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河南靶向代謝組學研究內容

來源: 發布時間:2022-01-04

代謝組學需要多少的生物學重復?生物學重復指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數量(如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本)。相較于基因和蛋白,代謝物處于生命活動的下游,收到環境和遺傳背景等因素影響較大,生物學重復少可能會放大組內差異對于整體差異的影響,進而影響結果(如準確和足夠多的找出生物標志物)。因此根據不同的生物類型,需要不同的生物學重復來增加數據的可靠性和說服力。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似。與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。河南靶向代謝組學研究內容

代謝組學:代謝組學 (metabolomics)的出現是生命科學研究的必然。是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產物進行定性和定量分析的一門新學科。代謝組作為系統生物學的重要組成部分,在臨床醫學領域具有普遍的應用前景。 代謝產物是基因表達的產物,在代謝酶的作用下生成。雖然與基因或蛋白質相比,代謝產物較小,但是不能形成代謝產物的細胞是死細胞,因此不能小看代謝產物的重要性。 研究人員通過對機體代謝產物的深入研究,可以判斷機體是否處于正常狀態,而對基因和蛋白質的研究都無法得出這樣的結論。事實上,代謝組學研究已經能診斷出一些代謝類疾病,如糖尿病、肥胖癥,代謝綜合癥。目前,已經研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環(TCA),糖酵解,花生四烯酸 (AA)/炎癥途徑。浙江LC-MS/MS非靶向代謝組學主要技術代謝組學是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規律。

代謝組學是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內源性代謝物質的代謝途徑及其所受內在或者外在因素的影響及隨時間變化的規律。代謝組學通過揭示內在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發生的一系列生物事件。代謝組學在系統生物學的末端。以人體為例,對基因序列信息研究是基因組學的范疇。轉錄組學研究基因在外在或內在環境刺激下不同的表達。基因信息翻譯成蛋白質后,各種蛋白的形狀、功能、相互關系是蛋白組學的研究范疇。各種營養物質經過人體的消化、代謝后的代謝物,就是代謝組學的研究范圍。

代謝組學有哪些研究方式?根據有沒有研究目標或方向來確定,在不確定代謝物或者代謝途徑時可使用非靶向代謝組學尋找切入點,在有目標時則使用靶向定量進行深入研究,針對性研究脂質的則可以使用脂質組學技術。另外比較新的,譜領生物還提供基于穩定性同位素示蹤技術的代謝流組學技術服務來研究代謝流量問題。什么是代謝組學?代謝組學是末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內源性代謝物質的代謝途徑及其所受內在或者外在因素的影響及隨時間變化的規律。代謝組學通過揭示內在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發展過程。代謝組學技術可應用于藥物毒理學。

代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些?代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(分子量<1000)。其樣品主要是血漿或血清,尿液,唾液,以及細胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位(如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫院等)合作,做過植物,微生物提取物,腦脊液,昆蟲血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,胎盤,糞便及腸道內容物提取液等。一般代謝組學能檢測出多少物質?同的質譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣,而且不同平臺之間具有互補性。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準確定性的物質約200個左右,檢測尿液樣品定性的物質約200個左右,其他樣品(如肝臟,糞便,腸道內容物)也在幾百這個數量級。如果采用全二維GC/MS,物質的數量要更多,可達1千以上。LC/MS檢測物質的數量要遠比GC/MS多,但能準確定性和定量的不多,視不同的平臺(TQ、QTOF等)能達到幾十至2-3百個物質。代謝組學的代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數目。南京非靶向代謝組學費用

代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。河南靶向代謝組學研究內容

代謝組學比較常用到的數據分析方法:多變量分析:多變量分析方法能同時處理數百或數千個變量,并且能處理變量之間的相互關系。利用變量之間的協方差或相關性,使原始數據在較低維空間上的投影能盡可能地捕獲數據中的信息。但是如果存在大量無信息變量可能會妨礙多變量分析的能力,無信息變量的數量越多,減少真陽性數量的效果就越明顯。多變量分析分為無監督分析方法和有監督分析方法。在代謝組學分析中無監督學習有主成分分析只需要數據集X,而有監督分析方法主要是偏比較小二乘判別分析和正交偏比較小二乘判別分析,這類方法在分析時除了需要數據集X,還需對樣品進行指定并分組, 這樣分組后模型將自動加上另外一個隱含的數據集Y,通常Y的賦值用-1/1或者0/1表示類別信息。河南靶向代謝組學研究內容

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