蛋白質翻譯后修飾:蛋白質的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質與底物蛋白質上特定的氨基酸結合,調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。各種蛋白質翻譯后修飾在信號通路和網絡中發揮著重要的作用,翻譯后修飾系統的紊亂將導致一系列疾病的發生。通過實驗的方法鑒定蛋白質翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間,并且酶反應的優化常常難以實現。而計算的方法則能夠快速、準確的預測酶特異性的底物蛋白質及其修飾位點。蛋白質磷酸化修飾組學具有有效性。哈爾濱蛋白質丙二酰化修飾組學分析
蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略:目前,有幾種分析蛋白質翻譯后修飾的策略,包括質譜(MS)、Eastern blotting、放射性標記和Western blotting。放射性標記和Western blotting是比較傳統、特異性和相對定量的方法。該過程需要事先知道翻譯后修飾類型。局限性包括抗體的特異性和可用性。質譜技術也常被用于翻譯后修飾分析,不受修飾類型和相關修飾位點的現有知識的限制。自下而上:自下而上的技術是蛋白質組學研究中使用的質譜策略之一。在根據序列鑒定肽之前,需要使用蛋白酶消化蛋白質。由于該技術不能保證在檢測過程中被檢測肽的完整性和穩定性,因此無法獲得不同蛋白質翻譯后修飾之間關系的信息,這意味著它無法檢測到某些修飾。因此,該方法不適用于分析組蛋白的組合翻譯后修飾。湖北蛋白質糖基化修飾組學質譜鑒定乙酰化修飾是體內保守的可逆轉的蛋白修飾。
乙酰化修飾蛋白質組學分析:乙酰化修飾蛋白質組學分析是指從蛋白質組學的水平分析蛋白質乙酰化修飾,包括乙酰化蛋白質的鑒定和定量。提供基于質譜的乙酰化蛋白組研究服務。蛋白質乙酰化包括組蛋白乙酰化和非組蛋白乙酰化。組蛋白乙酰化主要是賴氨酸乙酰化,已在基因轉錄調控作用方面被普遍的研究。非組蛋白乙酰化構成了哺乳動物細胞中乙酰化蛋白的主要部分,參與了所有主要生物過程,包括蛋白質的定位、轉移、功能和降解,遺傳物質的轉錄和復制等。除了重要的生物學功能以外,乙酰化蛋白質及其調控酶還與衰老和多種疾病(如神經變形紊亂、心血管疾病等)緊密相關。因此,對乙酰化修飾蛋白質組進行研究有助于進一步探索細胞的生命活動與了解相關疾病的發病機制。
蛋白磷酸化檢測方法:質譜檢測方法優勢:1. 準確度高,能夠同時檢測多個蛋白的多個磷酸化位點。2. 適用于大規模分析蛋白磷酸化水平。3. 不依賴于磷酸化抗體。在實際應用中,Western Blot與質譜分析方法各有各的好,誰也無法完全被另一種方法所替代。所以在選擇測定磷酸化修飾的時候還應該根據具體需要來決定。如果研究的蛋白正好有商業化的磷酸化抗體,那么lucky you,你可以選擇Western Blot進行快速磷酸化測定研究。但是如果你所研究的蛋白質沒有可用的商業化磷酸抗體,或是抗體價效過低,亦或是需要大規模地檢測細胞內磷酸化蛋白的水平的話,質譜檢測會是更好地選擇。質譜可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。
蛋白質翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質組研究的大部分工作集中在細胞生長的不同時期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質表達水平的變化。然而,許多生命過程不只受蛋白質的相對豐度控制,還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此,揭示翻譯后修飾的規律是了解蛋白質復雜性和多樣的生物學功能的前提。蛋白質的翻譯后修飾是一個復雜的過程。目前,發現的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。樣品中翻譯后修飾蛋白質含量低、動態范圍廣給相關研究帶來了很大的挑戰。基于翻譯后修飾蛋白的異質性和相對豐度低的特點,主要利用凝膠、生物質譜和生物信息學工具對其進行研究。用于PTM分析的質譜方法類似于用于“常規”蛋白質鑒定的方法,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白質組學分析。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的功能。杭州蛋白質丙二酰化修飾組學主要技術
在早期的研究中,乙酰化修飾一直被認為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾。哈爾濱蛋白質丙二酰化修飾組學分析
蛋白質磷酸化修飾鑒定方法:質譜鑒定法:在質譜分析中,先使試樣中各組分電離生成不同荷質比的離子,然后經加速電場的作用,生成離子束,進入質量分析器。在質量分析器中,在磁場的作用下,質荷比相同的離子會被聚焦到同一點上,不同質荷比的離子聚焦于不同點上,因此獲得區分不同質荷比離子的質譜圖。與未經修飾的肽段相比,磷酸基團修飾的肽段在相對分子質量上就會增加79.983,由此在質譜圖中能夠與未修飾肽段進行區分。固相金屬離子親和色譜利用的是磷酸基團與固相化的金屬離子有高親和力,可有效吸附磷酸化基團,從而達到富集磷酸化肽段的效果。鰲合底物上的金屬離子通常是Fe3+或Ga3+,可以選擇性地與磷酸化肽中的磷酸部分相結合,并且在高pH或磷酸緩沖液中磷酸化肽可以釋放出來。但是這個方法不能夠有效富集不與IMAC結合的磷酸化肽段。哈爾濱蛋白質丙二酰化修飾組學分析
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