泛素化修飾蛋白質組學：泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽，在真核生物中高度保守，可通過異肽鍵與目標蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標記，泛素用親和標簽（通常為6xHis）進行標記，并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結構，經胰蛋白酶水解后，Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上，使肽的質量增加114，因此可作為泛素定位位點的質量標記。用HPLC對樣品進行預分離，使用針對特定殘留結構的抗體富集泛素化肽，可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯質譜可以鑒定泛素化位點。在早期的研究中，乙酰化修飾一直被認為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾。上海糖基化修飾蛋白質組學質譜鑒定

泛素化修飾蛋白質組學的作用：泛素化、心血管等疾病的發病密切相關。因此，作為近年來生物化學研究的一個重大成果，它已然成為研究、開發新藥物的新靶點。技術原理是首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物，然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進行組分分離以降低樣本復雜程度，然后通過高質量的泛素化修飾抗體和生物材料對修飾肽段進行富集，之后上樣至液相色譜-串聯質譜中進行分析定量。技術優勢：高特異性的修飾抗體；高分辨率、高靈敏度質譜儀；鑒定通量高；可與代謝組學等進行多組學聯合分析。南京蛋白質琥珀酰化修飾組學質譜分析蛋白質的磷酸化修飾是生物體內重要的共價修飾方式之一。

蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題？覆蓋率：覆蓋率越高，檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率：被修飾的蛋白質的百分比低，則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高（> 30％），則有助于識別修飾位點。棕櫚酰化蛋白修飾質譜鑒定方法：S-棕櫚酰化的主要功能是促進蛋白質與細胞膜的結合。蛋白質可以由一個棕櫚酰基組成，也可以與更多棕櫚基或與其他脂質，如豆蔻酰基。由于對S-棕櫚酰化蛋白分析仍然具有挑戰性，由于S-棕櫚酰化修飾蛋白亞水平以及疏水性和潛在不穩定的硫代質鏈的S-脂酰化肽。

乙酰化修飾蛋白組學應用方向有什么？1、基礎醫學、臨床診斷：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治理等；2、生物醫藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發等；3、微生物領域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；4、海洋水產：漁業資源，海水養殖，漁業環境與水產品安全等；5、生物能源、環境科學領域：發酵過程優化，生物燃料生產，環境危定風險評估研究等；6、食品營養：食品儲藏及加工條件優化，食品組分及品質鑒定，功能性食品開發，食品安全監檢測等。糖基化蛋白質翻譯修飾組學主要在復雜的多細胞或組織形成過程中起關鍵作用。

蛋白質乙酰化修飾組學：乙酰化修飾是指在酶或非酶作用下，將乙酰CoA的乙酰基基團轉移至蛋白質氨基酸的殘基上。蛋白質乙酰化也是一種可逆的酶促反應過程。乙酰基轉移酶可以將乙酰基團(CH3C=O)從乙酰輔酶A轉移至蛋白質。同理,去乙酰化酶則可以逆轉這種反應。蛋白質上的賴氨酸乙酰化是細胞內一種重要的PTMs過程。不僅發生在細胞核內組蛋白、轉錄因子等上，在細胞質和線粒體中也存在著諸多蛋白的乙酰化修飾。在植物研究領域內，乙酰化修飾主要參與植物光合作用、生長發育、脅迫響應等過程。在醫學領域，乙酰化修飾可調節人體內某種代謝酶，控制糖尿病，這一發現為糖尿病干預與療理帶來新的希望。泛素化修飾蛋白質組學有些什么？南京蛋白質琥珀酰化修飾組學質譜分析

蛋白質翻譯后修飾幾乎參與了細胞所有正常生命活動的過程。上海糖基化修飾蛋白質組學質譜鑒定

泛素化修飾蛋白組學研究：泛素化修飾蛋白組學是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統介導了真核生物體內80%~85%的蛋白質降解。此外，泛素化修飾還可以直接影響蛋白質的活性和定位，調控包括細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內的多種細胞活動。由于翻譯后修飾的蛋白質在生物樣本中含量低、動態范圍廣，質譜分析前需要對修飾進行富集以提高其豐度，然后利用傳統的定量蛋白組分析手段對富集得到的泛素化肽段樣品進行定量分析。上海糖基化修飾蛋白質組學質譜鑒定