RNA-seq轉錄組學：也被稱為整個轉錄組鳥測序（wts）。RNA-seq包含三個步驟：測序文庫的建立，在特定平臺中測序和生物信息學分析。RNA-Seq是一種基于NGS技術的新的轉錄分析方法。采用NGS技術對從感興趣的RNA樣本序列反轉錄得到的cDNA進行測序。簡而言之，就是對剪切變體、轉錄后RNA編輯、內含子表達水平和特定等位基因的表達情況進行定性和定量分析。RNA-Seq原理：在對基因組測序和分析研究的同時，復雜的轉錄組研究也普遍發展起來。利用高通量測序技術平臺分析轉錄組的結構和表達水平情況，更能挖掘未知轉錄本和稀有轉錄本信息，精確地識別RNA的選擇性剪切以及編碼序列的單核苷酸多態性（SPN），進一步解析復雜的轉錄組信息。相對于傳統的芯片雜交平臺，轉錄學組測序無需預先針對已知序列設計探針。武漢mRNA-seq轉錄組學研究

轉錄組學：隨著越來越多的基因組序列相繼被測定,生命科學的研究進入了后基因組時代,各類組學技術得到迅速地發展與普遍地應用包括以基因為研究對象的基因組學(Genomics)、以轉錄過程為研究對象的轉錄組學(Transcriptomics)。意義：1．轉錄組譜可以提供特定條件下某些基因表達的信息,并據此推斷相應未知基因的功能,揭示特定調節基因的作用機制.2．通過基于基因表達譜的分子標簽,不只可以辨別細胞的表型歸屬,還可以用于疾病的診斷.3．轉錄組的研究應用于臨床的另一個例子是可以將表面上看似相同的病癥分為多個亞型,尤其是對原發性惡性瘤,通過轉錄組差異表達譜的建立,可以詳細描繪出患者的生存期以及對藥物的反應等。山東IncRNA轉錄組學技術分析轉錄組學測序必須做生物學重復么？

circRNA轉錄組學成環機制：circRNA環化方式分為內含子環化和外顯子環化。目前主流的成環機制可歸類為：依賴于剪切體的索尾插接環化。在mRNA前體上，通過連續的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點連接到上游的3′受體的位點，索尾插接形成環化，然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進circRNA形成。部分circRNA外顯子兩側的內含子中含有反向互補序列，首先在剪切位點上并排形成RNA雙鏈體，再通過可變剪切形成帶內含子和不帶內含子兩種不同的circRNA。或者外顯子內部以及兩側的內含子可以競爭進行RNA配對，然后通過可變剪切形成不同類型的circRNA。

RNA-Seq轉錄組學技術優勢：相比基因芯片和標記的堿基序列的測序方法，RNA-seq具有一定的優越性。與基因芯片相比，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用來測量基因的表達水平情況，還可以揭示未知的轉錄組和拼接亞型，并為選擇性拼接亞型提供定量分析。相對于傳統的芯片雜交平臺，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更精確的數字化信號、更高的檢測通量以及更普遍的檢測范圍，是目前深入研究復雜性轉錄組的強大工具。鑒于這些優勢，RNA-Seq很快就被應用到關于瘤病相關研究的多個方面。轉錄組學即一個活細胞所能轉錄出來的所有RNA的總和。

單細胞轉錄組學基本概念：普通轉錄組的思路也可以應用到單細胞轉錄組。普通轉錄組相當于把一群細胞混合到一起去提取RNA，獲得的是每個細胞中RNA表達量的平均值。單細胞是把每個細胞單獨分出來去提取RNA，然后建庫測序，獲得是是單個細胞的表達值。在每個細胞里面基因的表達具有隨機性，且存在異質性。而且這些細胞群中會存在不同類型的細胞，尤其是當我們對整個組織進行測序時，它們本身就是由不同類型的細胞組成的，而我們用普通轉錄組來測序，相當于掩蓋住了這些不同的細胞類型的差異，展示的是整個組織的平均的狀態，所以說單細胞從這個來看跟普通轉錄組就不同在是用一個細胞測，不是用一堆細胞測。轉錄組學靈敏度高，可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本。廣東外泌體microRNA轉錄組學檢測多少錢

普通轉錄組測序主要適用于不同的環境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。武漢mRNA-seq轉錄組學研究

宏轉錄組學也稱為環境轉錄組學，指從整體水平上研究某一特定環境、特定時期菌群群體全部基因轉錄情況以及轉錄調控規律，以揭示微生物在不同環境壓力下的適應機制，探索環境與微生物之間的相互作用機理。其適用范圍包括人體微生態、環境、工業、農業等領域。宏轉錄組學以生態環境中的全部RNA為研究對象，避開了微生物分離培養困難的問題，能有效的擴展微生物資源的利用空間。應用領域：包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物。武漢mRNA-seq轉錄組學研究

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