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貴州外泌體轉錄組學服務

來源: 發布時間:2022-01-05

RNA-Seq轉錄組學技術優勢:RNA-seq技術可以檢測到低水平表達、未識別的轉錄子和新拼接亞型基因。另一方面,與基因芯片相比,RNA-Seq有一個更廣的檢測動態范圍,可以研究編碼和非編碼RNA,更易于基因網絡的構建、發現選擇性剪切轉錄物,檢測到等位基因的具體表達方式,也可以用來提取基因型信息。在RNA-Seq單細胞研究中,一個主要優勢是可以分析整個轉錄序列,而不是有限制數量的基因,并且,研究DNA和RNA的方法并不是相互排斥的,他們可以相互結合使用,產生更多的生物學上重要的信息。轉錄組學可以在單核苷酸水平對任意物種的整體轉錄活動進行檢測。貴州外泌體轉錄組學服務

RNA-seq轉錄組學:也被稱為整個轉錄組鳥測序(wts)。RNA-seq包含三個步驟:測序文庫的建立,在特定平臺中測序和生物信息學分析。RNA-Seq是一種基于NGS技術的新的轉錄分析方法。采用NGS技術對從感興趣的RNA樣本序列反轉錄得到的cDNA進行測序。簡而言之,就是對剪切變體、轉錄后RNA編輯、內含子表達水平和特定等位基因的表達情況進行定性和定量分析。RNA-Seq原理:在對基因組測序和分析研究的同時,復雜的轉錄組研究也普遍發展起來。利用高通量測序技術平臺分析轉錄組的結構和表達水平情況,更能挖掘未知轉錄本和稀有轉錄本信息,精確地識別RNA的選擇性剪切以及編碼序列的單核苷酸多態性(SPN),進一步解析復雜的轉錄組信息。貴州外泌體轉錄組學服務轉錄組具有組織特異性的特點。

轉錄組學測序比其他研究方法有哪些優勢?轉錄組學測序具有以下優勢:(1)可以直接測定每個轉錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度,同時不存在傳統微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題;(2)靈敏度高,可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本;(3)可以對任意物種進行全基因組分析,無需預先設計特異性探針,因此無需了解物種基因信息,能夠直接對任何物種進行轉錄組分析,同時能夠檢測未知基因,發現新的轉錄本,并準確地識別可變剪切位點及cSNP,UTR區域。(4)檢測范圍廣,高于6個數量級的動態檢測范圍,能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。

什么叫轉錄組學?廣義轉錄組是指生命單元(通常是一種細胞)中所有按基因信息單元轉錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個特定細胞所有轉錄本的總和.它的研究對象就是這些RNA與蛋白質分子和它們所組成的基因功能網絡以及它們與細胞功能的關系.而狹義轉錄組是指可直接參與翻譯蛋白質的mRNA總和.研究生物細胞中轉錄組的發生和變化規律的科學就稱為轉錄組學(tran—scriptomics)。轉錄組學即特定細胞在某一功能狀態下轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。

轉錄組學應用領域:農林領域:生長發育機制,抗逆脅迫機制,育種,物種保護研究等;畜牧業:生長發育機制,致病機理研究,肉類及乳制品品質研究等;海洋水產:生長發育機制,漁業資源,漁業環境與水產品安全等;微生物:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;生物醫藥:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,藥物開發,個性化醫治等;環境科學:發酵過程優化,生物燃料生產,環境危害風險評估研究等;食品科學:食品儲藏及加工條件優化,食品組分及品質鑒定,功能性食品開發,食品安全監檢測等。RNA-Seq轉錄組學有著巨大的應用前景。四川外泌體microRNA轉錄組學

轉錄學組測序是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。貴州外泌體轉錄組學服務

普通轉錄組學測序適用于哪些情況?普通轉錄組測序主要適用于兩大類:一是不同的生長階段或者發育過程;二是不同的環境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。轉錄組學測序必須做生物學重復么?需要幾個重復?生物學重復是生物實驗所必須的,轉錄組測序也不例外,至少3次生物學重復。準備生物重復樣品時,通過對實驗的預先設計和控制,盡可能將與實驗處理無關的背景條件控制在同一水平,減少批次效應對結果的影響。轉錄組學測序可以同時測到mRNA、lncRNA、micRNA以及circRNA么?我們通常所講的轉錄組測序只能測到mRNA。但是全轉錄組測序通過構建兩個測序文庫(一是小RNA測序文庫、二是lncRNA測序文庫)是可以測到以上4種RNA的。貴州外泌體轉錄組學服務

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