轉錄組是特定發育階段或生理條件下細胞內的完整轉錄信息的匯合,表示了基因表達的中間狀態。轉錄組測序可以對所有轉錄物進行分類、確定基因的轉錄結構、量化轉錄物的表達水平。蛋白質是生命功能的直接執行者,蛋白組是一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。整合轉錄組學和蛋白質組學的表達數據對生物樣本進行研究,可以從整體上解釋生物學問題,探究生物體生理和疾病機理等。轉錄組學應用于胃腸瘤發生機制研究:利用轉錄組學可檢測瘤細胞惡化過程中的RNA(編碼RNA及非編碼RNA)的變化,有助于更好地理解胃腸瘤的發生機制。轉錄組學無需了解物種基因信息,能夠直接對任何物種進行轉錄組分析。廣州高通量轉錄組學應用
RNA-seq轉錄組學技術優勢有:1、可以直接測定每個轉錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度;2、靈敏度高,可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本;3、可以對任意物種進行全基因組分析,能夠檢測未知基因,發現新的轉錄本,并準確地識別可變剪切位點及cSNP,UTR區域;4、檢測范圍廣,能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。RNA-seq轉錄組學是需要生物學重復的,至少需要兩次生物學重復,3次以上的生物學重復更好。以3個重復為例,加上對照的三個生物學重復,一次RNA-seq需要6個樣本。湖北轉錄組學服務RNA-Seq轉錄組學即對轉錄組進行測序和分析。
轉錄組及轉錄組測序(RNA-seq):轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組測序(RNA-seq)主要通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉錄出來的mRNA的表達量,進而對相關基因和表型的關系進行分析。本質上講RNA-seq就是在用一種新的方法實現“基因決定性狀”的經典思路。在RNA-seq之前用于研究基因組表達分析的主要技術是基因芯片,不過由于高通量測序成本的下降,RNA-seq的運用愈來愈普遍。
轉錄組學應用領域:農林領域:生長發育機制,抗逆脅迫機制,育種,物種保護研究等;畜牧業:生長發育機制,致病機理研究,肉類及乳制品品質研究等;海洋水產:生長發育機制,漁業資源,漁業環境與水產品安全等;微生物:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;生物醫藥:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,藥物開發,個性化醫治等;環境科學:發酵過程優化,生物燃料生產,環境危害風險評估研究等;食品科學:食品儲藏及加工條件優化,食品組分及品質鑒定,功能性食品開發,食品安全監檢測等。轉錄組學測序有什么樣的樣品要求?
轉錄組學和基因組學目前有實用價值嗎?二者實用價值非常大,尤其是對有瘤的患者的醫治,簡直顛覆了傳統醫治的模式。轉錄組和基因組月在生物學研究中有著重要價值。例如研究某個基因功能的時候,可以構建該基因的敲除或者過表達生物,然后對比野生型進行轉錄組分析看看該基因涉及什么表達網絡。此外在醫學方面的應用也很大,例如在有的瘤病人中進行基因組學測序和分析能夠了解其中的發生的發展的驅動基因,然后能根據發展的驅動基因研究靶向藥物,從而推動瘤的藥物研發和醫治!轉錄組學分析轉錄本的結構和表達水平的同時,還能發現未知轉錄本和稀有轉錄本。武漢單細胞轉錄組學技術分析
轉錄組學有高通量、更精確的數字信號。廣州高通量轉錄組學應用
宏轉錄組學也稱為環境轉錄組學,指從整體水平上研究某一特定環境、特定時期菌群群體全部基因轉錄情況以及轉錄調控規律,以揭示微生物在不同環境壓力下的適應機制,探索環境與微生物之間的相互作用機理。其適用范圍包括人體微生態、環境、工業、農業等領域。宏轉錄組學以生態環境中的全部RNA為研究對象,避開了微生物分離培養困難的問題,能有效的擴展微生物資源的利用空間。應用領域:包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物。廣州高通量轉錄組學應用
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