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廣州轉錄組學領域

來源: 發布時間:2022-04-11

轉錄組學(transcriptomics)是功能基因組學(FunctionalGenomics)研究的重要組成部分,是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉錄及轉錄調控規律的學科。隨著人類基因組計劃HGP(HumanGenomeProject)的完成,科學家也逐漸認識到對基因結構序列的研究只是基因組學研究的一部分,并不能揭示所有的生命奧秘,所以接下來需要解決的問題是:研究這些基因序列的功能、參與的生命過程、表達調控方式,以及這些基因在不同的時空條件下的表達差異等。這些問題都需要功能基因組學技術來解決,而轉錄組學技術是功能基因組學研究的重要組成部分。對基因及其轉錄表達產物功能研究的功能基因組學,將為疾病控制和新藥開發、作物和畜禽品種的改良提供新思路,為人類解決健康問題、食物問題、能源問題和環境問題提供新方法。轉錄學組測序能夠提供更準確的數字化信號。廣州轉錄組學領域

普通轉錄組學測序適用于哪些情況?普通轉錄組測序主要適用于兩大類:一是不同的生長階段或者發育過程;二是不同的環境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。轉錄組學測序必須做生物學重復么?需要幾個重復?生物學重復是生物實驗所必須的,轉錄組測序也不例外,至少3次生物學重復。準備生物重復樣品時,通過對實驗的預先設計和控制,盡可能將與實驗處理無關的背景條件控制在同一水平,減少批次效應對結果的影響。轉錄組學測序可以同時測到mRNA、lncRNA、micRNA以及circRNA么?我們通常所講的轉錄組測序只能測到mRNA。但是全轉錄組測序通過構建兩個測序文庫(一是小RNA測序文庫、二是lncRNA測序文庫)是可以測到以上4種RNA的。杭州circ RNA轉錄組學分析轉錄組學是一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調控規律的學科。

轉錄組學,基因組學,蛋白質組學的區別:蛋白組學針對的是全體蛋白,組要以2D-Gel和質譜為主,分為top-down和bottom-up分析方法。理念和基因組類似,將蛋白用特定的物料化學手段分解成小肽段,在通過質量反推蛋白序列,之后進行搜索,標識已知未知的蛋白序列。轉錄組學研究的是某個時間點的mRNA總和,可以用芯片,也可以用測序。芯片是用已知的基因探針,測序則有可能發現新的mRNA。基因組學研究的主要是基因組DNA,使用方法目前以二代測序為主,將基因組拆成小片段后再用生物信息學算法進行迭代組裝。當然這只是第1步,隨后還有繁瑣的基因注釋等數據分析工作。

宏轉錄組學適用范圍包括人體微生態、環境、工業、農業等領域。宏轉錄組學以生態環境中的全部RNA為研究對象,避開了微生物分離培養困難的問題,能有效的擴展微生物資源的利用空間。應用領域:包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物。宏轉錄學組的概念:宏轉錄組是特定時期、環境樣本、組織樣本中所有的微生物的RNA(轉錄本)的匯合。通過對這些轉錄本進行大規模高通量測序,可以直接獲得環境中可培養和不可培養的微生物轉錄組信息。轉錄組學為什么原核物種只能做有參轉錄組分析?

單細胞轉錄組學技術:單細胞轉錄組目前主要有三種方法:SMART擴增技術、10×genomics技術及Andeplete技術。SMART擴增技術比較關鍵的技術,就是設計了2個特殊的引物。再配合用MMLV逆轉錄酶進行逆轉錄。特殊引物1由中間PolyT序列加上一段通用序列及3’末端兩個簡并堿基構成,但在PolyT的3’端倒數第二個堿基是A、C、G而非T的簡并堿基,而倒數第1個為簡并堿基,這樣做的好處是讓它正好結合在mRNA的3’端連到Poly(A)尾巴的這個連接處,而不會結合到mRNA的別的地方。這樣就保證了逆轉錄的起始位置正好是mRNA的3’端的序列終止位置。轉錄學組測序能夠提供更高的檢測通量。南京circ RNA轉錄組學檢測多少錢

轉錄組學可應用于植物生長機制的發現及干預。廣州轉錄組學領域

什么叫轉錄組轉錄組學?1、轉錄組,廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的組合,包括信使RNA、核糖體RNA、轉運RNA及非編碼RNA;狹義上指所有mRNA的組合。2、轉錄組學,是指一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調控規律的學科。轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。轉錄組即一個活細胞所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。以DNA為模板合成RNA的轉錄過程是基因表達的第一步,也是基因表達調控的關鍵環節。廣州轉錄組學領域