單細胞轉錄組學技術：單細胞轉錄組目前主要有三種方法：SMART擴增技術、10×genomics技術及Andeplete技術。SMART擴增技術比較關鍵的技術，就是設計了2個特殊的引物。再配合用MMLV逆轉錄酶進行逆轉錄。特殊引物1由中間PolyT序列加上一段通用序列及3’末端兩個簡并堿基構成，但在PolyT的3’端倒數第二個堿基是A、C、G而非T的簡并堿基，而倒數第1個為簡并堿基，這樣做的好處是讓它正好結合在mRNA的3’端連到Poly(A)尾巴的這個連接處，而不會結合到mRNA的別的地方。這樣就保證了逆轉錄的起始位置正好是mRNA的3’端的序列終止位置。MMLV逆轉錄酶，這個酶有個特點，就是它在轉錄到mRNA的5’端末端的時侯，會在新合成的cDNA的3’末端，多加出幾個C堿基來。轉錄學組測序是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。北京外泌體microRNA轉錄組學研究方法

轉錄組學測序有什么樣的樣品要求？（1）樣品純度要求：OD值應在1.8至2.2之間；電泳檢測28S:18S至少大于1.8。（2）樣品濃度：totalRNA濃度不低于400ng/μg。（3）totalRNA樣品請置于-20℃保存；請提供totalRNA樣品具體濃度、體積、制備時間、溶劑名稱及物種來源。請同時附上QC數據，包括電泳膠圖、分光光度或Nanodrop儀器檢測數據。（4）樣品請置于1.5ml管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間，管口使用Parafilm封口。建議使用干冰運輸，并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運輸過程中樣品降解的可能性。哈爾濱外泌體microRNA轉錄組學服務轉錄組學包括：mRNA、ncRNA、rRNA等。

轉錄組學（Transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細胞內所有轉錄產物的匯合，包括信使RNA(mRNA)、核糖體RNA(rRNA)、轉運RNA(tRNA)及非編碼RNA(ncRNA)；狹義上指所有mRNA的匯合。轉錄組具有很強的時間和空間特性，是基因功能及結構研究的基礎和出發點，掌握了生物個體基因轉錄水平的變化，可深入了解其生命活動特征和調控機制。通過新一代高通量測序，能夠全方面快速地獲得某一物種特定組織在某一狀態下的幾乎所有轉錄本的基因序列信息。

單細胞轉錄組學基本概念：普通轉錄組的思路也可以應用到單細胞轉錄組。普通轉錄組相當于把一群細胞混合到一起去提取RNA，獲得的是每個細胞中RNA表達量的平均值。單細胞是把每個細胞單獨分出來去提取RNA，然后建庫測序，獲得是是單個細胞的表達值。在每個細胞里面基因的表達具有隨機性，且存在異質性。而且這些細胞群中會存在不同類型的細胞，尤其是當我們對整個組織進行測序時，它們本身就是由不同類型的細胞組成的，而我們用普通轉錄組來測序，相當于掩蓋住了這些不同的細胞類型的差異，展示的是整個組織的平均的狀態，所以說單細胞從這個來看跟普通轉錄組就不同在是用一個細胞測，不是用一堆細胞測。轉錄組學測序必須做生物學重復么？

circRNA轉錄組學：是一類具有閉合環狀結構的非編碼RNA分子，沒有5′帽子結構和3′poly（A）結構，主要位于細胞質或儲存于外泌體中，不受RNA外切酶影響，表達更穩定且不易降解，已被證明普遍存在于多種真核生物體內[1]。大多數circRNA是由外顯子環化而成，也有部分circRNA是由內含子環化而成的套索結構。同時由于circRNA含有大量的miRNA應答原件（MREs），能與AGO蛋白形成RNA誘導沉默復合體（RISC）的催化關鍵，然后導致circRNA降解。根據來源，circRNA可大致分為四類：全外顯子型的circRNA，內含子和外顯子組合的EIcircRNA，內含子組成的套索型ciRNA，由病毒RNA基因組、tRNA、rRNA、snRNA等環化產生的circRNA。轉錄組學有高通量、更精確的數字信號。上海全轉錄學組定量分析

轉錄組學能準確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區域。北京外泌體microRNA轉錄組學研究方法

宏轉錄組分析：從以G為單位的高通量測序數據中獲取研究所需的微生物種類、基因、通路等信息是進行宏轉錄組研究必須經歷的一步。現在網絡上分析組學數據的工具五花八門。能否從眾多組學工具中選擇出適合分析宏轉錄組數據的軟件，能否搭建一套完整、快速、高效、靈敏、高精確的宏轉錄組分析pipline，直接關乎到后期數據分析的進行。這種技術不只具有宏基因組技術的全部優點，可以檢測環境中的活性微生物、活性轉錄本以及活性功能進行研究，還可以比較不同環境下的差異表達基因和差異功能途徑，揭示微生物在不同環境壓力下的適應機制，探索環境與微生物之間的互作機理。北京外泌體microRNA轉錄組學研究方法