蛋白質磷酸化修飾鑒定方法:質譜鑒定法:在質譜分析中,先使試樣中各組分電離生成不同荷質比的離子,然后經加速電場的作用,生成離子束,進入質量分析器。在質量分析器中,在磁場的作用下,質荷比相同的離子會被聚焦到同一點上,不同質荷比的離子聚焦于不同點上,因此獲得區分不同質荷比離子的質譜圖。與未經修飾的肽段相比,磷酸基團修飾的肽段在相對分子質量上就會增加79.983,由此在質譜圖中能夠與未修飾肽段進行區分。固相金屬離子親和色譜利用的是磷酸基團與固相化的金屬離子有高親和力,可有效吸附磷酸化基團,從而達到富集磷酸化肽段的效果。鰲合底物上的金屬離子通常是Fe3+或Ga3+,可以選擇性地與磷酸化肽中的磷酸部分相結合,并且在高pH或磷酸緩沖液中磷酸化肽可以釋放出來。但是這個方法不能夠有效富集不與IMAC結合的磷酸化肽段。蛋白質磷酸化修飾組學具有探索性。上海蛋白質琥珀酰化修飾組學費用
翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質翻譯后修飾是影響蛋白質功能并調節整個細胞過程的重要方式,幾乎在每個細胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質對揭示蛋白質的功能和深入了解各種生理現象具有重要意義。大多數翻譯后修飾蛋白以低化學計量和豐度存在,這限制了在分析全細胞裂解液時對其的檢測。因此,要在蛋白質組學的范圍內表征翻譯后修飾蛋白,純化方法是必要的,以分離修飾蛋白和肽段,然后再進行后續分析。后續分析一般采用質譜技術進行,可以對翻譯后修飾蛋白組進行定性和定量研究。上海蛋白質琥珀酰化修飾組學費用乙酰化修飾是體內高度保守的可逆轉的蛋白修飾。
蛋白質翻譯后修飾的檢測方法:質譜是蛋白質翻譯后修飾檢測的常用技術之一,可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。蛋白質翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs),如磷酸化、乙酰化、泛素化、SUMO化、糖基化等,大幅度的增加了蛋白質組的復雜性。檢測蛋白質的翻譯后修飾,了解它們如何工作、影響蛋白質組和調控基因組將極大地提高我們對遺傳學和表觀遺傳學的理解。目標蛋白的PTMs研究通常需要一個富集步驟,因為修飾蛋白的豐度一般較低。大多數PTMs檢測方法都是結合富集策略開發的,以比較好的識別、驗證和研究目標蛋白中PTMs的功能。
蛋白磷酸化檢測方法:一、Western Blot檢測方法優勢:1. WB方法簡便,多數實驗室具備Western Blot設備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏,能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白,可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集,再進行WB檢測被磷酸化的蛋白,檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質譜檢測方法:Western Blot的方法雖然簡便,但是對于大規模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質譜儀,如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠,或者2D-PAGE膠等分離目標蛋白,將含有目標蛋白的條帶切下,胰酶消化,LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標蛋白的磷酸化水平。目前對乙酰化修飾的功能研究主要集中在對細胞轉錄調控,以及對代謝通路的調控這兩個方面。
蛋白質翻譯后修飾組學:翻譯后修飾自下而上分析策略:自下而上蛋白質組學是一種基于肽段分析的技術。對于不同類型的翻譯后修飾,具體的分析策略存在差異。蛋白質的糖基化具有異質性。不同的糖鏈可以連接到同一位點上,不同位點可以連接到同一蛋白質上的不同糖鏈上。糖基化的異質性嚴重阻礙了糖蛋白的分離和分析。不同糖類型的相同蛋白質,在電泳上會出現分散的條帶,導致信號分散。此外,對低豐度蛋白質的識別性差導致糖蛋白在色譜圖中分離不佳,質譜中有一簇分子量不準確的分辨不清的峰。目前,蛋白糖基化研究的主要策略是利用現有的技術體系對糖基化蛋白的糖基化肽段進行分離和富集,消除糖基化的異質性及其對質譜的影響,標記糖基化位點。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。上海蛋白質琥珀酰化修飾組學費用
蛋白質修飾可檢測修飾類型有磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化。上海蛋白質琥珀酰化修飾組學費用
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