蛋白質乙酰化修飾組學定量分析:1. SILAC細胞標記,組織/細胞破碎,提取、提純目的蛋白質(基于SILAC的乙酰化修飾組學定量)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 對多肽片段進行iTRAQ標記(基于iTRAQ的乙酰化修飾組學定量)。4. 使用高效特異性乙酰化抗體對乙酰化修飾肽段進行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS對富集的乙酰化肽段進行序列分析。6. 數據分析,比對不同樣本中蛋白乙酰化修飾水平差異,并對產生變化的生物學意義進行解釋。蛋白質的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質與底物蛋白質上特定的氨基酸結合。江蘇蛋白質甲基化修飾組學費用
蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率:被修飾的蛋白質的百分比低,則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識別修飾位點。棕櫚酰化蛋白修飾質譜鑒定方法:S-棕櫚酰化的主要功能是促進蛋白質與細胞膜的結合。蛋白質可以由一個棕櫚酰基組成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質,如豆蔻酰基。由于對S-棕櫚酰化蛋白分析仍然具有挑戰性,由于S-棕櫚酰化修飾蛋白亞水平以及疏水性和潛在不穩定的硫代質鏈的S-脂酰化肽。現在常用的幾種方法可以捕獲S-脂酰化蛋白以及對目標修飾蛋白進行捕獲。深圳琥珀酰化修飾蛋白質組學價格在眾多乙酰化修飾的蛋白質中,研究較多的要數細胞核中包圍DNA的組蛋白了。
蛋白翻譯后修飾檢測:由于PTMs在基礎生物學以及疾病發病機理中的重要性,因此非常需要對蛋白質的翻譯后修飾進行檢測。對蛋白翻譯后修飾進行研究時通常需要富集步驟,因為這些翻譯后修飾的蛋白質相對含量較低。大多數PTMs的檢測方法與富集策略結合在一起開發,以提供比較好的機會來識別、驗證和研究蛋白翻譯后修飾的功能。但是,在檢測已有特異性翻譯后修飾抗體的修飾蛋白質時,可能不需要富集步驟。質譜技術,通過測定肽段的分子量可以對該肽段的翻譯后修飾情況進行檢測,并可以對翻譯后修飾蛋白進行定性和定量分析。
蛋白翻譯后修飾:蛋白質氨基酸序列的特定位置可以與化學基團或者小分子量的蛋白共價結合從而發生蛋白質翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs)。翻譯后修飾是蛋白質生物合成的一個步驟,翻譯后多肽鏈在成為成熟的蛋白質產品之前要經過修飾,PTMs的類型包括磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化和二硫鍵等等,它導致蛋白質組復雜性的大幅增加。對于任何給定的蛋白質,各種各樣的PTMs提供了一種通過改變蛋白質的結構和功能來促進細胞快速變化的方法。PTMs在信號轉導、蛋白質穩定性和周轉率、蛋白質與蛋白質識別和相互作用以及空間定位中起著至關重要的作用。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。
蛋白質磷酸化修飾組學:磷酸化蛋白質是由蛋白激酶將ATP或GTP分子上的磷酸基團轉移到底物蛋白特定的氨基酸側鏈上形成的。蛋白質磷酸化是一種可逆的蛋白質翻譯后修飾。在哺乳動物的細胞生命周期中,至少有三分之一的蛋白質發生磷酸化修飾。磷酸化修飾參與許多信號轉導途徑和細胞代謝過程,且許多已知的疾病也與蛋白質的異常磷酸化有關。因此,對磷酸化蛋白質組進行定量研究,尋找差異表達的磷酸化蛋白質,有助于發現疾病的生物標志物和尋找新的具有診療潛力的藥物靶標。蛋白質的磷酸化修飾是生物體內重要的共價修飾方式之一。杭州蛋白質氧化修飾組學費用
蛋白質糖基化是一種常見的蛋白質翻譯后修飾。江蘇蛋白質甲基化修飾組學費用
蛋白質學組翻譯后修飾自下而上分析策略:常用的糖蛋白分離和富集技術有:a. 凝集素親和技術;b. 肼化學富集;c. 親水性相互作用色譜法;d. β-消除/邁克爾加成反應。基于質譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點測定方法有:a. PNGase F酶法;b. Endo H酶法;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化:泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,可通過異肽鍵與目標蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標記,泛素用親和標簽(通常為6xHis)進行標記,并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結構,經胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,使肽的質量增加114,因此可作為泛素定位位點的質量標記。用HPLC對樣品進行預分離,使用針對特定殘留結構的抗體富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯質譜可以鑒定泛素化位點。江蘇蛋白質甲基化修飾組學費用
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