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杭州外泌體蛋白質組學研究

來源: 發布時間:2022-05-14

蛋白質組研究:蛋白質組研究是指系統研究在某一特定時間、特定條件下,某一種特定組織中的所有蛋白質。對蛋白質的研究也不只是局限于蛋白質的氨基酸序列,而是包括了蛋白質的表達量,蛋白質活性,被修飾的狀況以及和其他蛋白質或分子的相互作用情況、亞細胞定位和三維結構。這些信息對于全方面了解復雜的生物系統有著重要的意義。因此,蛋白質組學研究目標是大規模、系統化地研究蛋白質的特性,以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網絡。蛋白質組學相關技術目前在一小部分應用中具有獨特優勢。杭州外泌體蛋白質組學研究

蛋白質組學有什么用,能給我實驗帶來什么?可以大規模鑒定特定組織、細胞等各種樣本的蛋白質種類、修飾狀態以及蛋白質之間的相互作用,以及對這些蛋白質功能分析、分類;可以對不同條件下某一特定樣本進行大規模的蛋白質(包括翻譯后修飾蛋白)表達量變化分析,篩選潛在biomarker,篩選重要信號通路;依托大樣本量,可以實現疾病的分子分型分析、重要潛在靶標鑒定。質譜的蛋白質組學和芯片哪個更好出結果?若有對應物種的全基因組并有預測的全蛋白序列庫,可優先選擇全蛋白序列庫;若無全蛋白序列庫,有對應物種對應組織的轉錄組測序結果并,可以使用轉錄組的測序結果(mRNA三框翻譯或者預測CDS,并翻譯成氨基酸序列);若基因組、轉錄組數據庫都沒有,優先選擇同源性比較接近的物種的全蛋白數據庫,若近源物種沒有合適的全蛋白庫,則選擇更大的蛋白全庫(如動物全庫、綠色植物全庫、微生物庫等)。杭州外泌體蛋白質組學研究蛋白質組學的研究方法將出現多種技術并存,各有優勢和局限的特點。

蛋白組究竟研究的是什么呢?第1,蛋白質定性,或者說大規模檢測某些蛋白質是否存在于樣品當中;第2,蛋白質定量,也就是大規模檢測某些蛋白質的含量(包括一定含量與相對含量);第3,蛋白質翻譯后修飾,這些修飾主要包括磷酸化,泛素化,糖基化,乙酰化等等,也包括對這些翻譯后修飾的定量研究。這三大塊中所提到的大規模,既可以是樣品數量的大規模高通量,也可以是少量樣本中蛋白數量的大規模高通量。研究原因:首先,由于翻譯調控和翻譯后調控的存在,RNA的表達量與實際對應蛋白質的含量相關性并不高,就簡單地測試了酵母中mRNA和對應蛋白質的定量相關性,結果是,低豐度蛋白與mRNA的相關性尤其低,而高豐度蛋白和其mRNA的相關性則高,經過平均后r值只為0.4。

蛋白質組學是以蛋白質組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規律的科學。蛋白質組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業帶來巨大的利益,是生命科學進入后基因時代的特征。蛋白質是生命存在和運動的物質基礎,是細胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活動的執行者,亦是基因功能活動的執行者,是生命現象復雜性和多變性的直接體現者。蛋白質組研究是為了識別及鑒定一個細胞或組織所表達的全部蛋白質以及它們的表達模式,是對基因組研究的重要補充,是對生物體在蛋白質水平上定量、動態、整體性的研究。這類研究有助于了解蛋白的結構、細胞的功能、生命的本質及活動規律,為疾病的診斷、診療、疫苗及新藥開發提供科學依據。蛋白質組學本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征。

蛋白質組學技術:等電聚焦:等電聚焦(isoelectricfocusing,IEF)是一種利用有pH梯度的介質分離等電點不同的蛋白質的電泳技術。等電聚焦凝膠電泳依據蛋白質分子的靜電荷或等電點進行分離,等電聚焦中,蛋白質分子在含有載體兩性電解質形成的一個連續而穩定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質是脂肪族多氨基多羧酸,在電場中形成正極為酸性,負極為堿性的連續的pH梯度。蛋白質分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場中移動;當蛋白質遷移至其等電點位置時,其靜電荷數為零,在電場中不再移動,據此將蛋白質分離。蛋白質組意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”,即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。哈爾濱4D定量蛋白質組學價格

蛋白質組具有很高的細胞和組織特異性,不同的細胞組織表達不同的蛋白質組。杭州外泌體蛋白質組學研究

蛋白質組學技術方法介紹:蛋白質組學技術方法:生物質譜:生物質譜技術是蛋白質組學研究中比較重要的鑒定技術,其基本原理是樣品分子離子化后,根據不同離子之間的荷質比(M/E)的差異來分離并確定分子量。對于經過雙向電泳分離的目標蛋白質用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵)成肽段,對這些肽段用質譜進行鑒定與分析。目前常用的質譜包括兩種:基質輔助激光解吸電離-飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)和電噴霧質譜(ESI- MS)。杭州外泌體蛋白質組學研究