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浙江蛋白質定量組學領域

來源: 發布時間:2022-04-14

定量蛋白質組學的方法學背景意義:從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究,識別功能模塊和路徑,監控疾病的生物標志物,這些研究都需要對蛋白質進行鑒定和定量。生物質譜技術的出現和不斷成熟為蛋白質差異表達分析提供了更可靠、動態范圍更廣的研究手段。近兩年來蛋白質組研究技術已被應用到各種生命科學領域。浙江蛋白質定量組學領域

定量蛋白質組學的方法學背景和意義:從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究,識別功能模塊和路徑,監控疾病的生物標志物,這些研究都需要對蛋白質進行鑒定和定量。生物質譜技術的出現和不斷成熟為蛋白質差異表達分析提供了更可靠、動態范圍更廣的研究手段。基于質譜技術,科學家們不斷開發出新的定量蛋白質組學方法,來了解細胞、組織或生物體的整體蛋白質動力學。浙江蛋白質定量組學領域蛋白質組學技術有飛行時間質譜。

蛋白質組(Proteome)的概念指由一個基因組(genome),或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(Protein).蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變.在轉錄時,一個基因可以多種mRNA形式剪接,并且,同一蛋白可能以許多形式進行翻譯后的修飾.故一個蛋白質組不是一個基因組的直接產物,蛋白質組中蛋白質的數目有時可以超過基因組的數目.蛋白質組學(Proteomics)處于早期“發育”狀態,這個領域的**否認它是單純的方法學,就像基因組學一樣,不是一個封閉的、概念化的穩定的知識體系,而是一個領域.蛋白質組學集中于動態描述基因調節,對基因表達的蛋白質水平進行定量的測定,鑒定疾病、藥物對生命過程的影響,以及解釋基因表達調控的機制.作為一門科學。

蛋白組學技術:蛋白質組學研究的首要任務是建立獲取和分析蛋白質的常規、可靠、有效的技術。為達到這一要求,就需要樣品準備、數據獲取標準化及自動化,也就是要有可重復的高通量的技術。蛋白質組學技術手段在不斷完善,其工作流程,包括蛋白質樣本的制備、分離、定量及鑒定。由雙向凝膠電泳、質譜技術、酵母雙雜交系統、蛋白質微陣列技術、能進行大規模數據處理的計算機系統和軟件、軟電離技術及生物信息學技術構成了蛋白質組學研究的主要技術體系。其中蛋白質組學技術中的質譜技術是現在比較常用的一種蛋白質鑒定技術。蛋白質組學包括翻譯后的修飾。

Labelfree非標記定量蛋白質組學技術特點:(1)不需要標記處理,操作簡單,成本低、實驗周期短;(2)每個樣品單獨處理、上機;(3)可以做任意樣本的總蛋白質差異定量,樣品類型不受限制;(4)對單個樣品的蛋白總量要求相對較低,對于組織本身蛋白量不高,可以選擇Label-Free,適用于一些難收集樣品;(5)定性沒有問題,但是定量的準確性較標記定量稍差,會受到質譜穩定性等因素的影響;(6)適合于大樣本量的定量比較(大于24個樣本)。蛋白質組學在醫學的研究應用:蛋白質組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規律的科學。生物質譜技術是蛋白質組學研究中比較重要的鑒定技術。四川Label free非標記定量蛋白質組學質譜分析

蛋白質組學在醫療和健康方面有什么應用?浙江蛋白質定量組學領域

我們究竟怎么研究蛋白質組學呢?目前高通量檢測蛋白質的方法中,還是首推基于質譜的方法,納流液相可以將復雜樣品中的肽段高效地分離,然后依次進入質譜,對每個被離子化的肽段及其碎裂后碎片的荷質比進行分析,從而得到該肽段的序列信息,然后根據對應的色譜峰面積或者報告離子強度等信息,我們又可以得到該肽段的定量信息。蛋白組學研究怎么做?當下蛋白組學研究中應用比較普遍的技術是同位素標記定量(iTRAQ/TMT技術)。iTRAQ/TMT技術是利用DDA掃描模式,其掃描的方式是將一級質譜信號比較強的Top20的多肽進行二級打碎,然后進入二級質譜進行檢測。其優勢是二級譜圖采集的肽段信息都來源于同一條多肽,有利于后續的定性分析。浙江蛋白質定量組學領域