是基因表達的產物，在代謝酶的作用下生成。雖然與基因或蛋白質相比，代謝產物較小，但是不能形成代謝產物的細胞是死細胞，因此不能小看代謝產物的重要性。 研究人員通過對機體代謝產物的深入研究，可以判斷機體是否處于正常狀態，而對基因和蛋白質的研究都無法得出這樣的結論。事實上，代謝組學研究已經能診斷出一些代謝類疾病，如糖尿病、肥胖癥，代謝綜合癥。目前，已經研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環（TCA），糖酵解，花生四烯酸 （AA）/炎癥途徑。杭州個性化定制靶向代謝組學定性分析代謝組學技術可應用于病因病機研究。

如何獲得高質量GC/MS代謝組學數據？實驗設計先不談，在儀器分析階段，若想獲得高質量數據，有以下幾個方面需要注意。1）前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此，一個項目應當只由一個人負責前處理。推薦使用自動衍生設備，以減少人為的誤差。2）檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態。儀器的控制軟件都有系統自檢功能，可以快速便捷地核查質譜儀器的狀態。但更重要的是氣相色譜狀態，推薦使用一組混標作為儀器質控。在每一個項目開始之前，先進行質控樣檢測，確認氣相色譜的分離度和質譜的整體響應。3）后期數據矯正，特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質控樣本（每個樣品取少量后混合），在后期數據處理時，使用質控樣本結合如LOESS之類的算法對整體數據進行矯正。

代謝組學需要多少的生物學重復？生物學重復指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數量（如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本）。相較于基因和蛋白，代謝物處于生命活動的下游，收到環境和遺傳背景等因素影響較大，生物學重復少可能會放大組內差異對于整體差異的影響，進而影響結果（如準確和足夠多的找出生物標志物）。因此根據不同的生物類型，需要不同的生物學重復來增加數據的可靠性和說服力。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似。代謝組學是系統生物學的組成部分。

代謝組學什么類型的樣本更適合，樣本采集需要注意什么？絕大多數可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學研究。常見的樣本主要有：臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液；細胞和微生物、培養液和發酵液；植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發生變化，我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態，因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的，采集后通過低溫淬滅（如液氮淬滅或低溫凍存等）的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外，不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法，具體步驟請參照譜領生物樣本收集步驟文件。代謝組學主要研究的是產物的小分子代謝物（MW<1000）。深圳常規靶向代謝組學服務

代謝組學的研究處于生物信息流的中游。常規靶向代謝組學領域

什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學？(1) 非靶向代謝組學（Untargeted metabolomics）即非目標代謝組學或發現代謝組學，無偏向性地對所有小分子代謝物（一般相對分子量小于1000）同時進行檢測分析的代謝組學。(2) 靶向代謝組學（Trgeted metabolomics）則為目標性代謝組學，著重對于設定好的目標代謝物進行定性、量檢測分析和研究。相比于其他組學，代謝組學有哪些特殊的優勢？系統生物學有基因組學、轉錄組學、蛋白組學和代謝組學。代謝組學作為系統生物學的一個重要的分支，與其他組學相比有著其特有的優勢，主要體現在以下幾點：(1) 基因與蛋白質表達的微小變化會在相應代謝物水平上得到放大，更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關性。常規靶向代謝組學領域

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