蛋白質組學研究這樣做:蛋白質組與基因組相對應,也是一個整體的概念,隨著基因組學研究的不斷深入,蛋白質組學已逐漸成為研究熱點,對蛋白組學的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質,但探究成千上萬的蛋白質特性也是一個重大的技術挑戰。蛋白質組(Proteome)指的是某一時刻或某一狀態基因組表達的所有相應的蛋白,即細胞、組織或機體全部蛋白質的存在及活動形式,其是一個動態概念,它是在組織、細胞的整體蛋白質水平上,探索蛋白質作用模式、功能機理、調節控制以及蛋白質群體內的相互關系、從而獲得生命活動調控網絡的全方面而深入的認識,以揭示生命活動的基本規律。蛋白質組研究有助于了解蛋白的結構、細胞的功能、生命的本質及活動規律。浙江4D定量蛋白質組學報價
定量蛋白質組學分析:特點:(1)不同樣本標記之后混樣,統一處理上機,減少了分別上機造成的實驗誤差,并利用同位素標簽的豐度來檢測,定量更準確,重復性更好;(2)由于需要標記試劑標記,因此成本相對較高;(3)通量高,在一次實驗中比較多可同時比較8個樣品;(4)利用基于同一個參考樣品的辦法,可以進行多于8個樣品的定量比較;(5)iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質組學分析:Label-Free定量,即非標記的定量蛋白質組學,不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。浙江新型修飾蛋白組學一般流程蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別。
iTRAQ/TMT標記定量蛋白質組技術優勢:1、結果可靠:基于高靈敏度和高分辨的串聯質譜方法,定性與定量同步進行,同時得出定性和定量結果,重復樣品間的蛋白表達量相關性高;2、靈敏度高:分級分離,降低樣品復雜度,相比凝膠電泳觀測到的蛋白變化在2倍以上,iTRAQ計算出的蛋白變化在1.3-1.6倍之間,可檢測低豐度蛋白;3、分離能力強:可分離出酸/堿性蛋白,小于10KDa或大于200KDa的蛋白、難溶性蛋白等;4、自動化程度高:液質聯用,自動化操作,分析速度快,分離效果好。
蛋白質組學技術發展方面:蛋白質組學的研究方法將出現多種技術并存,各有優勢和局限的特點,而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發展新方法外,更強調各種方法間的整合和互補,以適應不同蛋白質的不同特征。另外,蛋白質組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術新方法的活水之源,特別是,蛋白質組學與其它大規模科學如基因組學,生物信息學等領域的交叉,構成組學(omics)生物技術研究方法,所呈現出的系統生物學(System Biology)研究模式,將成為未來生命科學比較令人激動的新前沿。Label free定量蛋白組學技術是通過液質聯用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析。
蛋白質組學介紹:蛋白質組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質及其特征進行大規模、系統化地研究,以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網絡。研究的內容主要包括:組成蛋白質一級結構氨基酸的序列特征、蛋白質的豐度、蛋白質活性、蛋白質的修飾、亞細胞定位和三維結構、蛋白質之間的相互作用以及對蛋白質的高階復合物結構。蛋白質組主要通過蛋白質雙向電泳、氨基酸序列測定、質譜、生物信息等方法,研究某個基因組對應的所有蛋白質特征,包括蛋白質含量、亞細胞定位、活性以及蛋白修飾等內容。蛋白質組學相關技術目前在一小部分]應用中具有獨特優勢。蛋白質組學報價
對人類而言,蛋白質組學的研究終究要服務于人類的健康。浙江4D定量蛋白質組學報價
蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,分析組蛋白時其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時,通常需要將被檢測蛋白質消化成3-9kDa范圍內的肽段,因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是,由于儀器的進步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術可以直接對完整的蛋白質進行測序,包括翻譯后修飾的蛋白質和其他大的蛋白質片段,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關的信息,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。浙江4D定量蛋白質組學報價