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非靶向代謝組學應用

來源: 發布時間:2022-03-29

代謝組學在系統生物學中有什么作用?它的地位如何?代謝物作為生物體表型的基礎能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現象揭示生命本質。代謝組學本質上是指從整體上研究生物體的代謝物,是對某一生物、組織或細胞中的所有低分子量代謝產物進行定性與定量分析的一門科學。代謝組學以指標分析為基礎,高通量檢測為手段,通過研究生物體內代謝物的種類與數量及其變化規律來闡述機體在正常生命狀態及環境變化后的代謝過程。代謝組是系統生物學的分支學科之一。其研究內容主要包括對代謝物進行定性或定量分析,不同基因型的生物體進行代謝組學表型研究,不同生長環境及加物理、化學或生物性刺激后個體代謝產物的應答,進行代謝途徑或代謝網絡解析與轉基因評價。代謝組學著重研究的是生物整體、組織代謝途徑及其所受內在或者外在因素的影響及隨時間變化的規律。非靶向代謝組學應用

代謝組學發展至今,代謝組學技術已經遠遠超出了標準臨床化學技術的范圍,能夠精確分析數百至數千種代謝物。代謝組學提供了代謝表型的詳細表征,并可以在許多水平上進行精密醫學研究,包括表征疾病基礎的代謝紊亂,發現新的治靶標以及發現可用于診斷疾病或監測藥物的活性。比較常見的代謝組學分析方法是質譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質譜技術又分為LC-MS和GC-MS。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發生電離,生成不同荷質比的帶電荷的離子,經加速電場的作用,形成離子束,進入質量分析器。山東靶向代謝組學代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。

代謝組學的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標分子。傳統代謝組學研究利用的是GC-MS,因為代謝物大多數都不是高沸點的,而且GC-MS有龐大的數據庫檢索。然后發展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點物質難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學不是很多,一方面是NMR這個東西入行起點有點高,另一方面是樣品太復雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單,無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質結構的指認要比MS更精確(比如異構體)因此對定性非常有用,成為非靶向代謝組學的重要方法。

代謝組學比較常用到的數據分析方法:代謝組學分析數據用于統計分析時,數據集通常為一個N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個樣本數,每一行表示一個樣品, K表示K個變量,每一列表示一個變量,在代謝組學中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個變量,不考慮多個變量的相互作用與內在聯系。具有簡單性、易應用性和可解釋性。但是無法基于整體數據對所測樣品的優劣、差異進行綜合評價和分析。差異倍數變化大小(Fold Change,FC)表示實驗組與對照組的含量比值,可以快速考察各個代謝物在不同組別之間的含量變化大小。代謝組學的研究介于基因、蛋白質和細胞、組織之間。

代謝組學概念:代謝組學(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學和蛋白質組學的研究思想,對生物體內所有代謝物進行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關系的研究方式,是系統生物學的組成部分。其研究對象大都是相對分子質量1000以內的小分子物質。先進分析檢測技術結合模式識別和**系統等計算分析方法是代謝組學研究的基本方法。 代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發展起來的一門學科,是系統生物學的重要組成部分。基因組學和蛋白質組學分別從基因和蛋白質層面探尋生命的活動,而實際上細胞內許多生命活動是發生在代謝物層面的,如細胞信號釋放(cell signaling),能量傳遞,細胞間通信等都是受代謝物調控的。代謝組學正是研究代謝組(metabolome)——在某一時刻細胞內所有代謝物的組合——的一門學科。靶向代謝組學(Trgeted metabolomics)則為目標性代謝組學。杭州常規靶向代謝組學檢測多少錢

代謝組學技術可應用于藥物毒理學。非靶向代謝組學應用

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