LC-MS非靶向代謝組學:LCMS非靶向是通過液質聯用(LC–MS)方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產物的動態變化,從中找出表達差異的代謝物,進而闡明生物體代謝相關過程的代謝組學技術。LCMS非靶向代謝組學適用于分析難揮發或熱穩定性差的代謝產物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實現了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯質譜儀在MS掃描模式下,可實現高低碰撞能量快速切換,同時采集代謝物的一二級質譜信息,結合代謝組學數據處理軟件對質譜信息的解析,在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。代謝組學與臨床化學較為相似。四川靶向代謝組學定性分析
代謝組學的研究領域有哪些?1、疾病機制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發。4、藥物作用機制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細胞代謝組學研究。7、微生物代謝組學研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少?不同檢測平臺的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,可達到fM級。另外,相同含量的不同物質,由于自身化學性質不同,質譜的離子化效率、信號響應強度會差異很大。物質的檢測靈敏度跟自身的化學性質有關,化學性質的影響主要表現在離子化效率和質譜碎裂行為兩方面。因此,相同含量的不同物質,可能一個能檢測出來,另一個檢測不出來。四川靶向代謝組學定性分析與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性。
為什么選擇代謝組學作為科研技術手段?1)小分子的產生和代謝是生物機體作用的結果,生物體液的代謝產物分析能夠更直接,更準確的反映生物體的病理生理狀態。2)基因和蛋白質表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易;3)代謝組學的代謝物信息庫簡單,但它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數據庫那么復雜;4)代謝物的種類少,要遠小于基因和蛋白質的數據,物質的分子結構要簡單得多。5)代謝產物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學研究中采用的技術更容易在各個領域中通用,也更容易被人接受。
代謝組學的研究領域有哪些?1、疾病機制研究;2、疾病診斷與防治;3、新藥篩選和開發;4、藥物作用機制的研究;5、藥物毒性評價;6、植物的細胞代謝組學研究;7、微生物代謝組學研究。代謝組學的研究方法:代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析,采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜峰,了解不同化合物的結構,建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析,研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進行更深入的研究。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。
代謝組學的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標分子。傳統代謝組學研究利用的是GC-MS,因為代謝物大多數都不是高沸點的,而且GC-MS有龐大的數據庫檢索。然后發展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點物質難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學不是很多,一方面是NMR這個東西入行起點有點高,另一方面是樣品太復雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單,無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質結構的指認要比MS更精確(比如異構體)因此對定性非常有用,成為非靶向代謝組學的重要方法。代謝組學可與生物表型變化建立直接相關性。廣東常規靶向代謝組學方法
代謝組學作為系統生物學的重要組成部分,在臨床醫學領域具有普遍的應用前景。四川靶向代謝組學定性分析
代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規律,目前據此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰,研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產物發生相應的改變,通過對某些代謝產物進行分析,并與正常人的代謝產物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。四川靶向代謝組學定性分析