代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些?代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(分子量<1000)。其樣品主要是血漿或血清,尿液,唾液,以及細胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位(如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫院等)合作,做過植物,微生物提取物,腦脊液,昆蟲血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,胎盤,糞便及腸道內容物提取液等。一般代謝組學能檢測出多少物質?不同的質譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣,而且不同平臺之間具有互補性。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準確定性的物質約200個左右,檢測尿液樣品定性的物質約200個左右,其他樣品(如肝臟,糞便,腸道內容物)也在幾百這個數量級。代謝組學主要技術手段是色譜(HPLC,GC)。山東動物靶向代謝組學分析研究
為什么選擇代謝組學作為科研技術手段?1)小分子的產生和代謝是生物機體作用的結果,生物體液的代謝產物分析能夠更直接,更準確的反映生物體的病理生理狀態。2)基因和蛋白質表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易;3)代謝組學的代謝物信息庫簡單,但它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數據庫那么復雜;4)代謝物的種類少,要遠小于基因和蛋白質的數據,物質的分子結構要簡單得多。5)代謝產物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學研究中采用的技術更容易在各個領域中通用,也更容易被人接受。杭州個性化定制靶向代謝組學定量分析代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。
代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質組學相比, 代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規律,目前據此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰,研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產物發生相應的改變,通過對某些代謝產物進行分析,并與 正常人的代謝產物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。
代謝組學的概念:代謝組學的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內所有的低分子量代謝產物,代謝組學則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內所有低分子量代謝產物同時進行定性和定量分析的一門新學科。它是以組群指標分析為基礎,以高通量檢測和數據處理為手段,以信息建模與系統整合為目標的系統生物學的一個分支。 代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(MW<1000)。 在食品安全領域,利用代謝組學工具發現農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。其樣品主要是動植物的細胞和組織的提取液。主要技術手段是核磁共振,質譜,色譜,其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,再結合模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態,并有可能找出與之相關的生物標志物。為相關預警信號提供一個預知平臺。選擇代謝組學作為科研技術手段的優勢有哪些?
靶向代謝組學分析成功的關鍵因素是準確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學鑒定一般采用 GC/MS 系統的選擇性離子監測 (SIM),或在三重串聯四極桿 LC/MS 系統上用多反應離子監測 (MRM) 進行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,在單四極桿質譜中,這種靈敏度增強的原因是延長了所選擇離子的采集時間。因為監測的是一個很小的質量窗口,所以質量色譜圖只表示對極為特定質量的檢測。在大多數情況下,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進行質譜定量的選擇方法,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異。可以產生獨特的碎片離子,可對非常復雜基質中的目標化合物進行監測和定量。代謝組學的研究介于基因、蛋白質和細胞、組織之間。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學費用
代謝組學是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產物進行定性和定量分析的一門新學科。山東動物靶向代謝組學分析研究
代謝組學有哪些特點?(1) 代謝處于系統生物學的末端,更能反映基因與外部環境互作的真實情況,因此,在多數生物表型研究上更加適用。(2) 常規代謝組學只關注內源性化合物,也有使用代謝組學技術測定外源性化合物的。內源性化合物的上調和下調指示了與疾病、毒性、基因修飾或環境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 內源性化合物的結果可以作為疾病的診斷、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標志物。謝組學通過揭示內在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發展過程。山東動物靶向代謝組學分析研究