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南京泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

來源: 發(fā)布時間:2022-04-25

泛素化修飾蛋白組學(xué)研究:泛素化修飾蛋白組學(xué)是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動。由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動態(tài)范圍廣,質(zhì)譜分析前需要對修飾進(jìn)行富集以提高其豐度,然后利用傳統(tǒng)的定量蛋白組分析手段對富集得到的泛素化肽段樣品進(jìn)行定量分析。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)對于蛋白質(zhì)修飾位點的發(fā)現(xiàn)及研究對闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用。南京泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

乙酰化修飾蛋白組學(xué)實驗流程:1)組織/細(xì)胞破碎,提取蛋白質(zhì);2)蛋白酶解成多肽片段;3)對多肽片段進(jìn)行 iTRAQ 標(biāo)記;4)高效特異性乙酰化抗體富集乙酰化修飾肽段;5)使用 LC-MS/MS 對富集的乙酰化肽段進(jìn)行序列分析;5)數(shù)據(jù)分析,比對不同樣本中蛋白乙酰化修飾水平差異,并對產(chǎn)生變化的生物學(xué)意義進(jìn)行解釋。乙酰化是一個普遍而重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,不僅集中在對細(xì)胞染色體結(jié)構(gòu)的影響以及對核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子方面,而且還影響參與細(xì)胞周期和新陳代謝、肌動蛋白聚合控制及多聚谷氨酰胺疾病等方方面面。乙酰化不僅存在于真核細(xì)胞中,而且越來越多的證據(jù)也表明乙酰化同樣影響許多原核細(xì)胞的生理生化過程。深圳蛋白質(zhì)丙酰化修飾組學(xué)分析研究蛋白質(zhì)乙酰化修飾,顧名思義指的就是在蛋白質(zhì)原有基礎(chǔ)上面嫁接上乙酰化基團。

泛素化修飾PRM定量驗證:原理: 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動。首先對泛素化的蛋白進(jìn)行胰酶消化,在賴氨酸的修飾位點上會產(chǎn)生兩個甘氨酸的殘基(K-GG),利用對泛素化賴氨酸(K-GG)具有高親和力的基序抗體,特異性富集復(fù)雜樣本中的泛素化肽段,結(jié)合LC-MS/MS蛋白質(zhì)定量方法,實現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質(zhì)定性定量分析。

乙酰化修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用方向:1、乙酰化修飾與細(xì)胞基因表達(dá)調(diào)控、表觀調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性等生理過程研究。2、乙酰化引起的代謝疾病、代謝紊亂發(fā)生等疾病機理研究。乙酰化生物學(xué)意義:1、調(diào)節(jié)DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用;2、與其他PTMs發(fā)生crosstalk;3、調(diào)節(jié)酶活性;4、調(diào)控蛋白亞細(xì)胞定位。生物領(lǐng)域各個研究方面,如:1、農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,育種保護(hù)研究等;2、 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機理研究等。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團,可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì),進(jìn)而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀態(tài)、亞細(xì)胞定位、折疊及其穩(wěn)定性以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的豐度變化在生命活動研究中具有重大意義,異常的翻譯后修飾會導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化,因此只要知道靶蛋白翻譯后修飾前后分子量的變化,就能對翻譯后修飾方式進(jìn)行鑒定和定量。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有有效性。廣州蛋白質(zhì)棕櫚酰化修飾組學(xué)一般流程

蛋白質(zhì)翻譯后修飾在許多細(xì)胞過程中起著關(guān)鍵作用。南京泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)翻譯后修飾介紹:蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTMs)是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后的化學(xué)修飾過程。蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTMs)通過給蛋白質(zhì)添加磷酸酯,乙酸酯,酰胺基或甲基等官能團增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性,并影響正常細(xì)胞生物學(xué)和發(fā)病機理的幾乎所有方面。蛋白質(zhì)翻譯后修飾在許多細(xì)胞過程中起著關(guān)鍵作用,如細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)降解、信號傳導(dǎo)和調(diào)節(jié)過程、基因表達(dá)調(diào)節(jié)以及蛋白質(zhì)相互作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亞硝基化,甲基化,乙酰化,脂質(zhì)化和蛋白水解。因此,PTM的特征(包括修飾類別和修飾位點)在細(xì)胞生物學(xué)以及疾病診斷和預(yù)防研究中至關(guān)重要。南京泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究