轉錄組學，基因組學，蛋白質組學的區別：蛋白組學針對的是全體蛋白，組要以2D-Gel和質譜為主，分為top-down和bottom-up分析方法。理念和基因組類似，將蛋白用特定的物料化學手段分解成小肽段，在通過質量反推蛋白序列，之后進行搜索，標識已知未知的蛋白序列。轉錄組學研究的是某個時間點的mRNA總和，可以用芯片，也可以用測序。芯片是用已知的基因探針，測序則有可能發現新的mRNA。基因組學研究的主要是基因組DNA，使用方法目前以二代測序為主，將基因組拆成小片段后再用生物信息學算法進行迭代組裝。當然這只是第1步，隨后還有繁瑣的基因注釋等數據分析工作。轉錄組學檢測范圍廣，高于6個數量級的動態檢測范圍。濟南IncRNA轉錄組學定性分析
單細胞轉錄組學技術：10×genomics技術：首先在凝膠微珠上種上特定的DNA的片段，DNA的片段由三部分組成：Barcode、UMI、PolyT組成。Barcode是16個堿基的長度。一共有400萬種Barcode，一個微珠是對應于一種Barcode，通過這400萬種Barcode，可以把凝膠微珠給區分開（通過barcode可以把cell分開）。UMI是一段隨機序列，也就是說每一個DNA分子，都有自己的UMI序列（一個微珠上有很多種UMI，通過UMI可以把RNA分子分開，并可以標記RNA分子的數量）。10個堿基長的UMI，有100萬種序列的變化（4^10=1,048,576），UMI的作用是為了區分哪些reads是來自于一個原始cDNA分子區分基因片段重復還是duplication及區分是真實的SNP位點還是PCR產生的突變。通過10×genomics儀器將單個細胞與單個凝膠微珠通過油相混在一起，形成油包水的小微滴。湖北高通量轉錄組學研究轉錄組學測序比其他研究方法有哪些優勢?
轉錄組學測序比其他研究方法有哪些優勢?轉錄組學測序具有以下優勢：（1）可以直接測定每個轉錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度，同時不存在傳統微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題；（2）靈敏度高，可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本；（3）可以對任意物種進行全基因組分析，無需預先設計特異性探針，因此無需了解物種基因信息，能夠直接對任何物種進行轉錄組分析，同時能夠檢測未知基因，發現新的轉錄本，并準確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區域。（4）檢測范圍廣，高于6個數量級的動態檢測范圍，能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。
circRNA轉錄組學成環機制：circRNA環化方式分為內含子環化和外顯子環化。目前主流的成環機制可歸類為：依賴于剪切體的索尾插接環化。在mRNA前體上，通過連續的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點連接到上游的3′受體的位點，索尾插接形成環化，然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進circRNA形成。部分circRNA外顯子兩側的內含子中含有反向互補序列，首先在剪切位點上并排形成RNA雙鏈體，再通過可變剪切形成帶內含子和不帶內含子兩種不同的circRNA。或者外顯子內部以及兩側的內含子可以競爭進行RNA配對，然后通過可變剪切形成不同類型的circRNA。什么是轉錄組學測序？
轉錄組分析是目前應用比較廣的高通量測序分析技術之一。常見設計是不同樣品之間比較，尋找差異基因、標志基因、協同變化基因、差異剪接和新轉錄本，并進行結果可視化、功能注釋和網絡分析等。轉錄組的測序分析也相對成熟，從RNA提取、構建文庫、上機測序再到結果解析既可以自己完成，又可以在專業公司進行。概括來看轉錄組的分析流程比較簡單，序列比對-轉錄本拼接(可選)-表達定量-差異基因-功能富集-定制分析。整個環節清晰流暢，可以作為剛開始接觸高通量測序學習比較合適的技術之一。轉錄組學無需預先設計特異性探針。上海circ RNA轉錄組學服務
轉錄組學可應用于表達差異的研究。濟南IncRNA轉錄組學定性分析
什么是轉錄組學測序？轉錄組廣義上指在某一生理條件下，細胞內所有轉錄組產物的組合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狹義上指所有mRNA的組合。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，主要包括mRNA和ncRNA。轉錄組具有時間特異性、組織特異性、空間特異性等特點。無參轉錄組和有參轉錄組的區別？如果所研究的物種有組裝注釋質量較好基因組序列，且和該基因組序列比對效率較高，那么可以采用有參轉錄組的分析策略，直接進行分析。反之，則需要按照無參轉錄組的分析策略進行轉錄本組裝，構建unigene庫，然后進行后續分析。濟南IncRNA轉錄組學定性分析
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