質譜分析蛋白翻譯后修飾：相對于蛋白質印跡等技術，質譜技術能更有效的對蛋白質的翻譯后修飾進行分析，且可以對常規的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進行補充。質譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質譜方法無法保證可以完全識別目的蛋白的特定翻譯后修飾，因為質譜是通過蛋白質序列內的多個肽段來鑒定的，這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識別的機會。一種提高質譜儀檢測到修飾肽段數量的策略是使用PTM親和試劑進行肽段富集，而不是使用PTM親和試劑進行蛋白富集，這將減少富集的未修飾肽段的數量。蛋白質磷酸化修飾組學具有全方面性。四川蛋白質翻譯后修飾組學一般流程

蛋白翻譯后修飾組學技術在準確醫學中的應用：盡管目前大數據的獲得會采用基因組學和轉錄組學，但是關鍵的發現還是依賴蛋白質組數據而得到的。近來越來越多的研究表明蛋白組學驅動的準確的醫學具有極大的實用性和普適性，蛋白組學的研究更加速了臨床轉化的進程。蛋白翻譯后修飾（post-ranslational modification, PTM)賦予了蛋白種類的豐富性及蛋白功能的多樣化，研究蛋白翻譯后修飾不只可以確定蛋白修飾（磷酸化、泛素化、?；?、甲基化、SUMO化等）或蛋白酶裂解的新位點，還可以發現生物標記物及探索藥物/化學調節物的作用機制。南京蛋白質丙?；揎椊M學價錢質譜是蛋白質翻譯后修飾檢測的常用技術之一。

蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略：自中而下：自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法，分析組蛋白時其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時，通常需要將被檢測蛋白質消化成3-9kDa范圍內的肽段，因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是，由于儀器的進步和保留了組蛋白尾部的組合修飾，自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下：自上而下技術可以直接對完整的蛋白質進行測序，包括翻譯后修飾的蛋白質和其他大的蛋白質片段，而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關的信息，使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。自上而下技術對蛋白質的有效分辨率已達到229kDa，一次可以檢測到的蛋白質數量也在增加。

蛋白質-蛋白質相互作用是蛋白質發揮功能的主要機制之一,在DNA損傷修復,自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導致疾病的發生.在蛋白質的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發生甲基化,乙?；?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質的電性,疏水性和空間結構等屬性,為與之結合的蛋白提供結合的錨定或產生位阻效應,像一把開關在時空上精確調控蛋白質-蛋白質相互作用的發生以及動態變化.結構研究表明,蛋白質之間的相互作用通常由臨近的幾個氨基酸殘基直接結合,替換該區域的氨基酸殘基,通常能破壞結合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對性地開發和設計抑制劑,用于疾病的診療。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。

蛋白質翻譯后修飾的檢測方法：質譜是蛋白質翻譯后修飾檢測的常用技術之一，可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。蛋白質翻譯后修飾（post-translational modifications，PTMs），如磷酸化、乙?；⒎核鼗UMO化、糖基化等，大幅度的增加了蛋白質組的復雜性。檢測蛋白質的翻譯后修飾，了解它們如何工作、影響蛋白質組和調控基因組將極大地提高我們對遺傳學和表觀遺傳學的理解。目標蛋白的PTMs研究通常需要一個富集步驟，因為修飾蛋白的豐度一般較低。大多數PTMs檢測方法都是結合富集策略開發的，以比較好的識別、驗證和研究目標蛋白中PTMs的功能。自中而下的蛋白質組學技術可用于組蛋白修飾的分析。湖北蛋白質糖基化修飾組學分析

蛋白質的磷酸化修飾是生物體內重要的共價修飾方式之一。四川蛋白質翻譯后修飾組學一般流程

蛋白質乙?；揎椊M學技術：乙酰化修飾是體內保守的可逆轉的蛋白修飾，對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙?；揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調節。采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙酰化鑒定的影響，再結合免疫共沉淀通過抗體富集乙?；碾亩?，從而實現乙?；蔫b定及定量。樣品要求：1、SDS-PAGE條帶：5個以上可見考染條帶。2、溶液（目標蛋白質）：目標蛋白總量>50μg，目標蛋白濃度>80%。3、溶液（大規模混合蛋白質）：蛋白總量>1mg，蛋白濃度>1μg/μl。四川蛋白質翻譯后修飾組學一般流程

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