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貴陽RNA轉錄組學技術分析

來源: 發布時間:2022-04-06

轉錄組學測序比其他研究方法有哪些優勢?轉錄組學測序具有以下優勢:(1)可以直接測定每個轉錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度,同時不存在傳統微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題;(2)靈敏度高,可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本;(3)可以對任意物種進行全基因組分析,無需預先設計特異性探針,因此無需了解物種基因信息,能夠直接對任何物種進行轉錄組分析,同時能夠檢測未知基因,發現新的轉錄本,并準確地識別可變剪切位點及cSNP,UTR區域。(4)檢測范圍廣,高于6個數量級的動態檢測范圍,能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。轉錄組學能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。貴陽RNA轉錄組學技術分析

轉錄組學(Transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的匯合,包括信使RNA(mRNA)、核糖體RNA(rRNA)、轉運RNA(tRNA)及非編碼RNA(ncRNA);狹義上指所有mRNA的匯合。轉錄組具有很強的時間和空間特性,是基因功能及結構研究的基礎和出發點,掌握了生物個體基因轉錄水平的變化,可深入了解其生命活動特征和調控機制。通過新一代高通量測序,能夠全方面快速地獲得某一物種特定組織在某一狀態下的幾乎所有轉錄本的基因序列信息。貴陽RNA轉錄組學技術分析轉錄組學可以在單核苷酸水平對任意物種的整體轉錄活動進行檢測。

circRNA轉錄組學成環機制:circRNA環化方式分為內含子環化和外顯子環化。目前主流的成環機制可歸類為:依賴于剪切體的索尾插接環化。在mRNA前體上,通過連續的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點連接到上游的3′受體的位點,索尾插接形成環化,然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進circRNA形成。部分circRNA外顯子兩側的內含子中含有反向互補序列,首先在剪切位點上并排形成RNA雙鏈體,再通過可變剪切形成帶內含子和不帶內含子兩種不同的circRNA。或者外顯子內部以及兩側的內含子可以競爭進行RNA配對,然后通過可變剪切形成不同類型的circRNA。

轉錄組學應用領域:農林領域:生長發育機制,抗逆脅迫機制,育種,物種保護研究等;畜牧業:生長發育機制,致病機理研究,肉類及乳制品品質研究等;海洋水產:生長發育機制,漁業資源,漁業環境與水產品安全等;微生物:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;生物醫藥:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,藥物開發,個性化醫治等;環境科學:發酵過程優化,生物燃料生產,環境危害風險評估研究等;食品科學:食品儲藏及加工條件優化,食品組分及品質鑒定,功能性食品開發,食品安全監檢測等。RNA-Seq轉錄組學有著巨大的應用前景。

什么叫轉錄組學?廣義轉錄組是指生命單元(通常是一種細胞)中所有按基因信息單元轉錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個特定細胞所有轉錄本的總和.它的研究對象就是這些RNA與蛋白質分子和它們所組成的基因功能網絡以及它們與細胞功能的關系.而狹義轉錄組是指可直接參與翻譯蛋白質的mRNA總和.研究生物細胞中轉錄組的發生和變化規律的科學就稱為轉錄組學(tran—scriptomics)。轉錄組學即特定細胞在某一功能狀態下轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組學能準確地識別可變剪切位點及cSNP,UTR區域。全長轉錄學組研究方法

轉錄組學測序樣品純度要求,電泳檢測28S:18S至少大于1.8。貴陽RNA轉錄組學技術分析

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