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上海常規靶向代謝組學領域

來源: 發布時間:2022-05-13

代謝組學技術介紹:代謝組學技術(Metabolomics) 是基因時代發展起來的系統生物學新技術,以生物體內所有代謝產物為研究對象,其主要目標是定性定量研究代謝物與機體生理病理變化之間的關系。代謝物的變化與細胞所處內外環境密切相關。與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學提供了一種更加直接的生理狀態檢測方式。就研究方法而言,代謝組學主要包括靶向(Targeted)代謝組學和非靶向(Untargeted)代謝組學兩部分。非靶向代謝組學是針對一定生理狀態下的全代謝組學,一目了然地發現差異性代謝物,其優勢在于全方面性。而靶向代謝組學則是針對具體代謝物,以標準品為參照,進行相對的定量分析,具有更好的靈敏度和準確度。隨著分辨率和掃描速度的提升,高分辨質譜儀已經應用到不同疾病的代謝組學中。可分析血漿、血清、尿液、唾液、以及細胞和組織提取液等多種樣本。與基因組學和蛋白質組學相比, 代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性。上海常規靶向代謝組學領域

代謝組學的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標分子。傳統代謝組學研究利用的是GC-MS,因為代謝物大多數都不是高沸點的,而且GC-MS有龐大的數據庫檢索。然后發展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點物質難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學不是很多,一方面是NMR這個東西入行起點有點高,另一方面是樣品太復雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單,無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質結構的指認要比MS更精確(比如異構體)因此對定性非常有用,成為非靶向代謝組學的重要方法。上海常規靶向代謝組學領域代謝組學是系統生物學的重要組成部分。

代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些?代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(分子量<1000)。其樣品主要是血漿或血清,尿液,唾液,以及細胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位(如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫院等)合作,做過植物,微生物提取物,腦脊液,昆蟲血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,胎盤,糞便及腸道內容物提取液等。一般代謝組學能檢測出多少物質?不同的質譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣,而且不同平臺之間具有互補性。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準確定性的物質約200個左右,檢測尿液樣品定性的物質約200個左右,其他樣品(如肝臟,糞便,腸道內容物)也在幾百這個數量級。

如何獲得高質量GC/MS代謝組學數據?實驗設計先不談,在儀器分析階段,若想獲得高質量數據,有以下幾個方面需要注意。1)前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此,一個項目應當只由一個人負責前處理。推薦使用自動衍生設備,以減少人為的誤差。2)檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態。儀器的控制軟件都有系統自檢功能,可以快速便捷地核查質譜儀器的狀態。但更重要的是氣相色譜狀態,推薦使用一組混標作為儀器質控。在每一個項目開始之前,先進行質控樣檢測,確認氣相色譜的分離度和質譜的整體響應。3)后期數據矯正,特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質控樣本(每個樣品取少量后混合),在后期數據處理時,使用質控樣本結合如LOESS之類的算法對整體數據進行矯正。代謝組學是效仿基因組學和蛋白質組學的研究思想。

代謝組學概念:代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(MW<1000)。 在食品安全領域,利用代謝組學工具發現農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。其樣品主要是動植物的細胞和組織的提取液。主要技術手段是核磁共振(NMR),質譜(MS),色譜(HPLC,GC),其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,再結合模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態,并有可能找出與之相關的生物標志物(biomarker)。代謝組學技術可應用于藥物毒理學。哈爾濱個性化定制靶向代謝組學鑒定

代謝組學著重研究的是生物整體、組織代謝途徑及其所受內在或者外在因素的影響及隨時間變化的規律。上海常規靶向代謝組學領域

代謝組學概念:代謝組學(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學和蛋白質組學的研究思想,對生物體內所有代謝物進行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關系的研究方式,是系統生物學的組成部分。其研究對象大都是相對分子質量1000以內的小分子物質。先進分析檢測技術結合模式識別和專家系統等計算分析方法是代謝組學研究的基本方法。代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發展起來的一門學科,是系統生物學的重要組成部分。上海常規靶向代謝組學領域