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杭州定量N糖基化蛋白質(zhì)組學分析方法

來源: 發(fā)布時間:2022-04-04

定量蛋白質(zhì)組學的方法學背景和意義:從生命活動的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織中含有蛋白質(zhì)種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質(zhì)表達水平變化的研究,識別功能模塊和路徑,監(jiān)控疾病的生物標志物,這些研究都需要對蛋白質(zhì)進行鑒定和定量。生物質(zhì)譜技術的出現(xiàn)和不斷成熟為蛋白質(zhì)差異表達分析提供了更可靠、動態(tài)范圍更廣的研究手段。基于質(zhì)譜技術,科學家們不斷開發(fā)出新的定量蛋白質(zhì)組學方法,來了解細胞、組織或生物體的整體蛋白質(zhì)動力學。蛋白質(zhì)組學包括翻譯后的修飾。杭州定量N糖基化蛋白質(zhì)組學分析方法

蛋白組學技術:蛋白質(zhì)組學研究的首要任務是建立獲取和分析蛋白質(zhì)的常規(guī)、可靠、有效的技術。為達到這一要求,就需要樣品準備、數(shù)據(jù)獲取標準化及自動化,也就是要有可重復的高通量的技術。蛋白質(zhì)組學技術手段在不斷完善,其工作流程,包括蛋白質(zhì)樣本的制備、分離、定量及鑒定。由雙向凝膠電泳、質(zhì)譜技術、酵母雙雜交系統(tǒng)、蛋白質(zhì)微陣列技術、能進行大規(guī)模數(shù)據(jù)處理的計算機系統(tǒng)和軟件、軟電離技術及生物信息學技術構(gòu)成了蛋白質(zhì)組學研究的主要技術體系。其中蛋白質(zhì)組學技術中的質(zhì)譜技術是現(xiàn)在比較常用的一種蛋白質(zhì)鑒定技術。河南4D定量蛋白質(zhì)組學分析價格生物質(zhì)譜技術是蛋白質(zhì)組學研究中比較重要的鑒定技術。

蛋白質(zhì)組學在醫(yī)學的研究應用:蛋白質(zhì)組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學,包括對蛋白質(zhì)表達模式和蛋白質(zhì)組功能模式的研究。蛋白質(zhì)組學的發(fā)展對尋找疾病的診斷標志、篩選藥物靶點、毒理學研究等有重要意義,也因此被普遍應用于醫(yī)學研究。蛋白質(zhì)組學研究,總體可分為一下幾個步驟:(1)差異篩選(Discovery)(2)初步驗證(Verification)(3)然后確診(Validation)。基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,當前在醫(yī)療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學。

PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學分析流程是怎樣的?要做PRM首先要明確目標蛋白(或多肽)是什么,設計和建立針對這些目標蛋白PRM質(zhì)譜采集方法,然后對待測樣品進行PRM數(shù)據(jù)采集,將得到的原始譜圖數(shù)據(jù)導入分析軟件提取子離子信息進行定量。另外,如果配制已知濃度的標準肽段,用PRM額外做一個標準曲線,即可實現(xiàn)一定的定量。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學技術能應用到哪些方面?研究工作中涉及到蛋白或多肽定量的都可以通過PRM技術來實現(xiàn)。具體說來,比如驗證定量蛋白質(zhì)組學中某些蛋白的變化,多肽的相對和一定的定量,想做蛋白定量卻沒有抗體,針對蛋白修飾位點的定量,想同時定量多個蛋白的情況等,都可以用PRM來做。蛋白質(zhì)組學技術有電噴霧質(zhì)譜。

蛋白質(zhì)組學技術:生物質(zhì)譜:生物質(zhì)譜技術是蛋白質(zhì)組學研究中比較重要的鑒定技術,其基本原理是樣品分子離子化后,根據(jù)不同離子之間的荷質(zhì)比(M/E)的差異來分離并確定分子量。對于經(jīng)過雙向電泳分離的目標蛋白質(zhì)用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵)成肽段,對這些肽段用質(zhì)譜進行鑒定與分析。目前常用的質(zhì)譜包括兩種:基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)和電噴霧質(zhì)譜(ESI-MS)。蛋白質(zhì)組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別。山東蛋白質(zhì)定量組學一般流程

蛋白質(zhì)組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。杭州定量N糖基化蛋白質(zhì)組學分析方法

PRM靶向蛋白質(zhì)組學:是一種基于Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術,首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力,用Q1選擇目標肽段的母離子,隨后在collisioncell中對母離子進行碎裂,然后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣能夠?qū)δ繕说鞍踪|(zhì)、目標肽段(如發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進行選擇性檢測,即可對目標蛋白質(zhì)/肽段進行相對(一定)定量。從而實現(xiàn)對復雜樣本中的目標蛋白質(zhì)/肽段進行準確地特異性分析。杭州定量N糖基化蛋白質(zhì)組學分析方法

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