RNA-Seq轉錄組學的應用：RNA-Seq即對轉錄組進行測序和分析。一般來說在研究所會委托公司測序得到數據自己進行后續的生信分析（質控，mapping，差異基因表達分析，SNV分析等）。RNA-Seq有著巨大的應用前景。在不同背景下比較mRNA水平同一物種，不同組織：研究基因在不同部分的表達情況。同一物種，同一組織：研究基因在不同處理下，不同條件下的表達變化。同一組織，不同物種：研究基因的進化關系。時間序列實驗：基因在不同時期的表達情況與發育的關系。基因分類：找到細胞特異，疾病相關，處理相關的基因表達模式，用于診斷疾病和預測等。基因網絡和通路：基因在細胞活動中的功能，基因間的相互作用。轉錄組學能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。全轉錄學組檢測多少錢

單細胞轉錄組學技術：單細胞轉錄組目前主要有三種方法：SMART擴增技術、10×genomics技術及Andeplete技術。SMART擴增技術比較關鍵的技術，就是設計了2個特殊的引物。再配合用MMLV逆轉錄酶進行逆轉錄。特殊引物1由中間PolyT序列加上一段通用序列及3’末端兩個簡并堿基構成，但在PolyT的3’端倒數第二個堿基是A、C、G而非T的簡并堿基，而倒數第1個為簡并堿基，這樣做的好處是讓它正好結合在mRNA的3’端連到Poly(A)尾巴的這個連接處，而不會結合到mRNA的別的地方。這樣就保證了逆轉錄的起始位置正好是mRNA的3’端的序列終止位置。MMLV逆轉錄酶，這個酶有個特點，就是它在轉錄到mRNA的5’端末端的時侯，會在新合成的cDNA的3’末端，多加出幾個C堿基來。北京高通量轉錄組學研究內容轉錄組學檢測范圍廣，高于6個數量級的動態檢測范圍。

宏轉錄學組概念：宏轉錄組測序是對某一特定時期、特定環境樣品中的全部微生物的RNA進行高通量測序，直接獲得該環境中所有微生物轉錄組信息的一種測序技術的新應用。宏轉錄組中不只包含有微生物的物種信息，還有微生物的基因表達信息。如果說宏基因組能告訴我們微生物群，那么宏轉錄組則能告訴我們這些微生物，這有助于挖掘微生物功能基因和探索微生物與環境、疾病、動植物等關系的機制。宏轉錄組分析：從以G為單位的高通量測序數據中獲取研究所需的微生物種類、基因、通路等信息是進行宏轉錄組研究必須經歷的一步。現在網絡上分析組學數據的工具五花八門。能否從眾多組學工具中選擇出適合分析宏轉錄組數據的軟件，能否搭建一套完整、快速、高效、靈敏、高精確的宏轉錄組分析pipline，直接關乎到后期數據分析的進行。

宏轉錄組學也稱為環境轉錄組學，指從整體水平上研究某一特定環境、特定時期菌群群體全部基因轉錄情況以及轉錄調控規律，以揭示微生物在不同環境壓力下的適應機制，探索環境與微生物之間的相互作用機理。其適用范圍包括人體微生態、環境、工業、農業等領域。宏轉錄組學以生態環境中的全部RNA為研究對象，避開了微生物分離培養困難的問題，能有效的擴展微生物資源的利用空間。應用領域：包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物。普通轉錄組測序主要適用于不同的生長階段或者發育過程。

單細胞RNA-seq轉錄組學工作流程：單細胞RNA測序等高通量單細胞轉錄組學技術通常從針對不同瘤和組織類型（解離、分選和分離細胞等）量身定制的實驗工作流程開始，然后產生可以比對的序列，量化、質量控制(QC)過濾和以不同方式標準化，以實現許多下游計算分析，例如聚類分析以識別轉錄不同的細胞類型和亞群，等位基因分析以識別單核苷酸變異（SNV，用星號表示）或拷貝數變體（CNV）、軌跡分析、剪接檢測或瘤的微環境（TME）相互作用的推斷中。單細胞轉錄組學數據的分析通常因精心設計的研究設計而變得復雜，這些設計可能包括來自患病和未患病個體的樣本、在不同時間點（例如，診療前和診療后）收集的同一個人的多個樣本，或來自表現出不同疾病狀態的不同個體的多個樣本。這樣的研究設計可以發現患者共享的轉錄特征，這些特征可能定義疾病中常見的干擾分子途徑。轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。廣東外泌體轉錄組學研究方法

轉錄組學可應用于表達差異的研究。全轉錄學組檢測多少錢

轉錄組分析是目前應用比較廣的高通量測序分析技術之一。常見設計是不同樣品之間比較，尋找差異基因、標志基因、協同變化基因、差異剪接和新轉錄本，并進行結果可視化、功能注釋和網絡分析等。轉錄組的測序分析也相對成熟，從RNA提取、構建文庫、上機測序再到結果解析既可以自己完成，又可以在專業公司進行。概括來看轉錄組的分析流程比較簡單，序列比對-轉錄本拼接(可選)-表達定量-差異基因-功能富集-定制分析。整個環節清晰流暢，可以作為剛開始接觸高通量測序學習比較合適的技術之一。全轉錄學組檢測多少錢

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