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蛋白質泛素化修飾組學鑒定

來源: 發(fā)布時間:2022-03-31

蛋白質乙酰化修飾的功能:目前對乙酰化修飾的功能研究主要集中在對細胞轉錄調控,以及對代謝通路的調控這兩個方面。在眾多乙酰化修飾的蛋白質中,研究較多的要數(shù)細胞核中包圍DNA的組蛋白了。組蛋白和DNA纏繞構成核小體,組蛋白的甲基化、乙酰化修飾能夠調節(jié)DNA纏繞的松緊度,從而對基因表達進行調控,因此,組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學研究中的重要一環(huán)。另外,研究也發(fā)現(xiàn)乙酰化修飾普遍存在于人的多種代謝酶之中,并且參與調控代謝通路以及代謝酶的活性。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙酰化。蛋白質翻譯后修飾有什么生物學意義?蛋白質泛素化修飾組學鑒定

蛋白磷酸化檢測方法:質譜檢測方法優(yōu)勢:1. 準確度高,能夠同時檢測多個蛋白的多個磷酸化位點。2. 適用于大規(guī)模分析蛋白磷酸化水平。3. 不依賴于磷酸化抗體。在實際應用中,Western Blot與質譜分析方法各有各的好,誰也無法完全被另一種方法所替代。所以在選擇測定磷酸化修飾的時候還應該根據(jù)具體需要來決定。如果研究的蛋白正好有商業(yè)化的磷酸化抗體,那么lucky you,你可以選擇Western Blot進行快速磷酸化測定研究。但是如果你所研究的蛋白質沒有可用的商業(yè)化磷酸抗體,或是抗體價效過低,亦或是需要大規(guī)模地檢測細胞內磷酸化蛋白的水平的話,質譜檢測會是更好地選擇。四川琥珀酰化修飾蛋白質組學質譜分析質譜是蛋白質翻譯后修飾檢測的常用技術之一。

蛋白翻譯后修飾組學技術在準確醫(yī)學中的應用:盡管目前大數(shù)據(jù)的獲得會采用基因組學和轉錄組學,但是關鍵的發(fā)現(xiàn)還是依賴蛋白質組數(shù)據(jù)而得到的。近來越來越多的研究表明蛋白組學驅動的準確的醫(yī)學具有極大的實用性和普適性,蛋白組學的研究更加速了臨床轉化的進程。蛋白翻譯后修飾(post-ranslational modification, PTM)賦予了蛋白種類的豐富性及蛋白功能的多樣化,研究蛋白翻譯后修飾不只可以確定蛋白修飾(磷酸化、泛素化、酰化、甲基化、SUMO化等)或蛋白酶裂解的新位點,還可以發(fā)現(xiàn)生物標記物及探索藥物/化學調節(jié)物的作用機制。

蛋白質-蛋白質相互作用是蛋白質發(fā)揮功能的主要機制之一,在DNA損傷修復,自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導致疾病的發(fā)生.在蛋白質的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙酰化,磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質的電性,疏水性和空間結構等屬性,為與之結合的蛋白提供結合的錨定或產生位阻效應,像一把開關在時空上精確調控蛋白質-蛋白質相互作用的發(fā)生以及動態(tài)變化.結構研究表明,蛋白質之間的相互作用通常由臨近的幾個氨基酸殘基直接結合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對性地開發(fā)和設計抑制劑,用于疾病的診療。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的定位。

翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質翻譯后修飾是影響蛋白質功能并調節(jié)整個細胞過程的重要方式,幾乎在每個細胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質對揭示蛋白質的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學計量和豐度存在,這限制了在分析全細胞裂解液時對其的檢測。因此,要在蛋白質組學的范圍內表征翻譯后修飾蛋白,純化方法是必要的,以分離修飾蛋白和肽段,然后再進行后續(xù)分析。后續(xù)分析一般采用質譜技術進行,可以對翻譯后修飾蛋白組進行定性和定量研究。乙酰化修飾是體內高度保守的可逆轉的蛋白修飾。湖北蛋白質丙酰化修飾組學分析研究

蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題?蛋白質泛素化修飾組學鑒定

蛋白質翻譯后修飾:蛋白質的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質與底物蛋白質上特定的氨基酸結合,調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。各種蛋白質翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡中發(fā)揮著重要的作用,翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導致一系列疾病的發(fā)生。通過實驗的方法鑒定蛋白質翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間,并且酶反應的優(yōu)化常常難以實現(xiàn)。而計算的方法則能夠快速、準確的預測酶特異性的底物蛋白質及其修飾位點。蛋白質泛素化修飾組學鑒定

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